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公开(公告)号：CN119920352A
公开(公告)日：2025-05-02
申请号：CN202311437769.5
申请日：2023-10-31
Applicant: 华为云计算技术有限公司 , 中国科学院上海药物研究所
Abstract: 本申请公开了一种化合物安全性预测方法、装置及计算设备集群，该方法应用于云服务中心，云服务中心包括多个云应用实例，该方法包括：云应用实例根据多个化合物、多个靶点以及多个脱靶预测模型，确定每个化合物与每个靶点之间的第一概率；将第一概率输入药物不良反应ADR预测模型，得到每个化合物和每个ADR之间的第二概率；根据脱靶靶点的数量、第二概率以及每个ADR的危险性评分，确定多个化合物的安全性评分，预测化合物的安全性。上述过程通过将脱靶预测结果作为特征输入ADR预测中，实现脱靶预测和ADR预测的结合，从靶点层面揭示ADR的作用机制，并量化化合物安全性水平，在药物开发阶段化合物的安全性评估提供依据。
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公开(公告)号：CN116239574A
公开(公告)日：2023-06-09
申请号：CN202211524229.6
申请日：2022-11-30
Applicant: 中国科学院上海药物研究所
IPC: C07D403/04 , C07D405/04 , C07D237/24 , C07D471/04 , C07D403/12 , C07D417/04 , A61P35/00 , A61P35/02 , A61P29/00 , A61P9/10 , A61P37/06 , A61P19/06 , A61P11/00 , A61P25/28 , A61P25/16 , A61P11/06 , A61P1/16 , A61P17/14 , A61P21/04 , A61P9/00 , A61P1/00 , A61P17/06 , A61P3/10 , A61P17/00 , A61P11/02 , A61P5/14 , A61P31/12 , A61P31/10 , A61K31/501 , A61K31/4439 , A61K31/433 , A61K31/506 , A61K31/5377
Abstract: 本发明提供了STING小分子激动剂、其制备方法及应用。具体地，本发明提供了式I所示的化合物，其具有STING激动活性，在THP‑1细胞和RAW264.7细胞中，均可明显上调IFN‑β，CXCL10及IL‑6mRNA的表达水平，从而达到治疗恶性肿瘤和感染性疾病的目的。
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公开(公告)号：CN116687933A
公开(公告)日：2023-09-05
申请号：CN202210186636.4
申请日：2022-02-28
Applicant: 中国科学院上海药物研究所
IPC: A61K31/519 , A61K31/517 , A61K39/395 , A61P35/00
Abstract: 本发明提供甲氨蝶呤及其药物组合物在肿瘤免疫治疗中的用途。本发明验证了甲氨蝶呤(MTX)及其类似物雷替曲塞作为ENPP1抑制剂的药物活性，还验证了甲氨蝶呤在增强辐射疗法疗效中的作用，进一步验证了甲氨蝶呤可抑制肿瘤对PD‑1单抗的抵抗，MTX与PD‑1单抗联用增强小鼠肿瘤组织免疫细胞的浸润，增加了活性杀伤性T细胞数量，减少了耗竭性T细胞数量。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN115602262A
公开(公告)日：2023-01-13
申请号：CN202110772126.0
申请日：2021-07-08
Applicant: 中国科学院上海药物研究所(CN)
Abstract: 本公开涉及解离常数的预测方法、装置及存储介质，该方法包括：构建分子的分子图；对所述分子图进行初始化，得到所述分子图的初始特征；基于所述初始特征，获取初始化后的分子图中原子的特征；将所述原子的特征输入预设的微观预测模型中，预测所述原子的微观解离常数。本公开实施例提供的解离常数的预测方法、装置及存储介质，通过构建分子的分子图，并在对分子图进行初始化后通过原子间的信息传递，获取原子的特征，基于该原子的特征利用预设的pKa预测模型可以直接预测出分子中各原子的微观pKa值及分子的宏观pKa值，提高pKa预测的准确性，且预测方便、可靠。
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公开(公告)号：CN118629539A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202310221821.7
申请日：2023-03-09
Applicant: 中国科学院上海药物研究所
Abstract: 本申请提供一种三维分子构象的生成方法、装置及存储介质。所述方法包括：将分子图输入预设模型，以得到所述预设模型输出的候选扭转角值；基于规则算法得到初始构象；基于所述候选扭转角值与所述初始构象，得到最终的三维分子构象。本申请实施例的预设模型可以避免局部结构不合理的问题，如避免键长和键角不正确的问题；同时，与预测原子的坐标相比，预设模型可以克服SE(3)不变量的问题。
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公开(公告)号：CN113539366A
公开(公告)日：2021-10-22
申请号：CN202010309556.4
申请日：2020-04-17
Applicant: 中国科学院上海药物研究所
Abstract: 本申请公开了一种用于预测药物靶标的信息处理方法及装置，用以提升药物靶标预测的准确性。所述方法包括，获取化合物对应的化合物微扰谱；获取所述化合物所作用的目标基因对应的基因微扰谱；确定所述化合物微扰谱和所述基因微扰谱的相关程度；根据所述相关程度和预设的实验条件数据，对所述化合物能够对所述目标基因产生作用的概率进行预测。采用本申请所提供的方案，在确定化合物是否能够对目标基因产生作用的判断过程中，考虑了化合物微扰谱和基因微扰谱之间的相关性，从而提高了药物靶标预测的准确性。
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公开(公告)号：CN113539366B
公开(公告)日：2024-11-08
申请号：CN202010309556.4
申请日：2020-04-17
Applicant: 中国科学院上海药物研究所
Abstract: 本申请公开了一种用于预测药物靶标的信息处理方法及装置，用以提升药物靶标预测的准确性。所述方法包括，获取化合物对应的化合物微扰谱；获取所述化合物所作用的目标基因对应的基因微扰谱；确定所述化合物微扰谱和所述基因微扰谱的相关程度；根据所述相关程度和预设的实验条件数据，对所述化合物能够对所述目标基因产生作用的概率进行预测。采用本申请所提供的方案，在确定化合物是否能够对目标基因产生作用的判断过程中，考虑了化合物微扰谱和基因微扰谱之间的相关性，从而提高了药物靶标预测的准确性。
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公开(公告)号：CN118571307A
公开(公告)日：2024-08-30
申请号：CN202310177145.8
申请日：2023-02-28
Applicant: 中国科学院上海药物研究所
IPC: G16B15/30 , G16B40/00 , G06N3/0455 , G06N3/048 , G06N3/047 , G06N3/0499 , G06N3/084
Abstract: 本发明提供了一种药物重定向预测方法及预测系统，预测方法包括：对目标蛋白质的结合口袋的信息进行处理，获得目标蛋白质结合位点的图结构表征；基于图注意力机制和获得的图结构表征对口袋的残基的特征更新，获得口袋的全图表征；基于两个无关目标蛋白质的全图表征的特征交互，利用预设的预测模型得到药物重定向的预测情况。通过预先训练获得预测模型，当需要预测某个蛋白质口袋和某个无关蛋白质口袋能否共享相同活性化合物时，只需要获得这两个蛋白质结合口袋的特征表示，通过利用预测模型，就能预测出蛋白质口袋之间是否能够共享同一个活性化合物，由此能够计算出该具有该蛋白质的药物重定向的概率，使得药物重定向预测更加准确。
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