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公开(公告)号:CN113257345B
公开(公告)日:2021-10-29
申请号:CN202110639770.0
申请日:2021-06-09
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明提供了一种利用基因序列信息预测药物最小抑菌浓度的方法,所述方法包括如下步骤:获取耐药菌的多个样本的基因组测序数据,并根据所述基因组测序数据生成耐药菌的SNP信息和/或核苷酸k‑mers计数信息;以至少一种碱基长度的平滑滑动窗口切割所述基因组测序数据,统计切割后所有碱基片段的出现频率,以至少一种碱基片段进行拼接,合并所得拼接结果与所对应的耐药菌的最小抑菌浓度,获得特征数据集;将所述耐药菌的样本随机分为训练集和测试集,采用特征数据集训练机器学习模型,并计算所述机器学习模型的预测精度。该方法预测准确度较高,可以缩短最小抑菌浓度的检测时间,对临床用药具有重要的指导意义。
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公开(公告)号:CN113257345A
公开(公告)日:2021-08-13
申请号:CN202110639770.0
申请日:2021-06-09
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明提供了一种利用基因序列信息预测药物最小抑菌浓度的方法,所述方法包括如下步骤:获取耐药菌的多个样本的基因组测序数据,并根据所述基因组测序数据生成耐药菌的SNP信息和/或核苷酸k‑mers计数信息;以至少一种碱基长度的平滑滑动窗口切割所述基因组测序数据,统计切割后所有碱基片段的出现频率,以至少一种碱基片段进行拼接,合并所得拼接结果与所对应的耐药菌的最小抑菌浓度,获得特征数据集;将所述耐药菌的样本随机分为训练集和测试集,采用特征数据集训练机器学习模型,并计算所述机器学习模型的预测精度。该方法预测准确度较高,可以缩短最小抑菌浓度的检测时间,对临床用药具有重要的指导意义。
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公开(公告)号:CN113075912A
公开(公告)日:2021-07-06
申请号:CN202110336465.4
申请日:2021-03-29
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: G05B19/418
Abstract: 本发明公开了一种基于无人实验室的分子诊断方法和系统。其中,该方法包括:控制收样机器人在无人实验室的进样区收取分子诊断样本,并控制所述收样机器人将所述分子诊断样本配送给送样机器人;控制所述送样机器人将所述分子诊断样本配送给无人实验区的样本实验机器人;控制所述样本实验机器人对所述分子诊断样本进行样本检测,得到样本检测数据。本发明实施例实现了无人的自动分子诊断,不仅能够提高分子诊断效率,还能够避免给实验人员带来安全隐患。
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公开(公告)号:CN113744892A
公开(公告)日:2021-12-03
申请号:CN202111025410.8
申请日:2021-09-02
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
Abstract: 本发明公开了一种胚胎整倍性预测方法、装置、电子设备及存储介质,该方法包括:获取胚胎发育动力学参数和辅助参数;其中,所述胚胎发育参数包括胚胎发育早期动力学参数和胚胎发育晚期动力学参数;所述辅助参数包括患者基本临床特征、促排记录、胚胎异常分裂模式、囊胚评分和雌雄原核并置时的位置;将所述胚胎发育动力学参数和所述辅助参数输入胚胎整倍性预测模型,得到胚胎整倍性预测结果。通过本申请的技术方案,可以解决现有技术中预测胚胎整倍性时操作复杂、周期长、成本高、有创且人工误差大的问题,实现快速、无创、安全、可靠预测胚胎整倍性的效果,为胚胎整倍性预测提供了一种新思路,对辅助生殖工作带来巨大的帮助。
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