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公开(公告)号:CN110534159B
公开(公告)日:2023-08-29
申请号:CN201910662841.1
申请日:2019-07-22
Applicant: 中国人民解放军总医院
Abstract: 本发明涉及一种基因疾病关联分析系统的构建方法、装置、计算机设备和存储介质,所述方法包括:获取与每一种预设的疾病相关的基因数据;根据与每一种预设的疾病相关的基因数据,通过预训练的机器学习模型,构建与每一种预设的疾病对应的基因疾病数据表;根据与每一种预设的疾病对应的基因疾病数据表,构建基因疾病关联数据库;将基因疾病关联数据库进行图形化展示,以构建基因疾病关联分析系统。通过上述方法,可以构建一系统性、高质量的基因疾病关联分析系统,通过该系统,用户可以非常直观和便捷的根据某一类疾病的疾病名称或临床特征筛选出与该疾病相关联的候选基因,进而发现、识别某一类疾病在发生发展过程中的调控基因。
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公开(公告)号:CN110534159A
公开(公告)日:2019-12-03
申请号:CN201910662841.1
申请日:2019-07-22
Applicant: 中国人民解放军总医院
Abstract: 本发明涉及一种基因疾病关联分析系统的构建方法、装置、计算机设备和存储介质,所述方法包括:获取与每一种预设的疾病相关的基因数据;根据与每一种预设的疾病相关的基因数据,通过预训练的机器学习模型,构建与每一种预设的疾病对应的基因疾病数据表;根据与每一种预设的疾病对应的基因疾病数据表,构建基因疾病关联数据库;将基因疾病关联数据库进行图形化展示,以构建基因疾病关联分析系统。通过上述方法,可以构建一系统性、高质量的基因疾病关联分析系统,通过该系统,用户可以非常直观和便捷的根据某一类疾病的疾病名称或临床特征筛选出与该疾病相关联的候选基因,进而发现、识别某一类疾病在发生发展过程中的调控基因。
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公开(公告)号:CN111009290B
公开(公告)日:2023-10-31
申请号:CN201911288949.5
申请日:2019-12-12
Applicant: 中国人民解放军总医院
Abstract: 本申请涉及一种高原适应性检测模型的训练方法、适应性识别方法和装置,其中模型的训练方法包括:获取第一样本生物样品集,通过表观遗传学测序方法获取第一样本生物样品集中每一个样本生物样品的第一样本甲基化表达谱;基于第一样本甲基化表达谱训练深度神经网络,以得到高原适应性检测模型。其通过第一样本生物样品集的表观遗传标记物训练深度神经网络,以得到高原适应性检测模型,进而利用该模型对待识别生物样品的甲基化表达谱进行识别,从而得到待识别生物样品的高原适应性识别结果,对预测和预防高原缺氧性疾病具有重大意义。
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公开(公告)号:CN114093411A
公开(公告)日:2022-02-25
申请号:CN202111430273.6
申请日:2021-11-29
Applicant: 中国人民解放军总医院
IPC: G16B10/00 , G16B20/20 , G16H50/20 , G06K9/62 , G06N3/04 , G06N3/08 , C12Q1/6883 , C12Q1/6886 , C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/04
Abstract: 本发明涉及基于样本的微生物群体的进化关系和丰度信息的分析方法及设备。包括:获取样本的微生物群体的遗传信息,构建样本的微生物群体的系统发育树,根据所述系统发育树提取所述微生物群体间的进化关系的特征;获取样本的微生物群体的丰度信息,提取所述微生物群体的丰度信息的特征;将所述微生物群体间的进化关系的特征与所述微生物群体的丰度信息的特征融合,得到特征集;将所述特征集输入到分类器中,得到样本的分类结果。本发明方法整合微生物系统发育树提供的微生物的进化信息和微生物的丰度信息,从深层次挖掘隐含在微生物数据背后的生命规律,具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN114093411B
公开(公告)日:2022-08-09
