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公开(公告)号：CN108486271B
公开(公告)日：2019-03-29
申请号：CN201810268642.8
申请日：2018-03-29
Applicant: 中国科学院微生物研究所 , 福建农林大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序技术的银耳菌种纯度检测方法及其应用。该方法包括如下步骤：采用真菌ITS2区引物对待测银耳菌种的基因组进行PCR扩增建库，高通量测序，然后将高通量测序所得结果数据过滤去杂后根据97％以上相似性进行OTU聚类分析，对比真菌ITS序列数据库，得到每个OTU对应的物种分类信息，进而实现对所述待测银耳菌种的纯度鉴定。本发明方法实现了对银耳菌种的定量分析，也反映了菌种的匀质性，为安全生产提供了参考和判断标准。本发明方法特别适用于各食用菌服务和研究单位，以突破或制定出相应的技术壁垒，保障食用菌生产的安全性。
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公开(公告)号：CN108504727A
公开(公告)日：2018-09-07
申请号：CN201810310490.3
申请日：2018-04-09
Applicant: 中国科学院微生物研究所 , 福建农林大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , A01G18/40
Abstract: 本发明公开了一种高通量测序技术检测银耳菌种中银耳和香灰菌配比的方法。该方法包括如下步骤：采用真菌ITS2区引物对待测银耳菌种的基因组进行PCR扩增建库，高通量测序，然后将高通量测序所得结果数据过滤去杂后根据97％以上相似性进行OTU聚类分析，对比真菌ITS序列数据库，得到银耳和香灰菌对应的OTU信息，进而实现对所述待测银耳菌种中银耳和香灰菌的配比的定量分析。本发明方法结合不同配比下银耳菌种子实体生长情况，定量评估银耳和香灰菌不同配比对子实体形成的影响，为银耳生产中的菌种的制备提供可靠的参考标准。特别适用于各食用菌服务和研究单位，以突破或制定出相应的技术壁垒，保障食用菌生产的安全性和稳定性。
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公开(公告)号：CN108504727B
公开(公告)日：2021-04-06
申请号：CN201810310490.3
申请日：2018-04-09
Applicant: 中国科学院微生物研究所 , 福建农林大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , A01G18/40
Abstract: 本发明公开了一种高通量测序技术检测银耳菌种中银耳和香灰菌配比的方法。该方法包括如下步骤：采用真菌ITS2区引物对待测银耳菌种的基因组进行PCR扩增建库，高通量测序，然后将高通量测序所得结果数据过滤去杂后根据97％以上相似性进行OTU聚类分析，对比真菌ITS序列数据库，得到银耳和香灰菌对应的OTU信息，进而实现对所述待测银耳菌种中银耳和香灰菌的配比的定量分析。本发明方法结合不同配比下银耳菌种子实体生长情况，定量评估银耳和香灰菌不同配比对子实体形成的影响，为银耳生产中的菌种的制备提供可靠的参考标准。特别适用于各食用菌服务和研究单位，以突破或制定出相应的技术壁垒，保障食用菌生产的安全性和稳定性。
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公开(公告)号：CN108486271A
公开(公告)日：2018-09-04
申请号：CN201810268642.8
申请日：2018-03-29
Applicant: 中国科学院微生物研究所 , 福建农林大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序技术的银耳菌种纯度检测方法及其应用。该方法包括如下步骤：采用真菌ITS2区引物对待测银耳菌种的基因组进行PCR扩增建库，高通量测序，然后将高通量测序所得结果数据过滤去杂后根据97％以上相似性进行OTU聚类分析，对比真菌ITS序列数据库，得到每个OTU对应的物种分类信息，进而实现对所述待测银耳菌种的纯度鉴定。本发明方法实现了对银耳菌种的定量分析，也反映了菌种的匀质性，为安全生产提供了参考和判断标准。本发明方法特别适用于各食用菌服务和研究单位，以突破或制定出相应的技术壁垒，保障食用菌生产的安全性。
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