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公开(公告)号：CN118899035A
公开(公告)日：2024-11-05
申请号：CN202410865025.1
申请日：2024-06-28
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 普瑞基准科技(北京)有限公司
IPC: G16B25/10 , G16B40/00 , G16B45/00 , G06N20/10 , G06F18/2411
Abstract: 本发明公开了子宫病变诊断生物标志物的筛选方法及机器学习模型判别方法，属于生物标志物技术领域。该方法基于肿瘤教育血小板转录组测序数据，通过特征筛选得到用于区分子宫肌瘤和子宫肉瘤样本的特征基因，并利用此特征基因构建了用于区分子宫肌瘤和子宫肉瘤样本的支持向量机模型。该模型在独立测试集上表现优良，AUC值达到了0.78±0.02。采用本发明提供的技术方案，可以仅对患者的肿瘤教育血小板的基因表达进行检测，就能在临床应用中实现子宫病变的无创检测；另外筛选得到的生物标志物数量精简，既包含了综合的信息也避免了较高的检测成本，可以通过qPCR技术进行检测。
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公开(公告)号：CN117964711B
公开(公告)日：2024-06-11
申请号：CN202410387628.5
申请日：2024-04-01
Applicant: 中国科学院生物物理研究所 , 普瑞基准科技(北京)有限公司
IPC: C07K14/00 , C07K7/08 , C07K7/06 , C07K1/04 , C07K1/06 , G16B35/00 , A61K38/16 , A61K38/10 , A61K38/08 , A61P31/04
Abstract: 本发明公开了非天然抗菌肽及其应用，属于生物技术领域。抗菌肽的氨基酸序列如SEQ ID NO:01~SEQ ID NO:34中的任意一种所示。本发明中采用人工智能模型得到的34种非天然抗菌肽，经过实验验证对至少一种革兰氏阳性或革兰氏阴性细菌具有抗菌活性，其中6种具有广谱抗菌功效，而且其中的广谱肽之一的AMP_2显示出强大的抗菌活性。所以，本发明提供的技术方案，不仅在现有的天然抗菌肽的基础上扩大了范围，而且为扩大抗菌肽在临床中的广泛应用提供了一定的支撑，对提高抗菌肽的使用效果具有非常重要的意义。
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公开(公告)号：CN117809749A
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202410223684.5
申请日：2024-02-28
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 中国科学院生物物理研究所
Abstract: 本发明公开了功能多肽序列的生成方法、装置、存储器和电子设备，属于蛋白质设计技术领域。生成方法包括：获取训练数据；将训练数据中的目的功能多肽序列编码为二维特征矩阵，利用二维特征矩阵训练功能多肽序列特征生成模型，得到训练好的功能多肽序列特征生成模型；利用训练好的功能多肽序列特征生成模型，通过调整噪音的采样方法生成多种新的功能多肽序列的二维特征矩阵；将各个新的功能多肽序列的二维特征矩阵解码为对应的新的功能多肽序列。本发明充分利用预训练的蛋白质大语言模型的特征提取能力及生成式模型的生成能力，通过有效提取特定类别的功能多肽的序列特征，达到从头合成无模板、目标结构未知的多样性的功能多肽或蛋白质序列的目的。
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公开(公告)号：CN115064209B
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202210988485.4
申请日：2022-08-17
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
Abstract: 本发明公开一种恶性细胞鉴定方法及系统，所述方法包括：获取单细胞转录组测序数据；基于单细胞转录组测序数据计算基因拷贝数变异鉴定恶性细胞所需的数据，并基于数据确定基因拷贝数变异的方向、程度以及等位基因失衡程度；基于基因拷贝数变异的方向、程度以及等位基因失衡程度进行第一细胞聚类确定首次确定的疑似非恶性细胞和疑似恶性细胞；基于首次确定的疑似非恶性细胞和疑似恶性细胞，根据肿瘤特征分值与非肿瘤特征分值进行第二细胞聚类确定最终的非恶性细胞和恶性细胞。本发明还公开了对应的电子设备以及计算机可读存储介质，融合监督性和非监督性两大技术路线，不依赖肿瘤组织和癌旁组织群细胞转录组测序数据，提高了对恶性细胞鉴定敏感性。
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公开(公告)号：CN113684274B
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202010421637.3
申请日：2020-05-18
