公开(公告)号：CN117912547A

公开(公告)日：2024-04-19

申请号：CN202311770739.6

申请日：2023-12-21

Applicant: 中山大学附属第八医院(深圳福田) ,  华中农业大学

Inventor： 李青娇 ,  周雄辉 ,  黄仕颖 ,  梁茵

IPC: G16B20/20 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明属于生物医药技术领域，公开了一种孕妇胎龄预测模型及其在早产和/或胎儿生长受限预警中的应用，具体公开了一种孕妇胎龄预测模型的构建方法。本发明通过外周血循环RNA全转录组数据得到所有转录物的表达值并计算TMP值，使用Spearman相关系数来计算其转录本的TPM与孕周时间的相关性。选择具有p‑value小于

公开(公告)号：CN116312800A

公开(公告)日：2023-06-23

申请号：CN202310248153.7

申请日：2023-03-08

Applicant: 中山大学附属第八医院(深圳福田)

Inventor： 李青娇 ,  刘宇琳 ,  梁茵

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/10 ,  G16B50/00 ,  G16H50/70 ,  G06F18/214 ,  G06F18/2431

Abstract: 本发明公开了一种基于血浆中循环RNA全转录组测序的肺癌特征识别方法、装置和存储介质，包括获取与非小细胞肺癌相关的cfRNA标志物信息，从cfRNA标志物信息中选择出顶级特征信息，根据顶级特征信息构建和训练预测模型，使用训练好的预测模型进行非小细胞肺癌特征识别等步骤。本发明可以辅助医生实现对非小细胞肺癌的精确诊断；对于在实体肿瘤中转录量大的基因，释放到外周血中的拷贝数会很多，有助于在肿瘤较小的早期癌症患者血液中识别出变异信息，提高诊断的敏感性；本发明基于cfRNA全转录组测序实现，相对于cfDNA及其甲基化测序等现有技术，成本更低，对早筛早诊的普及更有利。本发明广泛应用于生物医药技术领域。

公开(公告)号：CN119108014A

公开(公告)日：2024-12-10

申请号：CN202411350772.8

申请日：2024-09-26

Applicant: 中山大学附属第八医院(深圳福田)

Inventor： 李青娇 ,  梁茵 ,  姚晓欣 ,  郭雅婕 ,  张广权

IPC: G16B20/20 ,  G16B5/00 ,  G16H50/30 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了一种癌症风险预测方法及系统，涉及生物信息技术领域。该癌症风险预测方法涉及的癌症风险预测模型的构建方法包括：S1、基于甲基化芯片中的甲基化探针获取全基因组上符合期望的CpG簇；S2、根据待分析的肿瘤组织样本的肿瘤纯度进行分组；S3、按差异标志筛选方法识别各组癌症特异的CpG簇(DPCC)；S4、生成DPCC的参考片段；S5、模拟参考片段的甲基化状态，生成伪片段数据库；S6、基于伪片段数据的DNA甲基化及序列特征训练片段二分类模型。其适用于多种癌症类型的分析，还能够处理不同各种DNA甲基化测序数据。

公开(公告)号：CN118895351A

公开(公告)日：2024-11-05

申请号：CN202410920761.2

申请日：2024-07-10

Applicant: 中山大学附属第八医院(深圳福田)

Inventor： 郭雅婕 ,  王彤 ,  李青娇 ,  龙会宝 ,  吴海东 ,  王丹

IPC: C12Q1/6883 ,  C12N15/113 ,  A61K45/00 ,  A61P1/16 ,  A61P3/06 ,  A61K31/713 ,  A61K9/51 ,  A61K47/24

Abstract: 本发明属于生物医药技术领域，公开了UBXN11在制备治疗非酒精性脂肪肝的药物中的应用，具体公开了UBXN11基因作为治疗靶点在制备或筛选防治非酒精性脂肪肝的药物中的应用。本发明立足于非酒精性脂肪肝病人的临床肝脏测序数据，利用大数据分析手段，找到非酒精性脂肪肝中特异性高表达的基因UBXN11，并通过初步体外细胞实验和体内动物实验筛选出UBXN11可作为非酒精性脂肪肝特异性的新靶点基因，为非酒精性脂肪肝的针对性特异性基因治疗提供了一种新思路。

公开(公告)号：CN115831218A

公开(公告)日：2023-03-21

申请号：CN202211214590.9

申请日：2022-09-30

Applicant: 中山大学附属第八医院(深圳福田)

Inventor： 李青娇 ,  黄梓华

IPC: G16B20/00 ,  G16B40/00 ,  G16H50/20

Abstract: 本发明公开了一种孕妇早产风险预测模型及其构建方法与应用，包括如下步骤：(1)获取孕妇阴道微生物16S rRNA数据，确定微生物信息；(2)根据样本中的微生物相对丰度，得到早产组和非早产组中有统计学差异的微生物种属；(3)基于随机森林模型处理早产组和非早产组中有统计学差异微生物数据，构建得到孕妇早产风险预测模型。该模型仅需基于阴道微生物即可达到早产预测目的，可在孕妇未出现临床症状之前或更早期实现预测，预测准确率高，相比常规技术更加优异的灵敏度和特异性，且样品的采集无需专业的设备和人员，可由孕妇在非医院环境中自行采集，方便快捷。

公开(公告)号：CN117887824A

公开(公告)日：2024-04-16

申请号：CN202311803790.2

申请日：2023-12-25

Applicant: 中山大学附属第八医院(深圳福田)

Inventor： 李青娇 ,  姚晓欣 ,  郭雅婕 ,  李奇燕 ,  刘宇琳

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6888 ,  G16B20/00

Abstract: 本发明属于生物医学技术领域，公开了一种联合外周血循环DNA和RNA的肿瘤早期诊断方法，具体公开了一种肿瘤早期诊断模型的构建方法。本发明充分描述了肿瘤外周血cfDNA全基因组甲基化特征和cfRNA全转录组特征，结合外周血cfRNA和cfDNA两种分子标志物来作为癌症早期诊断，实现从分析单组学分子标记物转向分析多组学标记物，通过结合多组学来源的生物标记物的方法来提高了癌症早期诊断模型的特异性、敏感性和准确性，显著提高癌症的检出率。所构建的肿瘤早期诊断模型的AUC达到0.861，具有诊断学意义，在临床工作中有一定的指导意义。

公开(公告)号：CN116246708A

公开(公告)日：2023-06-09

申请号：CN202310162954.1

申请日：2023-02-17

Applicant: 中山大学附属第八医院(深圳福田)

Inventor： 李青娇 ,  李奇燕

IPC: G16B40/00 ,  G16B30/00 ,  G16B25/10 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明公开了一种预测肿瘤瘤内微生物来源免疫原性肽段的方法及其应用，主要包括以下步骤：收集肿瘤组织RNA‑seq数据，筛选与肿瘤免疫相关的微生物标志物，预测微生物中具有免疫原性的肽段。本发明首次提出了一种基于对肿瘤RNA‑seq数据的充分挖掘从而预测肿瘤微生物中免疫原性肽段的方法，从而实现了为肿瘤免疫治疗提供新靶点，提高肿瘤患者的生存率和预后效果的可能性。