申请号:CN202111430273.6
申请日:2021-11-29
Applicant: 中国人民解放军总医院
IPC: G16B10/00 , G16B20/20 , G16H50/20 , G06K9/62 , G06N3/04 , G06N3/08 , C12Q1/6883 , C12Q1/6886 , C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/04
Abstract: 本发明涉及基于样本的微生物群体的进化关系和丰度信息的分析方法及设备。包括:获取样本的微生物群体的遗传信息,构建样本的微生物群体的系统发育树,根据所述系统发育树提取所述微生物群体间的进化关系的特征;获取样本的微生物群体的丰度信息,提取所述微生物群体的丰度信息的特征;将所述微生物群体间的进化关系的特征与所述微生物群体的丰度信息的特征融合,得到特征集;将所述特征集输入到分类器中,得到样本的分类结果。本发明方法整合微生物系统发育树提供的微生物的进化信息和微生物的丰度信息,从深层次挖掘隐含在微生物数据背后的生命规律,具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN114664382A
公开(公告)日:2022-06-24
申请号:CN202210462384.3
申请日:2022-04-28
Applicant: 中国人民解放军总医院
Abstract: 本申请公开了一种多组学联合分析方法、装置及计算设备。其中,方法,包括:将第一组学数据集输入第一机器学习模型中得到第一组学候选特征集;将第二组学数据集输入第二机器学习模型中得到第二组学候选特征集;以第一组学候选特征集为特征向量、第二组学候选特征集为标签,输入至机器学习回归训练模型进行训练,获得最优机器学习回归训练模型,并利用SHAP值将第二组学候选特征集中每一种特征筛选对应的第一组学候选特征集的前N个特征,得到不同的第一组学特征和不同的第二组学特征之间的调控关系。本申请实施例,能够更好地拟合如肠道宏基因组和代谢组的相互作用,可以从双向找出两种组学关联的相互作用,对于后期的精准医疗提供重要的参考。
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公开(公告)号:CN109797212B
公开(公告)日:2021-02-05
申请号:CN201910088721.5
申请日:2019-01-30
Applicant: 中国人民解放军总医院 , 北京迈基诺基因科技股份有限公司
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6809
Abstract: 本发明提供了一种检测肺动脉高压的致病和/或易感基因的试剂在制备诊断肺动脉高压的产品中的应用,所述的试剂可以捕获与肺动脉高压的致病和/或易感的多种基因,可最多检测27个相关基因。本发明所述的试剂、含有试剂的产品可以解释肺动脉高压患者的病因,评估患有肺动脉高压的风险、危险因素,为患病个体分子遗传学诊断,高发人群普查、筛查家属中的发病高危人群以及进行相应的遗传咨询及产前诊断干预提供参考,以期减少肺动脉高压的发病率。同时,本发明所述的探针组、芯片及试剂盒具有高效、检测位点多、准确、操作简便、特异性好、灵敏度高、快速、实用性强且成本低廉的优势。
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公开(公告)号:CN114664382B
公开(公告)日:2023-01-31
申请号:CN202210462384.3
申请日:2022-04-28
Applicant: 中国人民解放军总医院
Abstract: 本申请公开了一种多组学联合分析方法、装置及计算设备。其中,方法,包括:将第一组学数据集输入第一机器学习模型中得到第一组学候选特征集;将第二组学数据集输入第二机器学习模型中得到第二组学候选特征集;以第一组学候选特征集为特征向量、第二组学候选特征集为标签,输入至机器学习回归训练模型进行训练,获得最优机器学习回归训练模型,并利用SHAP值将第二组学候选特征集中每一种特征筛选对应的第一组学候选特征集的前N个特征,得到不同的第一组学特征和不同的第二组学特征之间的调控关系。本申请实施例,能够更好地拟合如肠道宏基因组和代谢组的相互作用,可以从双向找出两种组学关联的相互作用,对于后期的精准医疗提供重要的参考。
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