一种基于四发夹介导的杂交链式反应的四色荧光条形码的构建、荧光解码方法及其应用

    公开(公告)号:CN117286216A

    公开(公告)日:2023-12-26

    申请号:CN202211200562.1

    申请日:2022-09-29

    Applicant: 上海大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于四发夹介导的杂交链式反应的四色荧光条形码的构建、荧光解码方法及其应用,以稳定的DNA茎环结构为荧光基团的载体,通过四发夹的杂交链式反应(HCR)构建了一种DNA荧光条形码技术,实现了对HCR自组装产物的四色荧光编码,四种荧光基团均拥有不同的激发和发射波长,极大程度地降低了荧光之间的相互干扰。通过这一编码,多达51种具有显著差异的荧光编码组合被成功验证并在磁珠界面上被有效解码。通过选取其中7种荧光组合,初步实现了对7种肝癌相关miRNA的同时检测。精准的编码与解码将在多靶标分析、组学分析等领域中具有重要的应用价值。

    一种DNA自组装用序列文库、其结构元件及其应用

    公开(公告)号:CN113981545A

    公开(公告)日:2022-01-28

    申请号:CN202110498428.3

    申请日:2021-05-08

    Applicant: 上海大学

    Abstract: 本发明公开了一种DNA自组装用序列文库、其结构元件及其应用。通过计算机辅助设计了一个DNA序列文库,该文库用于杂交链式反应(以下简称HCR)中的发夹结构DNA链1(以下简称H1)和发夹结构DNA链2(以下简称H2)的设计,其中H1和H2的3’端都修饰有荧光基团。该文库可用于设计多个相互之间不干扰的HCR体系。每一个HCR体系都有特定的荧光信号,每一个特定的HCR体系都只针对一种标靶。运用上述发明的序列文库,通过HCR技术对急性心肌梗死相关的多种微小RNA(miRNA)进行联合筛查以提高急性心肌梗死诊断的准确性。

    一种DNA自组装用序列文库、其结构元件及其应用

    公开(公告)号:CN113981545B

    公开(公告)日:2024-03-19

    申请号:CN202110498428.3

    申请日:2021-05-08

    Applicant: 上海大学

    Abstract: 本发明公开了一种DNA自组装用序列文库、其结构元件及其应用。通过计算机辅助设计了一个DNA序列文库,该文库用于杂交链式反应(以下简称HCR)中的发夹结构DNA链1(以下简称H1)和发夹结构DNA链2(以下简称H2)的设计,其中H1和H2的3’端都修饰有荧光基团。该文库可用于设计多个相互之间不干扰的HCR体系。每一个HCR体系都有特定的荧光信号,每一个特定的HCR体系都只针对一种标靶。运用上述发明的序列文库,通过HCR技术对急性心肌梗死相关的多种微小RNA(miRNA)进行联合筛查以提高急性心肌梗死诊断的准确性。

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