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公开(公告)号:CN114049252A
公开(公告)日:2022-02-15
申请号:CN202111138563.3
申请日:2021-09-27
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明提供一种面向序列切片的扫描电镜三维影像获取系统及方法,涉及显微成像技术领域,该系统包括:人机交互模块,用于确定感兴趣区域,并生成感兴趣区域的三维成像指令和配准指令;控制模块,用于根据三维成像指令,生成控制指令;接口模块,用于向扫描电镜发送控制指令,并接收扫描电镜的图像数据;存储模块,用于存储图像数据;数据处理模块,用于获取存储模块的图像数据,并根据配准指令,对图像数据进行三维配准并组合,得到三维影像,以及,将配准后的三维影像发送给人机交互模块。本发明实现从扫描电镜成像到序列切片电镜图像三维配准的一体化高通量三维成像,生物结构三维电镜影像的所见即所得。
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公开(公告)号:CN112381817A
公开(公告)日:2021-02-19
申请号:CN202011374986.0
申请日:2020-11-30
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于电镜显微成像和图像处理领域,具体涉及一种扫描电镜透射模式与透射电镜联用的病毒快速检测系统、方法、装置,旨在解决现有基于透射电镜的病毒检测操作复杂、成像效率以及检测准确率低的问题。本系统包括样品获取模块,配置为获取待检测的病毒标本,并将其滴在带有支持膜的铜网上;扫描电镜成像模块,配置为得到扫描电镜透射图像;像素位置获取模块,配置为获取各病毒颗粒以及其对应的铜网方格的顶点在图像中的像素位置;变换矩阵计算模块,配置为计算从图像像素位置映射到透射电镜物理坐标的透射变换矩阵;形态结构检测模块,配置为得到每个病毒颗粒的形态结构。本发明简化了检测操作,并提高了成像效率以及检测的准确率。
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公开(公告)号:CN110328712B
公开(公告)日:2020-06-16
申请号:CN201910578456.9
申请日:2019-06-28
Applicant: 中国科学院自动化研究所
IPC: B26D7/26 , B26D7/32 , G01N23/2202
Abstract: 本发明实施例涉及生物组织切片制备技术领域,具体涉及一种刀刃位置切换方法、装置及包括该装置的超薄切片机,解决了切割刀刀刃位置切换时引起的序列不连续、中间切片信息丢失等问题。本发明实施例第一方面公开的刀刃位置切换方法包括步骤:切割完第N1片切片后,当样品臂运动到样品脱离切割刀时驱动切割刀刀刃沿样品的宽度方向第一次步进;所述第一次步进后,切割完M1、…Mn片切片后,当样品臂运动到样品脱离切割刀时驱动切割刀刀刃沿样品的宽度方向步进,直到所有的步进量之和不小于切片宽度本发明的有益效果为:保证切片质量,使得切片的序列连续,避免中间切片信息丢失。
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公开(公告)号:CN110991541A
公开(公告)日:2020-04-10
申请号:CN201911248845.1
申请日:2019-12-09
Applicant: 中国科学院自动化研究所
IPC: G06K9/62
Abstract: 本发明涉及一种基于随机线段的图像特征分类方法及系统,所述分类方法包括:获取已知图像特征的样本图像集;对参照样本图像进行归一化处理,得到处理图像;根据各处理像素点,得到多组有向线段组;比较各个有向线段的线段头和线段尾的处理像素点值的大小,得到比较结果;将各比较结果按顺序排列,得到图像特征编码序列;多组有向线段组对应的图像特征编码序列形成图像特征分类器;基于图像特征分类器及各所述分析样本图像,确定已知图像特征的特征编码序列;对待处理图像进行识别,确定待处理图像的图像编码序列;进而根据已知图像特征的特征编码序列及待处理图像的图像编码序列,可快速准确地确定所述待处理图像的图像特征类别。
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公开(公告)号:CN107917924B
公开(公告)日:2020-01-10
申请号:CN201710935508.4
申请日:2017-10-10
Applicant: 中国科学院自动化研究所
IPC: G01N23/203
Abstract: 本发明涉及一种低能量背散射电子探测器,该探测器包括半导体探测基底和设置在所述基底表面的覆膜,所述覆膜的材料为:铍、碳或石墨烯,或者这三种材料的任意组合。所述覆膜的厚度≤10nm。所述低能量背散射电子探测器包括第一内圈部分和第二外圈部分,所述第一内圈部分为环形,所述第二外圈部分包括绕所述第一内圈部分均匀地周向设置的多个子部分,操作时对各个部分探测的信号进行加和处理可得到样品的成分信息,作差处理可得到样品在连接各部分探测器方向上的形貌信息;多个部分可以独立工作或协同工作,可以分别得到样品的成分像或形貌像。本发明不但具有较强的电子穿透能力,且具有较好的探测效率。
