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公开(公告)号:CN108388774B
公开(公告)日:2021-07-23
申请号:CN201810042887.9
申请日:2018-01-17
Applicant: 中国石油大学(华东)
Abstract: 本发明公开了一种多肽谱匹配数据的在线分析方法,适于从高通量串联质谱平台及数据库匹配引擎输出的多肽谱匹配中鉴定正确的匹配。主要步骤包括数据预处理、使用在线学习算法求解优化模型、根据训练得出的分类函数鉴定正确的多肽谱匹配。该技术通过积极集存贮并动态更新对分类函数起作用的样本,实现了大规模多肽谱匹配数据的高效鉴定,克服了现有方法在大规模数据集上存储量大、计算缓慢的缺陷。
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公开(公告)号:CN108388774A
公开(公告)日:2018-08-10
申请号:CN201810042887.9
申请日:2018-01-17
Applicant: 中国石油大学(华东)
Abstract: 本发明公开了一种多肽谱匹配数据的在线分析方法,适于从高通量串联质谱平台及数据库匹配引擎输出的多肽谱匹配中鉴定正确的匹配。主要步骤包括数据预处理、使用在线学习算法求解优化模型、根据训练得出的分类函数鉴定正确的多肽谱匹配。该技术通过积极集存贮并动态更新对分类函数起作用的样本,实现了大规模多肽谱匹配数据的高效鉴定,克服了现有方法在大规模数据集上存储量大、计算缓慢的缺陷。
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公开(公告)号:CN107657282A
公开(公告)日:2018-02-02
申请号:CN201710903787.6
申请日:2017-09-29
Applicant: 中国石油大学(华东)
IPC: G06K9/62
CPC classification number: G06K9/6259 , G06K9/6227
Abstract: 本发明公开了一种多肽鉴定的自步长学习方法,适于从数据库匹配软件输出的多肽谱匹配中鉴定正确的匹配。主要包括数据预处理,求解半监督学习模型,根据训练得出的分类器 鉴定正确的多肽谱匹配。该技术通过增大自步长学习参数,实现了从可信样本到不可信样本的自动提取和分析过程,该技术克服了现有方法在正确多肽谱匹配比例较小的数据集上鉴定性能不稳定的缺陷,使得所公开的方法在不同类型的数据集上均可得到稳定的多肽谱匹配鉴定结果。
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