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公开(公告)号:CN1566365A
公开(公告)日:2005-01-19
申请号:CN03147763.1
申请日:2003-06-24
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及微生物基因组序列分析、微生物基因识别、微生物物种识别等生物信息技术,包括以下步骤:a.设置部分已知编码的ORF和非编码的ORF,作为初始状态的聚类中心点;b.读取微生物DNA序列;c.从上述序列中找出所有最长的ORF,并记录它们在此序列中的位置;d.对该微生物DNA序列进行分析判别,将其分为编码序列、非编码序列和未定编码序列;e.将未定编码序列加入聚类中心点,重复步骤d,直到未定编码序列都归入到编码序列或者非编码序列;f.将分为编码序列的候选基因定为编码蛋白的基因。采用本发明地测试方法,可以方便准确地测试出基因组序列,与现有技术相比较,其测试精度明显提高,其测试方法简便易行。