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公开(公告)号：CN101565750A
公开(公告)日：2009-10-28
申请号：CN200910052465.0
申请日：2009-06-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68 , G01N21/76 , G01N27/447
Abstract: 一种生物技术领域的利用荧光标记酶切基因进行微生物群落结构分析的方法，包括如下步骤：提取样本的基因组总DNA，扩增微生物系统发育标记基因；利用限制性内切酶对扩增得到的标记基因进行酶切，得到带有粘性末端的限制性片段；对所有限制性片段进行末端荧光标记；运用DNA遗传分析仪分离并检测已被末端荧光标记的限制性片段，得到样本的微生物组成信息图谱；对信息图谱进行多元变量统计学分析，获得微生物群落结构信息特征与变化规律。本发明的方法利用了毛细管电泳的高通量、高灵敏度和高重复性等优点，能够有效全面地获得微生物群落结构信息。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104278091A
公开(公告)日：2015-01-14
申请号：CN201410503190.9
申请日：2014-09-26
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种以废水处理样品微生物元基因组序列拼接细菌基因组的方法，所述方法包括如下步骤：步骤一，获得样品的元基因组序列；步骤二，根据群落结构信息确定优势细菌的分类地位；步骤三，依据优势细菌的相似菌的参考基因组序列，从元基因组序列中挑出相似序列；步骤四，对相似序列进行拼接，添加人工接头序列，获得细菌的基因组草图。本发明通过从反应器污泥微生物元基因组序列中拼接细菌基因组，能够不经过分离细菌获得培养物就可获得细菌的基因组，从而可以实现对难以分离培养的细菌的基因组进行研究，进而获得该细菌的代谢功能特性的方法。
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公开(公告)号：CN106620189B
公开(公告)日：2021-11-19
申请号：CN201611246391.0
申请日：2012-06-06
Applicant: 上海交通大学 , 完美(中国)有限公司
IPC: A61K31/4375 , A61K36/8964 , A61P1/00 , A23L33/135
Abstract: 本发明提供了一种改善肠道菌群结构的方法，及其在制备调节肠道菌群的药物、营养品、保健品、食品、饮料中的应用。采用高通量测序技术以及多变量统计学方法找出了与宿主代谢密切相关的肠道细菌类群。以小檗碱为例，建立了改善肠道菌群结构的新方法，包括可以选择性地增加一部分细菌，如短链脂肪酸产生菌等，同时可以抑制一部分细菌，如可以产生内毒素的细菌等，从而预防或治疗包括由不当饮食诱导的系统炎性水平的提高、肥胖、胰岛素抵抗等代谢或免疫系统的紊乱。本发明还提供了一种筛选具有类似作用的药物、化合物、食品的方法，以及一种改善肠道菌群结构的组合物。本发明可以用于以肠道菌群为靶点的药物、营养品、保健品、食品、饮料等的开发。
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公开(公告)号：CN102743420A
公开(公告)日：2012-10-24
申请号：CN201210185004.2
申请日：2012-06-06
Applicant: 上海交通大学 , 完美(中国)有限公司
IPC: A61K36/185 , A61K36/28 , A61K36/288 , A61K36/29 , A61K36/42 , A61K36/48 , A61K36/489 , A61K36/51 , A61K36/515 , A61K36/53 , A61K36/539 , A61K36/70 , A61K36/708 , A61K36/71 , A61K36/718 , A61K36/74 , A61K36/744 , A61K36/75 , A61K36/756 , A61K36/896 , A61K36/8964 , A61K31/4375 , A61K31/47 , A23L1/29 , A61P1/00
CPC classification number: A61K31/4375 , A23L33/105 , A23L33/30 , A23V2002/00 , A61K35/74 , A61K35/741 , A61K35/745 , A61K36/185 , A61K36/28 , A61K36/288 , A61K36/29 , A61K36/42 , A61K36/48 , A61K36/489 , A61K36/515 , A61K36/53 , A61K36/539 , A61K36/59 , A61K36/70 , A61K36/708 , A61K36/71 , A61K36/718 , A61K36/74 , A61K36/744 , A61K36/75 , A61K36/756 , A61K36/88 , A61K36/8964 , C12Q1/689 , C12Q2600/136 , G01N33/5088 , G01N2500/10 , A61K2300/00
