公开(公告)号：CN115954048B

公开(公告)日：2023-06-16

申请号：CN202310004646.6

申请日：2023-01-03

Applicant: 之江实验室

Inventor： 李文慧 ,  王无可 ,  蔡润泽 ,  侯丽亚 ,  黄嘉健 ,  唐进

IPC: G16B20/30 ,  G16B40/20

Abstract: 本说明书公开了一种针对CRISPR‑Cas系统的筛选方法及装置，可以获取CRISPR‑Cas系统的相关信息以及对应的标注信息，CRISPR‑Cas系统对应的标注信息用于表示该CRISPR‑Cas系统是否具有自处理能力；而后，可以根据该相关信息，确定CRISPR‑Cas系统中的保守重复序列，并根据保守重复序列，确定该CRISPR‑Cas系统对应的基因特征，进而对预测模型进行训练，训练后的预测模型可以用于筛选出用于基因编辑工具开发的目标CRISPR‑Cas系统，本方法通过自动筛选出一批存在较大概率具有自处理能力的CRISPR‑Cas系统，能够提高基因编辑工具的开发的效率。

公开(公告)号：CN117174162A

公开(公告)日：2023-12-05

申请号：CN202311155995.4

申请日：2023-09-07

Applicant: 之江实验室

Inventor： 黄嘉健 ,  陈钦畅 ,  陈广勇 ,  陈觅 ,  段力文 ,  王威 ,  唐进

IPC: G16B15/00 ,  G16B30/00 ,  G16B40/00 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/048 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/09

Abstract: 在本说明书提供的一种预测蛋白质距离图的方法、存储介质及电子设备中，确认蛋白质残基序列，生成第一注意力图。通过三角注意力模块，对满足三角形不等式的残基进行加权，确定第二注意力图。以及通过残基混合模块，对具有指定结构关系的残基进行局部特征加权。最后使用还原模块，将残基混合模块输出与第一注意力图叠加突出对比效果，通过回归预测图的尺寸变换输出距离图。通过确定出满足三角形约束的残基并突出指定二维结构以及超二维结构的距离图，解决了单独对蛋白质残基距离预测存在预测结果失效的问题，从而提高蛋白质合成的效率。

公开(公告)号：CN115954048A

公开(公告)日：2023-04-11

申请号：CN202310004646.6

申请日：2023-01-03

Applicant: 之江实验室

Inventor： 李文慧 ,  王无可 ,  蔡润泽 ,  侯丽亚 ,  黄嘉健 ,  唐进

IPC: G16B20/30 ,  G16B40/20

Abstract: 本说明书公开了一种针对CRISPR‑Cas系统的筛选方法及装置，可以获取CRISPR‑Cas系统的相关信息以及对应的标注信息，CRISPR‑Cas系统对应的标注信息用于表示该CRISPR‑Cas系统是否具有自处理能力；而后，可以根据该相关信息，确定CRISPR‑Cas系统中的保守重复序列，并根据保守重复序列，确定该CRISPR‑Cas系统对应的基因特征，进而对预测模型进行训练，训练后的预测模型可以用于筛选出用于基因编辑工具开发的目标CRISPR‑Cas系统，本方法通过自动筛选出一批存在较大概率具有自处理能力的CRISPR‑Cas系统，能够提高基因编辑工具的开发的效率。