公开(公告)号：CN119132389A

公开(公告)日：2024-12-13

申请号：CN202411113195.0

申请日：2024-08-14

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 章天骄 ,  赵中乾 ,  汪国华

IPC: G16B20/20 ,  G16B25/10 ,  G16B40/00 ,  G06N5/04 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明提出一种单细胞测序数据的生成方法，包括：S1：构建深度神经网络模型；S2：获取scRNA‑seq综合数据集；S3、对所述scRNA‑seq综合数据集进行预处理；S4：基于预处理后的scRNA‑seq综合数据集对深度神经网络模型进行训练；S5：基于训练后的深度神经网络模型对待测数据的特征进行加噪、去噪和重构，生成单细胞测序数据。本发明在多种测序平台的数据集上，深度神经网络模型都能生成高质量的scRNA‑seq数据。通过与其它最新的数据生成模型进行比较深度神经网络模型在多个评价指标上均表现出更优秀的性能。此外，深度神经网络模型还能够模拟伪时间尺度下的单细胞数据，为追踪细胞分化和发育轨迹、分析细胞间的通讯、揭示细胞的异质性等分析提供高质量的数据支持。