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公开(公告)号:CN113527410B
公开(公告)日:2022-11-01
申请号:CN202110731083.1
申请日:2021-06-29
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于金属钛离子亲和色谱的核酸‑蛋白复合物提取方法,该方法包括如下步骤:步骤S1:甲醛处理活细胞,在核酸和与之相互作用的蛋白间形成共价键;步骤S2:用Trizol裂解交联后的细胞,并通过异丙醇沉淀获得核酸‑蛋白复合物的粗提物;步骤S3:利用Ti4+‑IMAC和核酸上磷酸基团之间的选择性作用捕获核酸‑蛋白复合物;步骤S4:将步骤S3中得到的核酸‑蛋白复合物解交联后,对核酸结合相关蛋白进行质谱分析。本发明根据钛离子和核酸上磷酸基团之间的相互作用,可以特异性地捕获核酸‑蛋白复合物,可以显著降低全细胞蛋白质组的复杂程度,从而减少高丰度蛋白干扰,有助于发现特异性核酸结合相关蛋白。
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公开(公告)号:CN116162125A
公开(公告)日:2023-05-26
申请号:CN202310194094.X
申请日:2023-03-02
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供一种实体组织细胞中核酸结合蛋白的分离方法,所述方法包括如下步骤:步骤S1,实体组织制备成细胞悬液1;步骤S2,采用交联剂对细胞悬液1进行交联,形成具有核酸‑NABPs复合物的细胞悬液2;步骤S3,对步骤S2的细胞悬液2中红细胞裂红,去除高丰度蛋白干扰;步骤S4,对步骤S3处理后的细胞进行有机试剂裂解后,采用亲和色谱选择性富集实体组织细胞中的核酸‑NABPs复合物;步骤S5,将步骤S4中得到的核酸‑NABPs复合物解交联后得到实体组织细胞中的核酸结合蛋白(NABPs)。
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公开(公告)号:CN113527410A
公开(公告)日:2021-10-22
申请号:CN202110731083.1
申请日:2021-06-29
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于金属钛离子亲和色谱的核酸‑蛋白复合物提取方法,该方法包括如下步骤:步骤S1:甲醛处理活细胞,在核酸和与之相互作用的蛋白间形成共价键;步骤S2:用Trizol裂解交联后的细胞,并通过异丙醇沉淀获得核酸‑蛋白复合物的粗提物;步骤S3:利用Ti4+‑IMAC和核酸上磷酸基团之间的选择性作用捕获核酸‑蛋白复合物;步骤S4:将步骤S3中得到的核酸‑蛋白复合物解交联后,对核酸结合相关蛋白进行质谱分析。本发明根据钛离子和核酸上磷酸基团之间的相互作用,可以特异性地捕获核酸‑蛋白复合物,可以显著降低全细胞蛋白质组的复杂程度,从而减少高丰度蛋白干扰,有助于发现特异性核酸结合相关蛋白。
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