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公开(公告)号：CN116959562A
公开(公告)日：2023-10-27
申请号：CN202310852512.X
申请日：2023-07-12
Applicant: 东北林业大学
IPC: G16B20/30 , G16B45/00 , G06F18/2413
Abstract: 一种识别疾病表型相关的细胞亚群的方法，属于生物医学领域。为识别疾病表型相关的细胞亚群，本发明收集疾病的单细胞RNA测序数据得到单细胞表达矩阵，收集疾病的bulk表达矩阵和对应的表型标签，下载人类蛋白质相互作用数据构建蛋白质相互作用网络；提取细胞和样本的基因特征签名映射到蛋白质相互作用网络中形成相应的细胞模块、样本模块；计算每个细胞模块和每个样本模块之间的距离，确定多个样本模块的集合作为疾病表型的样本模块集合；计算细胞模块与疾病表型的样本模块集合之间的距离；创建背景距离分布评估细胞模块与疾病表型的样本模块集合间距离的统计显著性，并确定与疾病表型的样本模块集合距离显著小于背景距离分布的细胞。
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