公开(公告)号：CN119785893A

公开(公告)日：2025-04-08

申请号：CN202411836822.3

申请日：2024-12-13

Applicant: 北京大学

Inventor： 宋晨 ,  李佳轩 ,  董睿涵 ,  王磊

IPC: G16B40/20 ,  G16B30/00 ,  G06F18/2411 ,  G06N20/10

Abstract: 本发明公开了一种破膜抗菌肽的预测筛选方法，属于生物信息技术领域。本发明开发一个基于机器学习的序列分类器，在蛋白质组上进行高通量筛选，将可与膜接触的且二级结构主要为螺旋的多肽序列输入序列分类器预测是否为抗菌肽序列；对于序列分类器筛选出的序列，进一步筛选净电荷为正、较为疏水的序列，通过序列比对验证其新颖性，然后统计膜接触概率平均值，结合形成反平行二聚体的寡聚可能性，筛选出具有破膜特征的抗菌肽序列。本发明开发的基于机器学习的序列分类器预测抗菌肽的准确率优于现有方法，通过上述筛选方法成功获得了一系列破膜抗菌肽，具有较好的抑菌活性和较低的毒性，是理想的抗菌药物开发对象。

公开(公告)号：CN119661649A

公开(公告)日：2025-03-21

申请号：CN202411836816.8

申请日：2024-12-13

Applicant: 北京大学

Inventor： 宋晨 ,  李佳轩 ,  董睿涵 ,  王磊

IPC: C07K7/08 ,  A61K38/10 ,  A61P31/04 ,  A23K20/147 ,  A01N47/44 ,  A01P1/00 ,  C11D3/48 ,  C11D3/32

Abstract: 本发明公开了一种广谱抗菌肽及其应用。本发明基于人工智能筛选方法，从蟾蜍的蛋白质组中识别出一条广谱抗菌肽IYKILQLFHKRFKKGFFG。该抗菌肽带6个正电荷，序列中的GRAVY疏水性为‑0.06，疏水矩0.522，表现出两亲性的特点；且序列长度较短，易于合成，成本较低。经实验测试，这条抗菌肽可抑制包括4种革兰氏阴性菌株和7种革兰氏阳性菌株——共11种不同菌株的生长，是一条广谱抗菌肽。同时，这条抗菌肽的半最大溶血浓度和半最大细胞毒性浓度均大于128μg/mL，具有良好的生物安全性，可应用于抗菌药物和其他抗菌产品(如消毒剂、洗涤剂、饲料添加剂)中。

公开(公告)号：CN119591677A

公开(公告)日：2025-03-11

申请号：CN202411836819.1

申请日：2024-12-13

Applicant: 北京大学

Inventor： 李佳轩 ,  宋晨 ,  董睿涵 ,  王磊

IPC: C07K14/00 ,  A01N37/46 ,  A01P1/00 ,  A61K38/16 ,  A61P31/04 ,  A23K20/147

Abstract: 本发明公开了一种成孔抗菌肽及其应用。本发明利用自主开发的机器学习筛选流程从蟾蜍的蛋白质组中进行筛选，预测短肽序列的膜接触概率、抗菌能力、理化性质等，获得了一条成孔抗菌肽KKIASIIYAHVKALRARKILDNLKRLAANRP。经测试，该抗菌肽可以在膜上成孔，破坏细胞膜，发挥广谱抗菌作用，并具有较低的溶血活性和细胞毒性，是理想的抗菌药物开发对象。

公开(公告)号：CN119661650A

公开(公告)日：2025-03-21

申请号：CN202411836818.7

申请日：2024-12-13

Applicant: 北京大学

Inventor： 宋晨 ,  李佳轩 ,  董睿涵 ,  王磊

IPC: C07K7/08 ,  A61K38/10 ,  A61P31/04 ,  A23K20/147 ,  C11D3/48 ,  A01N37/46 ,  A01P1/00

Abstract: 本发明公开了一种破膜抗菌肽及其应用。本发明基于人工智能筛选方法，从蟾蜍的蛋白质组中识别出一种破膜抗菌肽KLAKLLKLLLWAQNELDQKK，带3个正电荷，50％的氨基酸为疏水氨基酸。经实验测试，该抗菌肽可抑制包括革兰氏阴性菌株和革兰氏阳性菌株在内共10种不同菌株的生长；同时，该抗菌肽的半最大溶血浓度和半最大细胞毒性浓度均大于128μg/mL，具有良好的生物安全性。抗菌肽通过破坏细胞膜发挥抗菌作用，具有不易导致细菌出现耐药性的特点，是理想的抗菌药物和消毒剂、洗涤剂、饲料添加剂等抗菌产品的开发对象。