一种基于元分析构建基因调控网络的方法

    公开(公告)号:CN116403650A

    公开(公告)日:2023-07-07

    申请号:CN202310386770.3

    申请日:2023-04-12

    Inventor: 梁潇 孙善文

    Abstract: 一种基于元分析构建基因调控网络的方法,为了解决基因调控网络通过合并多个研究的数据扩大样本量,但不同研究数据之间并不完全是同质的,导致基因调控网络误差大,准确率低的问题,它包括对获取的每个转录组学基因表达数据集进行元分析,获得显著差异基因列表;根据转录组学基因表达数据所属的物种获取转录因子基因列表,根据转录因子基因列表和显著差异基因生成核心基因列表;计算每个核心基因与每个显著差异基因的皮尔逊相关系数,根据皮尔逊相关系数构建共表达网络;对共表达网络聚类,得到多个核心基因高相关的差异基因模块;结合生物学知识与结构方程模型,根据每个模块构建对应的基因调控网络。属于基因调控网络领域。

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