公开(公告)号：CN112522401A

公开(公告)日：2021-03-19

申请号：CN202011280716.3

申请日：2020-11-16

Applicant: 北京大学人民医院

Inventor： 陈红松 ,  房琼璇 ,  陈冬波 ,  邓康健 ,  廖维甲 ,  谢兴旺 ,  陈谱

IPC: C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了TOX3基因过表达作为肝癌预后标志物中的应用。本发明利用全基因组CRISPR激活文库筛选发现TOX3可以抑制检查点抑制剂CD155的表达。进一步利用TCGA肝癌RNA‑seq数据进行免疫浸润分析，发现TOX3的表达水平与肝癌组织中NK细胞的浸润频率显著正相关，结合CD155对NK细胞的抑制作用，进一步提示TOX3可能通过抑制CD155激活NK细胞，从而有利于肝癌患者的预后。因此TOX3在肝癌中作为预后指标具有一定的潜在应用价值。

公开(公告)号：CN112375810A

公开(公告)日：2021-02-19

申请号：CN202011280703.6

申请日：2020-11-16

Applicant: 北京大学人民医院

Inventor： 陈红松 ,  陈冬波 ,  陈谱 ,  邓康健 ,  廖维甲 ,  谢兴旺

IPC: C12Q1/6851 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了GnT‑II基因下调表达作为肝癌预后标志物中的应用。本发明利用CRISRP人全基因组编码基因敲除文库筛选到调节抑制性免疫检查点分子CD155表达的编码基因GNT‑II，并发现在肝癌患者的肿瘤组织中GNT‑II的表达与CD155的表达呈正相关；进一步地，GNT‑II的表达与肝癌患者的预后明显相关，即在早期男性肝癌患者中GNT‑II的表达越高，患者的预后越差。因此GNT‑II在肝癌中作为预后指标具有一定的潜在应用价值。

公开(公告)号：CN111850018A

公开(公告)日：2020-10-30

申请号：CN202010634108.1

申请日：2020-07-02

Applicant: 北京大学人民医院

Inventor： 陈红松 ,  谢兴旺 ,  廖维甲 ,  陈冬波 ,  陈谱

IPC: C12N15/63 ,  C12N15/867 ,  C12N15/66 ,  C12N15/62 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q1/6806 ,  C40B40/02 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及多MHC基因型和抗原MiniGene组合文库及其构建方法和应用。本发明提供T细胞抗原表位筛选载体，该载体包含MHC亚型连接区、抗原表位连接区以及位于两者之间的标签序列，其中，MHC亚型连接区用于连入MHC亚型编码序列；抗原表位连接区用于连入候选抗原表位编码序列。本发明还提供基于该载体的携带不同MHC亚型序列的成套载体以及利用该成套载体与候选抗原表位编码序列构建的多MHC基因型和抗原MiniGene组合文库。利用该组合文库进行抗原表位的筛选具有高通量、低误差、高分辨率、可监控的优势，为T细胞抗原表位的鉴定提供了高效的分子工具和方法。

公开(公告)号：CN112522401B

公开(公告)日：2021-09-24

申请号：CN202011280716.3

申请日：2020-11-16

Applicant: 北京大学人民医院

Inventor： 陈红松 ,  房琼璇 ,  陈冬波 ,  邓康健 ,  廖维甲 ,  谢兴旺 ,  陈谱

IPC: C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了TOX3基因过表达作为肝癌预后标志物中的应用。本发明利用全基因组CRISPR激活文库筛选发现TOX3可以抑制检查点抑制剂CD155的表达。进一步利用TCGA肝癌RNA‑seq数据进行免疫浸润分析，发现TOX3的表达水平与肝癌组织中NK细胞的浸润频率显著正相关，结合CD155对NK细胞的抑制作用，进一步提示TOX3可能通过抑制CD155激活NK细胞，从而有利于肝癌患者的预后。因此TOX3在肝癌中作为预后指标具有一定的潜在应用价值。

公开(公告)号：CN111850018B

公开(公告)日：2021-06-22

申请号：CN202010634108.1

申请日：2020-07-02

Applicant: 北京大学人民医院

Inventor： 陈红松 ,  谢兴旺 ,  廖维甲 ,  陈冬波 ,  陈谱

IPC: C12N15/63 ,  C12N15/867 ,  C12N15/66 ,  C12N15/62 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q1/6806 ,  C40B40/02 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及多MHC基因型和抗原MiniGene组合文库及其构建方法和应用。本发明提供T细胞抗原表位筛选载体，该载体包含MHC亚型连接区、抗原表位连接区以及位于两者之间的标签序列，其中，MHC亚型连接区用于连入MHC亚型编码序列；抗原表位连接区用于连入候选抗原表位编码序列。本发明还提供基于该载体的携带不同MHC亚型序列的成套载体以及利用该成套载体与候选抗原表位编码序列构建的多MHC基因型和抗原MiniGene组合文库。利用该组合文库进行抗原表位的筛选具有高通量、低误差、高分辨率、可监控的优势，为T细胞抗原表位的鉴定提供了高效的分子工具和方法。