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公开(公告)号：CN109725158A
公开(公告)日：2019-05-07
申请号：CN201811594481.8
申请日：2018-12-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N33/68 , G01N33/535 , G01N33/564
Abstract: 本发明公开一种多肽SLE2018-V001在诊断系统性红斑狼疮试剂盒中的应用。所述多肽SLE2018-V001的氨基酸序列为：YEHAMYRSAVLL。本发明采用临床广泛使用的酶联免疫吸附检测(ELISA)技术，应用间接法定性检测人血清中抗YEHAMYRSAVLL多肽的IgG抗体的水平。通过本发明所提供的试剂盒，将作为辅助系统性红斑狼疮早期诊断的一种手段，可大大提高系统性红斑狼疮早期诊断的特异性和灵敏度，其特异性为74％、灵敏度为88％。
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公开(公告)号：CN109651506B
公开(公告)日：2021-12-07
申请号：CN201710943109.2
申请日：2017-10-11
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种快速获得抗原特异性抗体的方法，包括：建立抗体与多肽、基序的对应关系；通过搜索抗体与多肽的对应关系，查找与目标蛋白质氨基酸序列一致的多肽，其对应的抗体即为抗原特异性抗体；或计算所述抗体与基序的对应关系中，每一抗体的所有基序与目标蛋白质所有模块的相似度，取其中相似度值大于0.4所对应的基序，其对应的抗体即为抗原特异性抗体。本发明联合噬菌体展示技术和高通量测序技术，可以高效全局性地获取给定抗体所能特异性识别的多肽或基序信息，建立抗体与多肽或基序的对应关系，通过该对应关系，可快速确定目标蛋白质所对应的特异性抗体，具有十分广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN109725156A
公开(公告)日：2019-05-07
申请号：CN201811592274.9
申请日：2018-12-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N33/68 , G01N33/535 , G01N33/564
Abstract: 本发明公开一种多肽SLE2018-V002在诊断系统性红斑狼疮试剂盒中的应用。所述SLE2018-V002的氨基酸序列为：TIGVVRDVATQL。本发明采用临床广泛使用的酶联免疫吸附检测(ELISA)技术，应用间接法定性检测人血清中抗TIGVVRDVATQL多肽的IgG抗体的水平。通过本发明所提供的试剂盒，将作为辅助系统性红斑狼疮早期诊断的一种手段，可大大提高系统性红斑狼疮早期诊断的特异性和灵敏度，其特异性为61％、灵敏度为80％。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109725155A
公开(公告)日：2019-05-07
申请号：CN201811592271.5
申请日：2018-12-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N33/68 , G01N33/535 , G01N33/564
Abstract: 本发明公开一种多肽SLE2018-V004在诊断系统性红斑狼疮试剂盒中的应用；该试剂盒是将多肽SLE2018-V004(多肽序列为HDGTLLPRSSLH)作为抗原，通过SMCC连接在BSA上包被微孔板，制成固相抗原，往包被抗原的微孔中依次加入待测血清，再加入含有HRP标记的anti-Human IgG抗体的酶标试剂，形成多肽-抗体-酶标二抗复合物，经洗涤后加3,3',5,5'-四甲基联苯胺(TMB)显色。TMB在HRP酶的催化下转化成蓝色，并在酸的作用下转化成最终的黄色，用颜色的深浅检测样品中特异性识别该多肽的IgG抗体水平。本发明所提供的试剂盒，可大大提高系统性红斑狼疮早期诊断的特异性和灵敏度。
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公开(公告)号：CN115527610B
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202211396624.0
申请日：2022-11-09
Applicant: 上海交通大学 , 苏州京脉生物科技有限公司
Abstract: 本申请涉及一种单细胞组学数据的聚类分析方法，包括步骤：S1，将单细胞基因组学数据进行标准化预处理，获得预处理数据；S2，将S1的预处理数据进行多层次聚类，根据不断增加干扰条件来分析单细胞聚类的结构特征，再采用细胞聚类流向获得聚类结果；S3，对S2获得的聚类结果，采用罚函数计算聚类结果的稳定性分值，从而得到稳定性高的聚类结果；S4，根据S3获得的稳定性高的聚类结果的稳定性变化体系及对应的聚类数目出现的频次，得到最适聚类数目及细胞子群的类型和聚类结果。
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公开(公告)号：CN115527610A
公开(公告)日：2022-12-27
申请号：CN202211396624.0
申请日：2022-11-09
Applicant: 上海交通大学 , 苏州京脉生物科技有限公司
Abstract: 本申请涉及一种单细胞组学数据的聚类分析方法，包括步骤：S1，将单细胞基因组学数据进行标准化预处理，获得预处理数据；S2，将S1的预处理数据进行多层次聚类，根据不断增加干扰条件来分析单细胞聚类的结构特征，再采用细胞聚类流向获得聚类结果；S3，对S2获得的聚类结果，采用罚函数计算聚类结果的稳定性分值，从而得到稳定性高的聚类结果；S4，根据S3获得的稳定性高的聚类结果的稳定性变化体系及对应的聚类数目出现的频次，得到最适聚类数目及细胞子群的类型和聚类结果。
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公开(公告)号：CN109651506A
公开(公告)日：2019-04-19
申请号：CN201710943109.2
申请日：2017-10-11
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种快速获得抗原特异性抗体的方法，包括：建立抗体与多肽、基序的对应关系；通过搜索抗体与多肽的对应关系，查找与目标蛋白质氨基酸序列一致的多肽，其对应的抗体即为抗原特异性抗体；或计算所述抗体与基序的对应关系中，每一抗体的所有基序与目标蛋白质所有模块的相似度，取其中相似度值大于0.4所对应的基序，其对应的抗体即为抗原特异性抗体。本发明联合噬菌体展示技术和高通量测序技术，可以高效全局性地获取给定抗体所能特异性识别的多肽或基序信息，建立抗体与多肽或基序的对应关系，通过该对应关系，可快速确定目标蛋白质所对应的特异性抗体，具有十分广阔的应用前景。
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