公开(公告)号：CN105354441B

公开(公告)日：2018-02-02

申请号：CN201510697708.1

申请日：2015-10-23

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张利达 ,  刘诗薇 ,  刘奕慧

IPC: G06F19/18

Abstract: 一种构建植物蛋白质互作网络的方法，该方法将蛋白质结构与非结构特征相结合，利用随机森林算法训练蛋白质互作模型，并用训练后的蛋白质互作分类器对植物蛋白质相互作用关系进行预测，而后构建植物蛋白质相互作用关系网络。与现有方法相比，该方法极大地提高了植物蛋白质相互作用关系预测的准确性。

公开(公告)号：CN105354441A

公开(公告)日：2016-02-24

申请号：CN201510697708.1

申请日：2015-10-23

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张利达 ,  刘诗薇 ,  刘奕慧

IPC: G06F19/18

CPC classification number: G06F19/18

Abstract: 一种构建植物蛋白质互作网络的方法，该方法将蛋白质结构与非结构特征相结合，利用随机森林算法训练蛋白质互作模型，并用训练后的蛋白质互作分类器对植物蛋白质相互作用关系进行预测，而后构建植物蛋白质相互作用关系网络。与现有方法相比，该方法极大地提高了植物蛋白质相互作用关系预测的准确性。

公开(公告)号：CN105279396A

公开(公告)日：2016-01-27

申请号：CN201510697716.6

申请日：2015-10-23

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张利达 ,  刘奕慧 ,  刘诗薇

IPC: G06F19/18 ,  G06F19/24

Abstract: 一种植物抗旱基因模块发掘方法，该方法基于基因相互作用网络，采用马尔可夫聚类算法对基因互作网络进行模块化分析，并利用基因芯片与全基因组关联数据对基因模块的抗旱作用大小进行评估。根据各个基因模块的抗旱贡献大小，筛选关键抗旱基因模块。与现有方法相比，该方法侧重于全新抗旱基因群的发现，极大地提高了植物抗旱基因发掘的效率与准确性。

公开(公告)号：CN105279396B

公开(公告)日：2018-02-02

申请号：CN201510697716.6

申请日：2015-10-23

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张利达 ,  刘奕慧 ,  刘诗薇

IPC: G06F19/18 ,  G06F19/24

Abstract: 一种植物抗旱基因模块发掘方法，该方法基于基因相互作用网络，采用马尔可夫聚类算法对基因互作网络进行模块化分析，并利用基因芯片与全基因组关联数据对基因模块的抗旱作用大小进行评估。根据各个基因模块的抗旱贡献大小，筛选关键抗旱基因模块。与现有方法相比，该方法侧重于全新抗旱基因群的发现，极大地提高了植物抗旱基因发掘的效率与准确性。