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发明公开
非编码突变诱导的风险基因表达上下调控预测方法和系统审中-实审

公开(公告)号：CN117558340A

公开(公告)日：2024-02-13

申请号：CN202311545834.6

申请日：2023-11-17

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 林关宁 , 刘喆 , 包亦航

IPC: G16B20/20 , G16B20/50 , G16B40/20 , G06N3/0464 , G06N3/048 , G06N3/08

Abstract: 本发明提供了一种非编码突变诱导的风险基因表达上下调控预测方法和系统，包括：步骤1：获取数据集并进行预处理；步骤2：非编码突变到基因转录起始点TSS之间信息输入规范化；步骤3：非编码突变信息输入规范化；步骤4：序列长度对齐及表示学习框架；步骤5：嵌入特征合并与预测输出。本发明通过和染色质可及性测序数据的匹配迁移到任意组织或细胞类型，做出精确可靠的预测，并利用注意力机制赋予模型可解释性。

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