一种AraC/XylS家族转录因子及其应用

    公开(公告)号:CN120058882A

    公开(公告)日:2025-05-30

    申请号:CN202510110812.X

    申请日:2025-01-23

    Inventor: 王辉 武星宇

    Abstract: 本发明涉及生物医学技术领域,具体涉及一种AraC/XylS家族转录因子及其应用,该转录因子被鉴定并命名为pncR。在转录后阶段,pncR基因的关键氨基酸位点存在A‑to‑I RNA编辑现象,从而生成一种新的pncR蛋白变体,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。通过基因敲除或抑制RNA编辑,可阻止pncR蛋白变体的产生,从而降低碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的抗氧化能力。因此,pncR及其相关基因可作为抗碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌药物的靶点。

    预测非酒精性脂肪性肝病肝纤维化程度的装置及存储介质

    公开(公告)号:CN117577330A

    公开(公告)日:2024-02-20

    申请号:CN202410051334.5

    申请日:2024-01-15

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开预测非酒精性脂肪性肝病肝纤维化程度的装置及存储介质。该装置包括:数据获取单元,其用于获取血清学、人口统计学和/或人体测量学变量数据;数据分析单元,其存储有用于非酒精性脂肪性肝病肝纤维化程度的预测模型;输出单元,其用于输出是否患有非酒精性脂肪性肝病显著肝纤维化或患有非酒精性脂肪性肝病显著肝纤维化的风险的高低的结果。本发明对儿童非酒精性脂肪性肝病显著肝纤维化进行更科学的评估,从准确性和简易性角度建立了优于既往指标的预测模型。此外,本发明还开发了机器学习模型来预测显著纤维化,将机器学习方法开发的模型与逻辑回归进行了比较,从而为儿童非酒精性脂肪性肝病肝纤维化的早期筛查提供更可靠的方法。

    一种基于PCR和nanopore测序检测脑脊液感染哪些病原体的方法

    公开(公告)号:CN113201599B

    公开(公告)日:2023-03-31

    申请号:CN202110619033.4

    申请日:2021-06-03

    Inventor: 陈宏斌 王辉

    Abstract: 本发明公开了一种基于PCR和nanopore测序检测脑脊液感染哪些病原体的方法。实验证明,采用本发明提供的方法检测脑脊液,可以准确判断中枢神经系统感染的病原体为Enterovirus、Lymphocytic choriomeningitis virus、Neisseria meningitidis、Cytomegalovirus、Mycobacrterium tuberculosis、Nocardia Farcinica、Herpes simplexvirus 1、Human herpesvirus 6、Listeria monocytogenes和Herpes simplex virus2中的哪一种或哪几种。本发明为中枢神经系统感染提供准确而迅速的病原学诊断,具有很高的临床应用价值。

    一种检测革兰氏阴性细菌耐药基因的基因芯片试剂盒

    公开(公告)号:CN106884039B

    公开(公告)日:2018-07-06

    申请号:CN201510941253.3

    申请日:2015-12-16

    Abstract: 本发明公开了一种检测革兰氏阴性细菌耐药基因的基因芯片试剂盒。本发明所提供的试剂盒中含有用于检测革兰氏阴性细菌耐药基因的引物对组,由10个引物对组成,其序列为序列表中序列1‑20;同时所述试剂盒中还含有固定有序列21‑30所示10个单链DNA探针的杂交芯片。本发明提供的试剂盒支持高通量、快速、准确地检测多个革兰氏阴性细菌耐药基因,对中国人群进行筛查,能有效地起到准确诊断、耐药溯源、耐药控制等作用,从而抗生素使用量,减少耐药产生。

    一种快速检测根毛霉和根霉的引物组及试剂盒

    公开(公告)号:CN119530434A

    公开(公告)日:2025-02-28

    申请号:CN202411783018.3

    申请日:2024-12-05

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测根毛霉和根霉的引物组及试剂盒,其包括用于检测微小根毛霉、小孢根霉、根毛霉属、根霉属中的一种或多种的扩增引物对和探针,形成稳定的多重PCR反应试剂盒体系,确保可以有效地检测到临床中常见的根毛霉和根霉病原体。通过实验发现,本发明的引物组及试剂盒具有极高的特异性和灵敏度,最小可实现对浓度为4‑5pg/μL的根毛霉和根霉病原体的检测,可以实现快速高效精准的检测,大大缩短了检测时间,节约了检测成本,提高了检测效率。

