公开(公告)号：CN114627970A

公开(公告)日：2022-06-14

申请号：CN202210252085.7

申请日：2022-03-15

Applicant: 中南大学湘雅医院

Inventor： 陈永恒 ,  谭裕莹 ,  卢礼卿 ,  梁旭俊 ,  李茂玉 ,  陈主初

IPC: G16B50/30 ,  G16B5/00 ,  G16H10/60 ,  G16H70/60

Abstract: 本发明公开了一种结肠腺癌的焦亡相关lncRNA预后模型及其构建方法和应用，构建方法包括：S1、从TCGA数据库获取结肠腺癌的转录组数据、miRNA数据及患者临床数据；S2、筛选得到DEmRNAs、DElncRNAs和DEmiRNAs；S3、根据数据库筛选出焦亡相关mRNAs及相关联的焦亡相关miRNAs和焦亡相关lncRNAs，构建焦亡相关ceRNA网络；S4、将焦亡相关lncRNAs与临床数据进行整合，进行单因素Cox回归分析，得到与结肠腺癌生存相关的lncRNA；S5、根据LASSO回归分析建立焦亡相关lncRNA预后模型。本发明实现通过焦亡相关lncRNA对结肠腺癌进行预后判定。