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公开(公告)号:CN106407988B
公开(公告)日:2019-11-26
申请号:CN201610802612.1
申请日:2016-09-05
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于电镜序列切片图像的突触检测方法。其涉及模式识别和神经学领域,具体地,该方法包括对电镜序列切片图像进行拼接对准;接着针对拼接对准后的单层电镜序列切片图像,利用Adaboost算法进行突触检测;然后基于突触特征进行突触识别,最后利用上下文线索进行突触过滤,并基于突触过滤的结果,进行突触的三维重构。通过本发明实现了高效、精准的突触检测。
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公开(公告)号:CN110328712A
公开(公告)日:2019-10-15
申请号:CN201910578456.9
申请日:2019-06-28
Applicant: 中国科学院自动化研究所
IPC: B26D7/26 , B26D7/32 , G01N23/2202
Abstract: 本发明实施例涉及生物组织切片制备技术领域,具体涉及一种刀刃位置切换方法、装置及包括该装置的超薄切片机,解决了切割刀刀刃位置切换时引起的序列不连续、中间切片信息丢失等问题。本发明实施例第一方面公开的刀刃位置切换方法包括步骤:切割完第N1片切片后,当样品臂运动到样品脱离切割刀时驱动切割刀刀刃沿样品的宽度方向第一次步进;所述第一次步进后,切割完M1、…Mn片切片后,当样品臂运动到样品脱离切割刀时驱动切割刀刀刃沿样品的宽度方向步进,直到所有的步进量之和不小于切片宽度本发明的有益效果为:保证切片质量,使得切片的序列连续,避免中间切片信息丢失。
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公开(公告)号:CN109584368A
公开(公告)日:2019-04-05
申请号:CN201811213305.5
申请日:2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种生物样品三维结构的构建方法及装置,所述方法包括,获取至少两个生物样品薄片的三维图像;修正所述薄片的三维图像表面生成三维图像块;将所述三维图像块拆分为二维序列图像,并根据所述至少两个生物样品薄片的位置排列所述二维序列图像;计算所述二维序列图像的图像变形位置坐标,确定所述生物样品的三维结构。本发明能够有效处理序列薄片的不规则形变和表面不平整,并将序列薄片的三维图像在三维空间中联接起来,实现对大体量生物样品的高分辨率整体三维结构构建。
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公开(公告)号:CN107976458A
公开(公告)日:2018-05-01
申请号:CN201710936186.5
申请日:2017-10-10
Applicant: 中国科学院自动化研究所
IPC: G01N23/203
Abstract: 本发明涉及一种低能量背散射电子探测器,该探测器包括半导体探测基底和设置在所述基底表面的覆膜,所述覆膜的材料为:铍、碳或石墨烯,或者这三种材料的任意组合。所述覆膜的厚度≤10nm。所述低能量背散射电子探测器包括第一内圈部分和第二外圈部分,所述第一内圈部分为环形,所述第二外圈部分包括绕所述第一内圈部分均匀地周向设置的多个子部分,操作时对各个部分探测的信号进行加和处理可得到样品的成分信息,作差处理可得到样品在连接各部分探测器方向上的形貌信息;多个部分可以独立工作或协同工作,可以分别得到样品的成分像或形貌像。本发明不但具有较强的电子穿透能力,且具有较好的探测效率。
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公开(公告)号:CN107958442A
公开(公告)日:2018-04-24
申请号:CN201711287182.5
申请日:2017-12-07
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及图像拼接领域,具体涉及一种多幅显微图像拼接中的灰度校正方法及装置,目的在于解决图像拼接中的灰度不连续情况。本发明提出的灰度校正方法及装置,先从配准后的图像中选取种子图像,再根据种子图像的位置信息和灰度信息,采用增益补偿方法对图像进行粗调,采用直方图规范化的方法对图像进行细调,尽可能地达到图像与图像之间的灰度一致。然后,采用泊松图像编辑法进行图像融合,消除拼接痕迹。该灰度校正方法流程以种子图像为灰度校正的起点,减少了传统方法的误差累计和传递。由整体到局部,一步步完善校正的效果,灰度校正结果较为鲁棒,保证了切片显微图像灰度校正结果的质量。
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