-
公开(公告)号:CN119979753A
公开(公告)日:2025-05-13
申请号:CN202510071504.0
申请日:2025-01-16
Applicant: 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 , 华智生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , C40B40/06
Abstract: 本申请涉及基因芯片技术领域,具体涉及马尾松SNP分子标记组合及其应用。所述SNP分子标记组合由113,709个SNP分子标记中组成,其中所述SNP分子标记的物理位置是基于油松的参考基因组Pinus.tabuliformis V1.0进行序列比对确定的。本发明实施例首次提供了包含共113,709个SNP位点的马尾松全基因组芯片,其具有高效率、低成本、遗传稳定性好等优点,可广泛应用于马尾松种质资源鉴定、育种材料遗传背景分析、基因定位、全基因组关联分析、全基因组选择育种、智能设计育种等不同应用场景。
-
公开(公告)号:CN115992205B
公开(公告)日:2025-05-09
申请号:CN202310159997.4
申请日:2023-02-23
Applicant: 华智生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种用于多样品pooling建库的接头、试剂盒及建库方法,所述接头包括接头正链和接头负链,所述接头正链的序列如SEQ ID NO.1所示,所述接头负链的序列如SEQ ID NO.2所示;所述接头正链和接头负链在退火后形成双链接头。本发明方案的通过对接头设计两级标签,在有效节约接头合成成本的基础上,极大地增加了可用接头数量,为大规模样品pooling测序提供足够多的接头,有效地解决多样品pooling测序时常发生的接头数量不足的问题,4‑10bp的内层标签序列的不等长接头,可用于但不限于普通PCR产物测序、多重PCR产物测序、基因编辑体后代大规模测序鉴定低深度重测序等二代测序文库构建。
-
公开(公告)号:CN119332011A
公开(公告)日:2025-01-21
申请号:CN202411582327.4
申请日:2024-11-07
Applicant: 华智生物技术有限公司 , 甘肃省敦煌种业集团股份有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12Q1/6837 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与玉米抗旱性相关的SNP分子标记及其应用,涉及农业分子生物学领域。SNP分子标记包括第一SNP分子标记、第二SNP分子标记中的至少一种;所述第一SNP分子标记位于玉米参考基因组Zea_mays.AGPv4的9号染色体97605381位的碱基处,多态性为C/T;所述第二SNP分子标记位于玉米参考基因组Zea_mays.AGPv4的9号染色体97604011位的碱基处,多态性为C/T。本发明的SNP分子标记具有高特异性、高灵敏度、高分辨力和高分型质量的特点;可以根据基因型快速判定玉米材料抗旱性的强弱,具有广泛的应用普适性,可以用于玉米育种。
-
公开(公告)号:CN118497397A
公开(公告)日:2024-08-16
申请号:CN202410696735.6
申请日:2024-05-31
Applicant: 华智生物技术有限公司 , 湖南省蔬菜研究所
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种中国南瓜SNP分子标记组合、SNP芯片及其应用,涉及生物技术领域。该南瓜SNP分子标记组合包括20213个SNP分子标记,所述20213个SNP分子标记的位点信息是基于南瓜参考基因组“Cmoschata_genome_v1.fa.gz”进行序列比对确定的,所述位点信息如说明书表1所示。其可以对南瓜品种资源分子标记指纹分析、对杂交群体后代基因型鉴定、对品种真实性鉴定、对育种材料遗传背景分析和筛选、对全基因组进行关联分析、对种质资源遗传多样性分析、亲缘关系鉴定,为南瓜高通量基因分型、基因定位、指纹印迹、全基因组选择等分子育种研究提供不可或缺的重要工具。
-
公开(公告)号:CN117587159B
公开(公告)日:2024-06-14
申请号:CN202311662361.8
申请日:2023-12-06
Applicant: 华智生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6837 , C12N15/11 , C40B40/06
Abstract: 本发明提供一种辣椒SNP分子标记组合、SNP芯片及其应用,所述SNP分子标记组合由高多态性和高检出率的51172个SNP分子标记组成,所述SNP分子标记由染色体分布均匀的的47589个SNP位点、3194个MNP标记位点和389个与辣椒抗病、辣椒果实颜色、辣椒辣味及辣椒雄性不育等重要农艺性状/基因相关的位点共同构成。结合分子标记本发明还研制出一种辣椒50K液相育种芯片。该芯片检测通量高、目标位点检出率高、分型结果准确可靠,可应用于辣椒新品种鉴定、分子标记辅助选择育种、基因定位、全基因组选择、群体遗传学、群体进化的分析。
