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公开(公告)号:CN120048340A
公开(公告)日:2025-05-27
申请号:CN202411943779.0
申请日:2024-12-26
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
Abstract: 本披露公开了一种构建预测植物表型的预测模型的方法及其装置,方法包括:获取每个第一植物样本的全基因组SNP位点和每一个第一植物样本的表型值,并进行配对;向具有染色体感知功能的特征选择模块,输入配对的全基因组SNP位点和配对表型值,以获取目标全基因组SNP位点,并保持目标全基因组SNP位点与配对表型值的配对;向具有对比学习功能的输出网络模块,输入不同的第二植物样本,用于生成特征输出和低维特征输出,第二植物样本具有配对的目标全基因组SNP位点和配对表型值;基于特征输出、低维特征输出、配对的配对表型值计算总损失;通过最小化总损失,构建预测模型。通过设定的染色体感知功能和对比学习功能,使构建出模型具有更高的准确性。
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公开(公告)号:CN105301794A
公开(公告)日:2016-02-03
申请号:CN201510727726.X
申请日:2015-10-30
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
CPC classification number: G02B27/58 , G06K9/3233 , G06T2207/10056
Abstract: 本发明涉及一种用于快速运动物体的超高分辨成像装置。该装置包括:常规分辨率显微成像模块,用于显示运动物体样品和超高分辨成像目标以提供两者的位置和运动信息;快速图像采集与处理模块,用于获取超高分辨成像目标的运动速度Vi、感兴趣区域ROI的运动速度Vr与位置以及成像拍摄区域Sp的尺寸,并提供给位置反馈控制模块和超高分辨成像模块;位置反馈控制模块,用于调整所述成像拍摄区域Sp或者拟成像区域Si的位置,以使得拟拍摄区域Si与成像拍摄区域Sp保持重合;超高分辨成像模块,用于根据超分辨成像速率要求调整成像拍摄区域Sp的尺寸,对运动物体样品上超高分辨成像目标进行超高分辨成像。本发明能够消除物体运动对超高分辨成像的影响。
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公开(公告)号:CN119693300A
公开(公告)日:2025-03-25
申请号:CN202411620916.7
申请日:2024-11-13
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
IPC: G06T7/00 , G01N23/046 , G06T7/13
Abstract: 本发明涉及生物分析技术领域,尤其涉及一种无损的生物样品组分分布的获取方法,包括:获取待测生物样品的能谱CT图像,根据能谱CT图像获取待测生物样品的第一衰减系数矩阵;选择与待测生物样品成分相同的第一生物样品,获取第一生物样品各个组分的衰减系数矩阵以及密度矩阵;将各个组分的衰减系数矩阵以及密度矩阵输入质量衰减系数获取模型中,获取第一生物样品各个组分的质量衰减系数;将第一生物样品各个组分的质量衰减系数以及待测生物样品对应的第一衰减系数矩阵输入质量密度分布获取模型中,获取待测生物样品中各个组分的质量密度分布矩阵。本发明能够获得生物样品中单一成分或复合物进行质量密度的测量,且整个测定过程简单便捷。
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公开(公告)号:CN118817674A
公开(公告)日:2024-10-22
申请号:CN202410865108.0
申请日:2024-06-28
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
Abstract: 本发明涉及精子运动技术领域,尤其涉及一种测量精子头部旋转频率的方法及装置,包括:S1、获取待测样品的图像信息,基于所述图像信息,选择目标精子;S2、基于所述目标精子,获取所述目标精子在预设的光镊光束中被捕获到头部后的目标精子头部的光斑;S3、基于所述目标精子头部的光斑,获取光斑强度变化信息,将所述光斑强度变化信息转换为电信号数据,对所述电信号数据进行功率谱分析,获取所述目标精子头部的旋转频率。本发明对精子运动特性进行实时监测和分析,能够快速获取精子运动特性,同时测量结果精度高。
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公开(公告)号:CN117470842A
公开(公告)日:2024-01-30
申请号:CN202311375325.3
申请日:2023-10-23
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
IPC: G01N21/84 , G06T7/00 , G06T7/73 , G06T7/60 , G06T7/20 , G06T5/70 , G06T5/90 , G06T7/13 , G06T7/194 , G06T7/90 , G06T7/187 , G01N21/17
Abstract: 本发明涉及一种精子体态及运动状态的控制方法。控制方法包括:S1:利用两束激光并作用于精子的头部;S2:调整两束激光作用于精子头部的位置以及功率:能将精子控制在选定的位置上,并控制精子的体态(指精子头部与成像焦平面之间的相对位置与角度)和运动状态,以获取不同方位、不同运动状态的精子的图像。其中包括精子头部和精子鞭毛相对焦平面的体态和运动状态。其有益效果是,通过调整两束激光作用于精子头部的位置以及功率,控制精子相对成像平面的体态和运动状态;如通过控制精子体态,以控制精子鞭毛在平行于成像焦面的平面内运动,以长时间观测并获取精子头部和鞭毛在三维空间内的运动图像。
