公开(公告)号：CN106167831A

公开(公告)日：2016-11-30

申请号：CN201610808729.0

申请日：2016-09-04

Applicant: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所

Inventor： 王圣洁 ,  林彩丽 ,  王胜坤 ,  田国忠 ,  于少帅 ,  王曦茁 ,  汪来发 ,  朴春根 ,  李永 ,  郭民伟

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/689 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q2531/119 ,  C12Q2563/107

Abstract: 本发明公开了检测枣疯病、槐树丛枝病和樱桃致死黄化植原体的LAMP引物组及其试剂盒和应用。本发明针对16SrV‑B组植原体tuf基因保守序列设计用于检测枣疯病、槐树丛枝病和樱桃致死黄化植原体的LAMP引物组。本发明还公开了一种枣疯病、槐树丛枝病和樱桃致死黄化植原体的LAMP检测试剂盒。本发明利用所述LAMP引物组建立一种枣疯病、槐树丛枝病和樱桃致死黄化植原体的LAMP检测方法，对待测样品DNA进行环介导等温扩增，根据扩增结果判定待测样品是否感染植原体。本发明所建立的检测方法能够用于枣疯病、槐树丛枝和樱桃致死黄化植原体的检测，较好区分不同组间及组内的植原体，具有稳定性好、特异性强和灵敏性高等优点。

公开(公告)号：CN106399490A

公开(公告)日：2017-02-15

申请号：CN201610801184.0

申请日：2016-09-04

Applicant: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所

Inventor： 林彩丽 ,  王圣洁 ,  王胜坤 ,  田国忠 ,  于少帅 ,  王曦茁 ,  汪来发 ,  朴春根 ,  李永 ,  郭民伟

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了检测植原体的LAMP引物组及其试剂盒和应用。本发明首先针对16SrI组植原体16S基因和tuf基因保守序列的6个区域分别设计6组和2组引物，最终得到特异性强的由SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4、SEQ ID No.5所示的核苷酸序列组成LAMP引物组。本发明进一步公开了用所述引物组制备得到的泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑萎缩、莴苣黄化和长春花绿变植原体的试剂盒并建立了检测方法，具有稳定性好、特异性强、灵敏度高等优点，可应用于泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑萎缩、莴苣黄化和长春花绿变植原体的检测。

公开(公告)号：CN108660239B

公开(公告)日：2022-03-18

申请号：CN201810312217.4

申请日：2018-04-09

Applicant: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所

Inventor： 于少帅 ,  赵文霞 ,  姚艳霞 ,  淮稳霞 ,  肖文发

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了新疆野苹果和栽培苹果的特异性SSR引物及其应用。本发明基于栽培苹果的全基因组序列，采用与苹果抗逆性相关的功能基因序列为模版，筛选获得15对在新疆野苹果和栽培苹果中扩增出特异性、稳定性、多态性的SSR目的条带的SSR引物，其核苷酸序列为SEQ ID No.1～30所示；本发明同时筛选获得只能在栽培苹果中特异性扩增出SSR目的条带的8对SSR引物。本发明SSR引物扩增的目的条带编码的蛋白产物已知，可应用于对新疆野苹果和栽培苹果进行遗传多样性、多态性或系统发育分析，揭示新疆野苹果和栽培苹果的遗传多样性和系统发育关系及获得的遗传变异对新疆野苹果和栽培苹果在生物学功能等方面的影响。

公开(公告)号：CN106399490B

公开(公告)日：2019-12-27

申请号：CN201610801184.0

申请日：2016-09-04

Applicant: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所

Inventor： 林彩丽 ,  王圣洁 ,  王胜坤 ,  田国忠 ,  于少帅 ,  王曦茁 ,  汪来发 ,  朴春根 ,  李永 ,  郭民伟

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了检测植原体的LAMP引物组及其试剂盒和应用。本发明首先针对16SrI组植原体16S基因和tuf基因保守序列的6个区域分别设计6组和2组引物，最终得到特异性强的由SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4、SEQ ID No.5所示的核苷酸序列组成LAMP引物组。本发明进一步公开了用所述引物组制备得到的泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑萎缩、莴苣黄化和长春花绿变植原体的试剂盒并建立了检测方法，具有稳定性好、特异性强、灵敏度高等优点，可应用于泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑萎缩、莴苣黄化和长春花绿变植原体的检测。

公开(公告)号：CN108660239A

公开(公告)日：2018-10-16

申请号：CN201810312217.4

申请日：2018-04-09

Applicant: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所

Inventor： 于少帅 ,  赵文霞 ,  姚艳霞 ,  淮稳霞 ,  肖文发

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11 ,  G06F19/24

Abstract: 本发明公开了新疆野苹果和栽培苹果的特异性SSR引物及其应用。本发明基于栽培苹果的全基因组序列，采用与苹果抗逆性相关的功能基因序列为模版，筛选获得15对在新疆野苹果和栽培苹果中扩增出特异性、稳定性、多态性的SSR目的条带的SSR引物，其核苷酸序列为SEQ ID No.1～30所示；本发明同时筛选获得只能在栽培苹果中特异性扩增出SSR目的条带的8对SSR引物。本发明SSR引物扩增的目的条带编码的蛋白产物已知，可应用于对新疆野苹果和栽培苹果进行遗传多样性、多态性或系统发育分析，揭示新疆野苹果和栽培苹果的遗传多样性和系统发育关系及获得的遗传变异对新疆野苹果和栽培苹果在生物学功能等方面的影响。