公开(公告)号：CN112116951B

公开(公告)日：2023-04-07

申请号：CN202010816554.4

申请日：2020-08-14

Applicant: 中国科学院计算技术研究所

Inventor： 范晓宣 ,  曹华伟 ,  叶笑春 ,  范东睿

IPC: G16B20/00 ,  G06F16/31 ,  G06F16/901

Abstract: 本发明实施例提供了一种基于图数据库的蛋白质组数据管理方法、介质和设备，该方法包括：获取蛋白质组对应的图数据，图数据包括多个节点和边，其中，节点记录其所代表的蛋白质，边记录其连接的两个节点间的关系；根据该蛋白质组对应的图数据建立底层的双向链表，该双向链表中的节点按照其所代表蛋白质的名称的字典序依次排列；从底层的双向链表开始，每两个节点提取一个节点到上一层索引以在各索引层建立单向的索引链表，直至顶部的索引链表仅有两个节点，以建立包括多层索引的快速索引；本发明在图数据库原有的基础上建立快速索引，以提高对大规模的蛋白质组的索引效率。

公开(公告)号：CN112116951A

公开(公告)日：2020-12-22

申请号：CN202010816554.4

申请日：2020-08-14

Applicant: 中国科学院计算技术研究所

Inventor： 范晓宣 ,  曹华伟 ,  叶笑春 ,  范东睿

IPC: G16B20/00 ,  G06F16/31 ,  G06F16/901

Abstract: 本发明实施例提供了一种基于图数据库的蛋白质组数据管理方法、介质和设备，该方法包括：获取蛋白质组对应的图数据，图数据包括多个节点和边，其中，节点记录其所代表的蛋白质，边记录其连接的两个节点间的关系；根据该蛋白质组对应的图数据建立底层的双向链表，该双向链表中的节点按照其所代表蛋白质的名称的字典序依次排列；从底层的双向链表开始，每两个节点提取一个节点到上一层索引以在各索引层建立单向的索引链表，直至顶部的索引链表仅有两个节点，以建立包括多层索引的快速索引；本发明在图数据库原有的基础上建立快速索引，以提高对大规模的蛋白质组的索引效率。