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公开(公告)号：CN112626240B
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN202010985266.1
申请日：2020-09-18
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明公开了一种判断复杂菌群中细菌相互作用强弱关系的方法，其包括以下步骤：菌群样品的采集与宏基因组、宏转录组数据的测试和处理；筛选菌群中高丝氨酸内酯类信号分子合成酶基因；比较不同菌群高丝氨酸内酯类信号分子合成酶基因表达丰度差异；基于不同菌群之间高丝氨酸内酯信号分子合成酶基因的表达丰度的差异来判断不同菌群中细菌相互作用的强弱关系。高丝氨酸内酯信号分子合成酶基因表达丰度高的菌群中细菌相互作用强。本发明通过比较不同菌群中高丝氨酸内酯信号分子合成酶基因的表达丰度的高低，直接、准确、快速地判断菌群中细菌相互作用的强弱关系，降低了现有判断菌群中细菌间相互作用强弱关系的技术难度。
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公开(公告)号：CN112626240A
公开(公告)日：2021-04-09
申请号：CN202010985266.1
申请日：2020-09-18
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明公开了一种判断复杂菌群中细菌相互作用强弱关系的方法，其包括以下步骤：菌群样品的采集与宏基因组、宏转录组数据的测试和处理；筛选菌群中高丝氨酸内酯类信号分子合成酶基因；比较不同菌群高丝氨酸内酯类信号分子合成酶基因表达丰度差异；基于不同菌群之间高丝氨酸内酯信号分子合成酶基因的表达丰度的差异来判断不同菌群中细菌相互作用的强弱关系。高丝氨酸内酯信号分子合成酶基因表达丰度高的菌群中细菌相互作用强。本发明通过比较不同菌群中高丝氨酸内酯信号分子合成酶基因的表达丰度的高低，直接、准确、快速地判断菌群中细菌相互作用的强弱关系，降低了现有判断菌群中细菌间相互作用强弱关系的技术难度。
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