Abstract: 本发明提供了一种改善肠道菌群结构的方法，及其在制备调节肠道菌群的药物、营养品、保健品、食品、饮料中的应用。采用高通量测序技术以及多变量统计学方法找出了与宿主代谢密切相关的肠道细菌类群。以小檗碱为例，建立了改善肠道菌群结构的新方法，包括可以选择性地增加一部分细菌，如短链脂肪酸产生菌等，同时可以抑制一部分细菌，如可以产生内毒素的细菌等，从而预防或治疗包括由不当饮食诱导的系统炎性水平的提高、肥胖、胰岛素抵抗等代谢或免疫系统的紊乱。本发明还提供了一种筛选具有类似作用的药物、化合物、食品的方法，以及一种改善肠道菌群结构的组合物。本发明可以用于以肠道菌群为靶点的药物、营养品、保健品、食品、饮料等的开发。
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公开(公告)号：CN106620189A
公开(公告)日：2017-05-10
申请号：CN201611246391.0
申请日：2012-06-06
Applicant: 上海交通大学 , 完美(中国)有限公司
IPC: A61K36/8964 , A61K36/756 , A61K36/744 , A61K36/718 , A61K36/708 , A61K36/539 , A61K36/515 , A61K36/489 , A61K36/42 , A61K36/29 , A61K36/288 , A61K36/185 , A61K31/4375 , A61P1/00 , A23L33/135
CPC classification number: A61K31/4375 , A23L33/105 , A23L33/30 , A23V2002/00 , A61K35/74 , A61K35/741 , A61K35/745 , A61K36/185 , A61K36/28 , A61K36/288 , A61K36/29 , A61K36/42 , A61K36/48 , A61K36/489 , A61K36/515 , A61K36/53 , A61K36/539 , A61K36/59 , A61K36/70 , A61K36/708 , A61K36/71 , A61K36/718 , A61K36/74 , A61K36/744 , A61K36/75 , A61K36/756 , A61K36/88 , A61K36/8964 , C12Q1/689 , C12Q2600/136 , G01N33/5088 , G01N2500/10 , A61K2300/00
Abstract: 本发明提供了一种改善肠道菌群结构的方法，及其在制备调节肠道菌群的药物、营养品、保健品、食品、饮料中的应用。采用高通量测序技术以及多变量统计学方法找出了与宿主代谢密切相关的肠道细菌类群。以小檗碱为例，建立了改善肠道菌群结构的新方法，包括可以选择性地增加一部分细菌，如短链脂肪酸产生菌等，同时可以抑制一部分细菌，如可以产生内毒素的细菌等，从而预防或治疗包括由不当饮食诱导的系统炎性水平的提高、肥胖、胰岛素抵抗等代谢或免疫系统的紊乱。本发明还提供了一种筛选具有类似作用的药物、化合物、食品的方法，以及一种改善肠道菌群结构的组合物。本发明可以用于以肠道菌群为靶点的药物、营养品、保健品、食品、饮料等的开发。
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公开(公告)号：CN101565750B
公开(公告)日：2012-07-04
申请号：CN200910052465.0
申请日：2009-06-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68 , G01N21/76 , G01N27/447
Abstract: 一种生物技术领域的利用荧光标记酶切基因进行微生物群落结构分析的方法，包括如下步骤：提取样本的基因组总DNA，扩增微生物系统发育标记基因；利用限制性内切酶对扩增得到的标记基因进行酶切，得到带有粘性末端的限制性片段；对所有限制性片段进行末端荧光标记；运用DNA遗传分析仪分离并检测已被末端荧光标记的限制性片段，得到样本的微生物组成信息图谱；对信息图谱进行多元变量统计学分析，获得微生物群落结构信息特征与变化规律。本发明的方法利用了毛细管电泳的高通量、高灵敏度和高重复性等优点，能够有效全面地获得微生物群落结构信息。
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