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公开(公告)号:CN119020498A
公开(公告)日:2024-11-26
申请号:CN202410884936.9
申请日:2024-07-03
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及多样性分析技术领域,特别是涉及一种采用COI和ITS标记解析松阿扁叶蜂不同地理种群的方法。此方法结合两种分子标记进行分析,一种是线粒体基因COI标记,另一种是核糖体DNA内部转录组间隔区ITS标记,实验中扩增得到松阿扁叶蜂COI序列835 bp,ITS序列1524 bp(包括ITS1和ITS2);基于以上两个分子标记分析松阿扁叶蜂不同地理种群的遗传多样性和遗传分化情况。本发明将为松阿扁叶蜂的种群研究提供有效的遗传标记,以揭示其动态演化历史和虫害爆发的遗传机制。
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公开(公告)号:CN117385057A
公开(公告)日:2024-01-12
申请号:CN202311544333.6
申请日:2023-11-20
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了基于全基因组数据开发的松阿扁叶蜂微卫星引物及其应用,涉及全基因组微卫星标记开发技术领域。所述松阿扁叶蜂微卫星引物包括79对。本发明利用高通量测序测得松阿扁叶蜂随机基因组序列,从中分离得到93,876个完美微卫星位点,共有256种重复基序,其中单、二核苷酸位点最为丰富。经QDD3软件设计引物、严格的手动筛选、个体水平的筛选和种群水平的验证,开发得到79对扩增效率高、多态性较好和分辨率高的微卫星标记引物,能够将山东和黑龙江两个种群的个体独立分开。本研究开发的79对微卫星引物,将为松阿扁叶蜂的种群研究提供有效的遗传标记,以揭示其动态演化历史和虫害爆发的遗传机制。
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公开(公告)号:CN118430653A
公开(公告)日:2024-08-02
申请号:CN202410594147.1
申请日:2024-05-14
IPC: G16B30/10 , G16B15/10 , G16B40/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于线粒体全基因组对延庆腮扁叶蜂系统发育的分析方法,涉及延庆腮扁叶蜂系统发育分析技术领域。提取延庆腮扁叶蜂的基因组DNA,使用高通量测序技术测定,将得到的原始数据进行质量控制、分析、评估和组装,将得到的组装后的contig与近缘物种线粒体基因进行比对,筛选得到来自线粒体的contig,再利用MITObim v1.6迭代比对等步骤。本发明通过测序组装等一系列过程得到了延庆腮扁叶蜂的线粒体全基因组,发现了扁叶蜂总科内新的线粒体重排现象,成功预测了tRNA二级结构并且构建了有效的系统发育分析,与前人的工作得到了很好的印证,为广腰亚目线粒体的系统发育分析提供了重要的材料。
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