一种细胞类型划分的推断方法
    1.
    发明公开

    公开(公告)号:CN120032719A

    公开(公告)日:2025-05-23

    申请号:CN202311554149.X

    申请日:2023-11-21

    Abstract: 本发明公开提供一种细胞类型划分的推断方法,属于生物信息学领域,该方法利用零膨胀负二项(ZINB)模型对scRNA‑seq数据进行降噪。随后,该方法采用自适应图对比表示学习方法,使用近似个性化传播的神经预测图卷积作为图对比学习的编码器。这确保了每个单元的表示不仅捕获了它的单个特征,而且反映了它在图中的位置以及它与其他单元的关系。图对比学习利用节点之间的关系来捕获单元之间的相似性,更好地表示数据的潜在连续性和复杂拓扑结构。最后,利用Kullback‑Leibler散度对学习到的低维潜在表征进行聚类。

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