    用于细菌耐药进化的微流控芯片、系统及方法

    公开(公告)号:CN118931691A

    公开(公告)日:2024-11-12

    申请号:CN202411031888.5

    申请日:2024-07-30

    Abstract: 本发明涉及生物医学技术领域,公开了一种用于细菌耐药进化的微流控芯片、系统及方法,该用于细菌耐药进化的微流控芯片包括基片和微通道结构,微通道结构包括浓度梯度分级模块和多组并联并呈矩阵排列的半开放微孔单元,浓度梯度分级模块包括多级微流道组,每级微流道组均包括多条混合流道,沿流体流向,每级微流道组较前一级微流道组均增加一条混合流道,最后一级微流道组的每个混合流道分别对应连接一组半开放微孔单元,每组半开放微孔单元包括多个半开放微孔,半开放微孔背离基片的一端具有敞口。本发明的微流控芯片在进行耐药进化筛选时,可同时生成一系列不同浓度梯度的抗生素组合,减少人工操作步骤,且可有效降低成本。

    一种同时检测血清中棕榈酸、15(S)-过氧氢二十碳四烯酸、十六烷基二酸和16-羟基十六烷酸的方法

    公开(公告)号:CN118817880A

    公开(公告)日:2024-10-22

    申请号:CN202410818933.5

    申请日:2024-06-24

    Abstract: 本发明公开了一种同时检测血清中棕榈酸、15(S)‑过氧氢二十碳四烯酸、十六烷基二酸和16‑羟基十六烷酸的方法。该方法包括:S1、血清待测样本经前处理,得到上清液;S2、将上清液进行液相色谱串联质谱检测;色谱条件如下:流动相由流动性A(10mM乙酸铵水溶液)和流动相B(异丙醇:乙腈=1:1,内含5mM乙酸铵)组成;0~2.10min,流动相A的体积含量由40%调至30%;2.10~2.12min,流动相A由30%调至29%;2.12~4.00min,流动相A由29%调至20%;4.00~4.10min,流动相A由20%调节至2%;4.10~5.10min,流动相A由2%调节至40%;5.10~7.00min,流动相A的体积含量保持为40%。本发明能够精准地检测血清中棕榈酸、15(S)‑过氧氢二十碳四烯酸、十六烷基二酸和16‑羟基十六烷酸的水平,为临床酒精性肝病的诊断提供指导和帮助。

    用于细菌培养的微流控芯片、细菌培养系统及细菌培养方法

    公开(公告)号:CN117965272A

    公开(公告)日:2024-05-03

    申请号:CN202410368003.4

    申请日:2024-03-28

    Abstract: 本发明涉及生物医学技术领域,公开了一种用于细菌培养的微流控芯片、细菌培养系统及细菌培养方法,该微流控芯片包括基板和微通道结构,微通道结构设置于基板,微通道结构包括多组呈矩阵排列的半开放微孔单元和多条并联设置的分支通道,每组半开放微孔单元对应一条分支通道连接并连通,每组半开放微孔单元包括至少一个半开放微孔,半开放微孔背离基板的一端具有敞口。本发明通过设置多组呈矩阵排列的半开放微孔单元,顶部敞口的半开放式设计以气液界面替代固液界面,可使细菌处于较为富氧的状态,并使细菌周边的氧气和营养物质得到持续更新,实现细菌的高效生长,提高细菌的生长效率,同时,半开放式设计还可便于在培养过程中灵活便捷地进行取样。

    一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法

    公开(公告)号:CN115064215B

    公开(公告)日:2023-10-24

    申请号:CN202210991537.3

    申请日:2022-08-18

    Abstract: 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法,其包含如下步骤:a)将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对;b)根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果;c)根据筛选的比对结果计算簇相似度,选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇;d)从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株;e)从所述候选菌株中,选取株相似度最大的N个原始菌株,作为来源菌株;f)根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。

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