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公开(公告)号：CN102495977B
公开(公告)日：2015-05-27
申请号：CN201110414015.9
申请日：2011-12-13
Applicant: 中国农业科学院烟草研究所
IPC: G06F19/24
Abstract: 本发明公开了一种生物基因组简单重复序列的发掘方法，其特征在于，包括以下步骤：根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式；通过所述正则表达式分析待分析序列，判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR，如果判断结果为是，则输出所述目标SSR；如果判断结果为否，则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。因此，本发明提供的生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备，在对SSR发掘过程中，不会产生冗余结果，从而降低了SSR发掘过程的配置复杂度，提高了SSR发掘的效率，降低了SSR发掘软件的开发难度。
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公开(公告)号：CN101899530B
公开(公告)日：2013-02-06
申请号：CN200910229910.6
申请日：2009-11-05
Applicant: 中国农业科学院烟草研究所
Abstract: 本发明提供一种烟草普通花叶病毒环介导等温扩增检测方法，包括步骤1)：提供两对用于检测烟草普通花叶病毒的LAMP引物序列，即长度分别为45bp、44bp、20bp和20bp的寡聚核苷酸序列，上游引物1、下游引物1、上游引物2和下游引物2，上述两对LAMP引物的寡聚核苷酸序列如下：上游引物1：5’-GCACCACGTGTGATTACGGACATTTTGACCTCTGGTCCTGCAACT-3’，下游引物1：5’-AAGGGTTGTGTCTTGGATCGCGTTTTTTACGTGCCTGCGGATGT-3’，上游引物2：5’-CGAGAGCTCTTCTGGTTTGG-3’，下游引物2：5’-GATTCGAACCCCTCGCTTTA-3’，还包括步骤2)：提供一种烟草普通花叶病毒的LAMP检测方法，即首先从待检测样品中制备反应模板，并配制LAMP反应体系，然后通过LAMP反应程序对反应模板进行扩增，最后根据反应混合物的颜色显示对检测结果进行判断。
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公开(公告)号：CN102140542A
公开(公告)日：2011-08-03
申请号：CN201110047406.1
申请日：2011-02-28
Applicant: 中国农业科学院烟草研究所
Abstract: 本发明涉及病毒检测领域，具体涉及马铃薯Y病毒(Potato virus Y，简称PVY)的快速高灵敏检测试剂盒及其检测方法。该快速检测试剂盒包含采样管、漂洗管、核酸变性管、扩增检测管、阴性对照管、阳性对照管、快速干燥液、分别封装于无菌袋中的FTA膜片、研磨棒、牙签和吸管等，形成的检测方法简化了操作步骤，降低了实验成本，在田间或室内具有更强的实用性。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101899530A
公开(公告)日：2010-12-01
申请号：CN200910229910.6
申请日：2009-11-05
Applicant: 中国农业科学院烟草研究所
Abstract: 本发明提供一种烟草普通花叶病毒环介导等温扩增检测方法，包括步骤1)：提供两对用于检测烟草普通花叶病毒的LAMP引物序列，即长度分别为45bp、44bp、20bp和20bp的寡聚核苷酸序列，上游引物1、下游引物1、上游引物2和下游引物2，上述两对LAMP引物的寡聚核苷酸序列如下：上游引物1：5’-GCACCACGTGTGATTACGGACATTTTGACCTCTGGTCCTGCAACT-3’下游引物1：5’-AAGGGTTGTGTCTTGGATCGCGTTTTTTACGTGCCTGCGGATGT-3’上游引物2：5’-CGAGAGCTCTTCTGGTTTGG-3’下游引物2：5’-GATTCGAACCCCTCGCTTTA-3’还包括步骤2)：提供一种烟草普通花叶病毒的LAMP检测方法，即首先从待检测样品中制备反应模板，并配制LAMP反应体系，然后通过LAMP反应程序对反应模板进行扩增，最后根据反应混合物的颜色显示对检测结果进行判断。
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公开(公告)号：CN105002158B
公开(公告)日：2018-04-24
申请号：CN201510227440.5
申请日：2015-05-06
Applicant: 中国农业科学院烟草研究所
IPC: C12N15/10 , C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 一种野生烟草SSR指纹图谱及其构建方法和应用，包括：选取多种核心野生烟草种质；提取核心野生烟草种质的DNA；用烟草核心引物进行核心野生烟草种质DNA的PCR扩增；电泳检测并根据检测结果确定理想引物组合构建指纹图谱。本发明建立了快速简便、经济实用、稳定可靠的构建野生烟草DNA指纹图谱和利用分子标记鉴定野生烟草资源的标准实验体系。其次，从54对烟草核心引物中筛选出了3对适用于野生烟草的特异性强、分辨率高、重复性好的SSR引物，并用这些引物构建了一种适用于野生烟草种质鉴定SSR指纹图谱。仅用3对SSR引物便可完全区分30份核心野生烟草种质，在时间上提高了试验效率，经济上节约了测试成本，与传统检测方法相比，具有快速、准确、经济等优势。
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公开(公告)号：CN102495977A
公开(公告)日：2012-06-13
申请号：CN201110414015.9
申请日：2011-12-13
Applicant: 中国农业科学院烟草研究所
IPC: G06F19/24
Abstract: 本发明公开了一种生物基因组简单重复序列的发掘方法，其特征在于，包括以下步骤：根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式；通过所述正则表达式分析待分析序列，判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR，如果判断结果为是，则输出所述目标SSR；如果判断结果为否，则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。因此，本发明提供的生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备，在对SSR发掘过程中，不会产生冗余结果，从而降低了SSR发掘过程的配置复杂度，提高了SSR发掘的效率，降低了SSR发掘软件的开发难度。
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公开(公告)号：CN102140542B
公开(公告)日：2013-07-17
申请号：CN201110047406.1
申请日：2011-02-28
Applicant: 中国农业科学院烟草研究所
Abstract: 本发明涉及病毒检测领域，具体涉及马铃薯Y病毒(Potato virus Y，简称PVY)的快速高灵敏检测试剂盒及其检测方法。该快速检测试剂盒包含采样管、漂洗管、核酸变性管、扩增检测管、阴性对照管、阳性对照管、快速干燥液、分别封装于无菌袋中的FTA膜片、研磨棒、牙签和吸管等，形成的检测方法简化了操作步骤，降低了实验成本，在田间或室内具有更强的实用性。
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公开(公告)号：CN105002158A
公开(公告)日：2015-10-28
申请号：CN201510227440.5
申请日：2015-05-06
Applicant: 中国农业科学院烟草研究所
Abstract: 一种野生烟草SSR指纹图谱及其构建方法和应用，包括：选取多种核心野生烟草种质；提取核心野生烟草种质的DNA；用烟草核心引物进行核心野生烟草种质DNA的PCR扩增；电泳检测并根据检测结果确定理想引物组合构建指纹图谱。本发明建立了快速简便、经济实用、稳定可靠的构建野生烟草DNA指纹图谱和利用分子标记鉴定野生烟草资源的标准实验体系。其次，从54对烟草核心引物中筛选出了3对适用于野生烟草的特异性强、分辨率高、重复性好的SSR引物，并用这些引物构建了一种适用于野生烟草种质鉴定SSR指纹图谱。仅用3对SSR引物便可完全区分30份核心野生烟草种质，在时间上提高了试验效率，经济上节约了测试成本，与传统检测方法相比，具有快速、准确、经济等优势。
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