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公开(公告)号:CN104568886B
公开(公告)日:2017-10-13
申请号:CN201510009447.X
申请日:2015-01-08
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所 , 华南师范大学
Abstract: 本发明公开一种基于全内反射的暗场照明方法,可应用于微纳米颗粒和生物样品等的光学显微成像研究。本发明基于照明光的全内反射实现对样品的暗场照明,利用样品散射光或者荧光作为信号光成像和检测,从而实现对微纳米尺度样品的观察和测量,并且对现有显微镜等成像装置具有良好的适用性和兼容性。本方法利用全内反射使得照明光在全内反射棱镜和样品池内一次或者多次全内反射,形成全内反射暗场照明,可以用于纳米材料、生物细胞和光与物质相互作用等研究领域。
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公开(公告)号:CN117649484A
公开(公告)日:2024-03-05
申请号:CN202311304245.9
申请日:2023-10-09
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
Abstract: 本发明涉及一种基于CT图像的三维光学重建方法,包括:借助于同轴扫描装置获取待重建物体多角度的CT投影信号和光学数据;对所有角度的CT投影信号进行重建,得到CT三维体素数据并提取CT三维体素数据的CT表面体素数据;将光学数据中每一像素点和CT三维表面体素数据中对应像素点对齐配准,并将光学数据中像素点的坐标映射到CT三维表面体素数据的CT图像坐标系中,获得所有角度下具有CT图像坐标系中三维空间坐标的第一光学数据集;对该数据集中所有光学数据进行拼接,形成三维光学重建后的信息。上述方法通过利用CT扫描为三维光学重建提供物体准确的三维空间信息,可以生成准确、全面的光学三维重建物体。
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公开(公告)号:CN105301794B
公开(公告)日:2017-08-25
申请号:CN201510727726.X
申请日:2015-10-30
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
Abstract: 本发明涉及一种用于快速运动物体的超高分辨成像装置。该装置包括:常规分辨率显微成像模块,用于显示运动物体样品和超高分辨成像目标以提供两者的位置和运动信息;快速图像采集与处理模块,用于获取超高分辨成像目标的运动速度Vi、感兴趣区域ROI的运动速度Vr与位置以及成像拍摄区域Sp的尺寸,并提供给位置反馈控制模块和超高分辨成像模块;位置反馈控制模块,用于调整所述成像拍摄区域Sp或者拟成像区域Si的位置,以使得拟拍摄区域Si与成像拍摄区域Sp保持重合;超高分辨成像模块,用于根据超分辨成像速率要求调整成像拍摄区域Sp的尺寸,对运动物体样品上超高分辨成像目标进行超高分辨成像。本发明能够消除物体运动对超高分辨成像的影响。
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公开(公告)号:CN104568886A
公开(公告)日:2015-04-29
申请号:CN201510009447.X
申请日:2015-01-08
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所 , 华南师范大学
Abstract: 本发明公开一种基于全内反射的暗场照明方法,可应用于微纳米颗粒和生物样品等的光学显微成像研究。本发明基于照明光的全内反射实现对样品的暗场照明,利用样品散射光或者荧光作为信号光成像和检测,从而实现对微纳米尺度样品的观察和测量,并且对现有显微镜等成像装置具有良好的适用性和兼容性。本方法利用全内反射使得照明光在全内反射棱镜和样品池内一次或者多次全内反射,形成全内反射暗场照明,可以用于纳米材料、生物细胞和光与物质相互作用等研究领域。
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公开(公告)号:CN119091036A
公开(公告)日:2024-12-06
申请号:CN202411012035.7
申请日:2024-07-26
Applicant: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
Abstract: 本发明涉及一种基于深度学习的精子鞭毛三维运动重建的方法,包括:获取待处理的精子的二维图像,将待处理的精子的二维图像进行图像预处理,获取预处理后的图像;将预处理后的图像输入训练好的精子分割模型,获取精子鞭毛二值图;将精子鞭毛二值图进行骨架化处理,获取精子鞭毛的中心线、N个等距离点以及每个等距离点对应的位置坐标;基于N个等距离点,获取N个精子鞭毛局部图像,并将每个精子鞭毛局部图像输入训练好的深度预测模型,获取每个精子鞭毛局部图像的深度信息;基于每个精子鞭毛局部图像的深度信息以及每个等距离点对应的位置坐标,重建精子鞭毛的三维模型。本发明为精子运动行为的研究和辅助生殖技术的发展提供了可靠的解决方案。
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