Applicant: 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 普瑞基准科技(北京)有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及用于女性恶性生殖细胞肿瘤诊断和治疗试剂盒，所述试剂盒包括OVOL2表达水平的检测试剂以及用于化疗的顺铂药物。通过采用本发明用于女性恶性生殖细胞肿瘤诊断和治疗试剂盒，有助于提早预测女性恶性生殖细胞肿瘤对顺铂化疗的敏感程度，从而优化治疗方案，减少不必要的化疗，提高患者生活质量的同时改善患者的预后。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114561472A
公开(公告)日：2022-05-31
申请号：CN202210452387.9
申请日：2022-04-27
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用，包括成套DNA探针，所述成套DNA探针包括SEQ ID NO：1‑SEQ ID NO：360所示的DNA探针。本发明是可以检测90基因的试剂盒（Panel产品），可一次性对目前已经被美国食品药品监督管理局（FDA）/国家药品监督管理局（NMPA）批准上市的实体瘤靶向药物或免疫检查点抑制剂所对应的生物标志物进行检测。通过采集受检者的肿瘤组织样本及全血样本，进行肿瘤含量评估、DNA提取、建库、捕获、测序、生物信息学分析、医学解读，从而找到可用于指导精准治疗的生物标志物。
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公开(公告)号：CN114525344A
公开(公告)日：2022-05-24
申请号：CN202210426612.1
申请日：2022-04-22
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用，包括成套DNA探针，所述成套DNA探针包括SEQ ID NO：1‑SEQ ID NO：320所示的DNA探针。本发明是可以检测80基因的试剂盒（Panel产品），可一次性对目前已经美国食品药品监督管理局（FDA）/国家药品监督管理局（NMPA）批准上市的实体瘤靶向药物或免疫检查点抑制剂所对应的生物标志物进行检测。通过采集受检者的肿瘤组织样本及全血样本，进行肿瘤含量评估、DNA提取、建库、捕获、测序、生物信息学分析、医学解读，从而找到可用于指导精准治疗的生物标志物。
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公开(公告)号：CN110607371B
公开(公告)日：2022-05-06
申请号：CN201910971098.8
申请日：2019-10-14
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及一种胃癌标志物及其应用，特别是C10orf71基因、C10orf71蛋白、C10orf71基因检测引物试剂盒中的至少一种在制备用于预测GC患者对新辅助化疗的响应的产品中的应用。本发明首次确定了C10orf71基因突变为与肿瘤对新辅助化疗响应的关键分子特征，基于本发明的技术方案，新辅助化学疗法在改善预后以及在治疗开始之前确定响应性患者方面具有优势，因此可以制定更好的治疗方案。本发明的方案针对个别GC患者优化治疗策略的重要一步。
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公开(公告)号：CN114373550A
公开(公告)日：2022-04-19
申请号：CN202210275508.7
申请日：2022-03-21
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
Abstract: 本发明公开一种基于分子结构及基因表达的药物IC50深度学习模型预测方法，包括：建立预测药物在不同细胞系中的IC50的深度学习模型；基于深度学习模型进行药物在不同细胞系中的IC50的预测。还公开了预测系统、电子设备及计算机可读存储介质，使用语法变异自动编码器编码药物的化学分子式与使用变异自动编码器编码细胞系表达数据，通过神经网络的方法预测药物在不同细胞系中的IC50，可以直接通过药物的分子信息，预测出药物在不同种类癌症细胞系中IC50的值，可以一定程度上减少临床前开发的资金与时间投入。将模型运用在患者中，可以帮助筛选出药物的适用人群，减少不必要的临床实验，进而提高临床实验的成功率。
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公开(公告)号：CN113699232A
公开(公告)日：2021-11-26
申请号：CN202011357645.2
申请日：2020-11-26
Applicant: 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 普瑞基准科技(北京)有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及一种早期诊断胆囊癌的试剂盒及其应用，所述试剂盒包括：CTNNB1突变检测试剂和ARID2突变检测试剂。本发明确定衰老是促成累积的突变的主要因素以及这些肿瘤中CTNNB1和ARID2突变，特别是CTNNB1突变起到关键作用。本发明通过重构胆囊癌转化和癌变演变轨迹的理解，为胆囊癌的早期诊断和有效治疗奠定了基础。
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