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公开(公告)号:CN107586856B
公开(公告)日:2021-07-13
申请号:CN201710967274.1
申请日:2017-10-17
Applicant: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一用于川金丝猴亲子鉴定的SNP标记组合:(1)提取川金丝猴个体的基因组DNA;(2)飞行质谱检测SNP多态性;(3)利用软件进行亲子推断和个体识别。将本发明用于濒危动物的亲子鉴定和个体识别的前景十分广阔。本发明经过检测SNP多态性及亲子推断实验验证,无论是父子关系推断还是双亲推断,亲子关系都是极显著的,并且推断关系与实际亲缘关系完全吻合;本发明提供的SNP标记组合用于川金丝猴亲子鉴定,结果准确,可快速、高通量、简便的进行川金丝猴的亲子鉴定和个体识别。
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公开(公告)号:CN107779499A
公开(公告)日:2018-03-09
申请号:CN201710967276.0
申请日:2017-10-17
Applicant: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所
IPC: C12Q1/6869 , G06F19/22
CPC classification number: C12Q1/6869 , G06F19/22 , C12Q2521/313 , C12Q2525/191
Abstract: 本发明公开了一种川金丝猴个体遗传多样性监测方法,该方法包括以下步骤:(1)采集川金丝猴血液样品,提取血液样品的基因组DNA;(2)利用RAD-seq进行基因组DNA测序:(3)分析获取SNP位点;(4)进行种群遗传多样性监测;(5)选择SNP位点,基于亲缘关系建立繁殖群体的动态家庭关系。本发明利用获得的SNP位点,能够简便、准确、全面的获取川金丝猴个体的遗传信息和亲缘关系,有利于长期监测川金丝猴繁殖群体的遗传多样性和建立动态的繁殖家庭谱系。相对于已有的遗传标记方法,SNP位点的突变率高、位点数量多、分布广,能够获得更全面的遗传信息,结果更可靠,相对于全基因组测序,SNP位点简单、数据易于分析。
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公开(公告)号:CN107586856A
公开(公告)日:2018-01-16
申请号:CN201710967274.1
申请日:2017-10-17
Applicant: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一用于川金丝猴亲子鉴定的SNP标记组合:(1)提取川金丝猴个体的基因组DNA;(2)飞行质谱检测SNP多态性;(3)利用软件进行亲子推断和个体识别。将本发明用于濒危动物的亲子鉴定和个体识别的前景十分广阔。本发明经过检测SNP多态性及亲子推断实验验证,无论是父子关系推断还是双亲推断,亲子关系都是极显著的,并且推断关系与实际亲缘关系完全吻合;本发明提供的SNP标记组合用于川金丝猴亲子鉴定,结果准确,可快速、高通量、简便的进行川金丝猴的亲子鉴定和个体识别。
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