-
公开(公告)号:CN117604151B
公开(公告)日:2024-05-17
申请号:CN202311610364.7
申请日:2023-11-28
Applicant: 华智生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域,公开了一种与甘蓝型油菜黑胫病基因BnRlm1紧密连锁的SNP分子标记及其应用。该SNP分子标记的SNP位点位于黑胫病基因BnRlm1的A07染色体上,用于黑胫病基因BnRlm1突变型的精准鉴定,这个标记分型质量高、单拷贝、高多态性,样本数据检出率>98%,可用于甘蓝型油菜的黑胫病抗性的育种改良的标记辅助育种,具有广泛的应用普适性。还公开了用于上述SNP分子标记的KASP标记引物和试剂盒以及鉴定甘蓝型油菜黑胫病基因BnRlm1的应用,方法简单、自动化程度高、检测通量高、速度快、检测结果准确、重复性和稳定性好。
-
公开(公告)号:CN117965770A
公开(公告)日:2024-05-03
申请号:CN202410193730.1
申请日:2024-02-21
Applicant: 华智生物技术有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12N15/113 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于检测对虾急性肝胰腺坏死病的试剂盒及其应用;所述试剂盒中包含crRNA,所述crRNA包括crRNA2、crRNA3、crRNA4和crRNA5中的至少一种。本发明方案通过将RPA技术与CRISPR/Cas12a系统联合,针对AHPND的毒力基因PirVPA设计特异性的检测位点,先通过等温扩增目的片段,再通过CRISPR检测体系特异性识别检测位点和剪切反应,最后通过试纸条或者荧光信号的方式呈现检测结果,检测快速、灵敏、特异,且不依赖大型实验设备,能将结果可视化展示,为各实验室和养殖企业提供一种快速检测AHPND的方法选择。
-
公开(公告)号:CN117604151A
公开(公告)日:2024-02-27
申请号:CN202311610364.7
申请日:2023-11-28
Applicant: 华智生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域,公开了一种与甘蓝型油菜黑胫病基因BnRlm1紧密连锁的SNP分子标记及其应用。该SNP分子标记的SNP位点位于黑胫病基因BnRlm1的A07染色体上,用于黑胫病基因BnRlm1突变型的精准鉴定,这个标记分型质量高、单拷贝、高多态性,样本数据检出率>98%,可用于甘蓝型油菜的黑胫病抗性的育种改良的标记辅助育种,具有广泛的应用普适性。还公开了用于上述SNP分子标记的KASP标记引物和试剂盒以及鉴定甘蓝型油菜黑胫病基因BnRlm1的应用,方法简单、自动化程度高、检测通量高、速度快、检测结果准确、重复性和稳定性好。
-
公开(公告)号:CN117165708A
公开(公告)日:2023-12-05
申请号:CN202311125360.X
申请日:2023-09-01
Applicant: 华智生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于油菜育种领域,公开了一种高通量检测油菜抗草甘膦除草剂品系RT73的KASP分子标记引物及应用。该KASP分子标记引物包括BN‑RT73.1标记引物和BN‑RT73.2标记引物,每组标记有三条引物,其核苷酸序列如1~6所示。利用此标记引物可进行油菜抗草甘膦除草剂品系RT73的检测和鉴定,以及用于油菜抗除草剂品系RT73分子辅助育种选择。可准确识别含有EPSPS基因的外源序列插入替换了油菜35bp原序列,且利用自动化仪器检测通量高,一天内可完成上万份材料的检测,通量高、反应体系小,成本低于现有的分子检测方法,实现快速、高效、低成本、精准检测鉴定油菜抗草甘膦除草剂品系RT73。
-
公开(公告)号:CN116445642A
公开(公告)日:2023-07-18
申请号:CN202310114321.3
申请日:2023-02-14
Applicant: 华智生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , C40B40/06
Abstract: 本发明公开了一种与稻瘟病抗性相关基因Pia连锁的SNP分子标记及其应用,所述SNP分子标记位于日本晴11号染色体6543758位的碱基处,多态性为C/G。本发明利用与Pia基因连锁的特异性SNP分子标记,结合KASP检测技术,解决传统分子标记辅助育种中的技术问题,无需琼脂糖凝胶电泳,可快速、准确、高效、高通量的鉴定Pia基因,加快抗稻瘟病新品种的选育进程。
-
-
-
-
-
-
-
-
-