公开(公告)号：CN119274661A

公开(公告)日：2025-01-07

申请号：CN202411316315.7

申请日：2024-09-20

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 滕志霞 ,  李青琪 ,  汪国华

IPC: G16B40/20 ,  G16B50/10 ,  G16B20/00 ,  G06F18/213 ,  G06F18/24 ,  G06F18/25 ,  G06N5/02 ,  G06N3/042 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/088

Abstract: 基于图注意力的lncRNA功能预测方法、存储介质及设备，属于生物信息技术学领域。为了解决现有lncRNA功能预测方法中先验的lncRNA功能注释数据很少，需要借用蛋白质功能注释数据来间接预测lncRNA的功能导致准确率较低的问题。本发明首先运用基于交叉注意力机制的图对比学习方法提取多种lncRNA相似性信息，生成综合相似性矩阵；然后利用知识图谱嵌入模型提取GO图中GO术语的特征，生成GO语义相似性矩阵；最后构建GCN和GAT结合的图表示学习模型学习到lncRNA和GO的特征，采用KAN分类器预测lncRNA的GO功能注释信息。本发明所提出的方法能够有效提升lncRNA功能预测的准确率。