公开(公告)号：CN107904296A

公开(公告)日：2018-04-13

申请号：CN201711257675.4

申请日：2017-12-04

Applicant: 东北农业大学

Inventor： 曾兴 ,  刘显君 ,  王康 ,  邸宏 ,  王振华

IPC: C12Q1/6869

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2531/113

Abstract: 本发明属于土壤微生物学技术领域，公开了一种基于深度测序检测玉米根际土壤微生物的方法及系统，采集根际土壤；从土壤中提取高质量微生物基因组DNA；用双标签引物做PCR扩增DNA中16S rDNA V4区,构建文库；对合格文库进行测序，得到纯净READS；5.拼接，每样品产出至少5.0万条有效TAG用于聚类成可操作分类单元；6.物种组成、结构、多样性及相对丰度差异显著性分析；7.准确测定转基因耐盐碱玉米根际土壤原核微生物群落组成、结构、多样性、相对丰度。本发明受国家转基因重大专项课题“转基因玉米小麦大豆环境安全评价技术(2016ZX08011003)”支持。