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公开(公告)号：CN102559864A
公开(公告)日：2012-07-11
申请号：CN201110291304.4
申请日：2011-09-29
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及可进行单分子核酸扩增的颗粒、其制备方法及应用。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒，表面结合有多条单链核酸和一条双链核酸，所述双链核酸通过其中一条序列的一端与颗粒表面连接，并可作为双链接头与待测序核酸、以及末端双链接头顺序连接，然后变性形成一条单链核酸分子模板，所述单链核酸分子模板可以以颗粒表面的单链核酸作为引物进行有效PCR扩增，在颗粒表面形成多条双链测序模板，再将所述多条双链测序模板转化为多条单链测序模板后用于检测待测序核酸的信息。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒的制备方法为：(1)使单链核酸连接到所述颗粒表面；(2)使所述每颗颗粒表面至多连接一条双链核酸。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119360962A
公开(公告)日：2025-01-24
申请号：CN202411509201.4
申请日：2024-10-28
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种m6A甲基化高通量测序数据的自动化分析方法，包括如下步骤：步骤1、获取待分析下机原始数据，创建项目基本信息文件；步骤2、创建conda运行环境变量配置文件environment.yml以及Docker环境构建脚本Dockerfile，将两者置入流程配置文件nextflow.config；步骤3、设置m6A甲基化高通量测序数据自动化数据分析基础模块的生物信息分析脚本；步骤4、按照m6A甲基化高通量测序数据自动化数据分析基础模块之间的依赖关系，配置测序数据分析模块子模块的执行顺序和并行条件；步骤5、根据nextflow.config配置文件运行参数设定，对测序数据分析模块子模块运行队列进行检查，判断是否满足依赖关系；若满足则执行；若不满足，则返回错误；步骤6、查看结果输出和运行日志。本发明基于Nextflow流程框架，具有项目可移植性，可进行批量项目分析，便于控制分析内容。
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公开(公告)号：CN101633961A
公开(公告)日：2010-01-27
申请号：CN200910184434.0
申请日：2009-08-14
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 循环“连接-延伸”DNA测序方法，基于SOLiD测序技术的连接法测序原理，采用一条测序引物连接一段通用寡核苷酸后，通过延伸一个碱基检测DNA模板对应位置的碱基信息，然后将标记物从测序引物连接的寡核苷酸中某个位置切割，按照同样的方法再连接相同的寡核苷酸后延伸一个标记单体，依次可以测定DNA模板上若干间隔位置的碱基信息；将上一完成若干间隔位置碱基序列测定的测序引物通过变性或消化法清除，更换新测序引物，同样按照“连接-延伸”法测定DNA模板上其它若干间隔位置的碱基信息；循环更换测序引物，最后将这些测序引物确定的间隔位置碱基信息组合得到DNA模板某个片段全部碱基的排列信息，实现DNA序列检测。
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公开(公告)号：CN102559864B
公开(公告)日：2014-04-16
申请号：CN201110291304.4
申请日：2011-09-29
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及可进行单分子核酸扩增的颗粒、其制备方法及应用。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒，表面结合有多条单链核酸和一条双链核酸，所述双链核酸通过其中一条序列的一端与颗粒表面连接，并可作为双链接头与待测序核酸、以及末端双链接头顺序连接，然后变性形成一条单链核酸分子模板，所述单链核酸分子模板可以以颗粒表面的单链核酸作为引物进行有效PCR扩增，在颗粒表面形成多条双链测序模板，再将所述多条双链测序模板转化为多条单链测序模板后用于检测待测序核酸的信息。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒的制备方法为：(1)使单链核酸连接到所述颗粒表面；(2)使所述每颗颗粒表面至多连接一条双链核酸。
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公开(公告)号：CN101633961B
公开(公告)日：2013-01-02
申请号：CN200910184434.0
申请日：2009-08-14
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 循环“连接-延伸”DNA测序方法，基于SOLiD测序技术的连接法测序原理，采用一条测序引物连接一段通用寡核苷酸后，通过延伸一个碱基检测DNA模板对应位置的碱基信息，然后将标记物从测序引物连接的寡核苷酸中某个位置切割，按照同样的方法再连接相同的寡核苷酸后延伸一个标记单体，依次可以测定DNA模板上若干间隔位置的碱基信息；将上一完成若干间隔位置碱基序列测定的测序引物通过变性或消化法清除，更换新测序引物，同样按照“连接-延伸”法测定DNA模板上其它若干间隔位置的碱基信息；循环更换测序引物，最后将这些测序引物确定的间隔位置碱基信息组合得到DNA模板某个片段全部碱基的排列信息，实现DNA序列检测。
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公开(公告)号：CN117802212A
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202311817079.2
申请日：2023-12-27
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6874
Abstract: 本发明公开了一种基于全覆盖捕获芯片的RNA空间甲基化测序方法，本发明利用空间交错编码策略制作全覆盖的空间位置信息编码芯片，进而利用空间原位捕获策略对组织切片进行高通量的全转录组RNA甲基化原位分析，实现了单细胞分辨率下、空间全转录组RNA甲基化的全覆盖，同时保留了甲基化的空间位置信息，提高空间分辨率及降低科研成本，可用于器官或组织的全覆盖精确RNA甲基化转录组图谱或时空图谱的构建。
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