SNP位点组合及其KASP引物在鉴定水稻地方品种中的应用

    公开(公告)号:CN119824122A

    公开(公告)日:2025-04-15

    申请号:CN202411901528.6

    申请日:2024-12-23

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体涉及SNP位点组合及其引物在鉴定水稻地方品种中的应用。本发明基于114份太湖流域水稻地方品种全基因组重测序数据,挖掘获得了超过百万个SNP位点,从中鉴定筛选出27个核心SNP标记及配套KASP引物,使用其中12个KASP标记对114份水稻地方种质资源的鉴定效率可达到100%。本发明为太湖流域水稻地方品种生物学研究提供了一套可信、便于后期利用的SNP标记,这套SNP标记和检测引物,可用于水稻SNP检测试剂盒开发、水稻地方品种DNA指纹图谱构建、水稻地方种质资源和遗传群体基因分型,水稻定向改良品种背景回复率检测、水稻地方品种纯度/真伪度检测、水稻分子标记辅助选择育种等。

    能够鉴定吴江香青菜的ISSR‑SCAR标记及其鉴定方法

    公开(公告)号:CN104894124B

    公开(公告)日:2017-09-12

    申请号:CN201510344812.2

    申请日:2015-06-19

    Abstract: 本发明公开了一种能够鉴定吴江香青菜的ISSR‑SCAR标记及其鉴定方法。本方法是通过对吴江香青菜和其它10种青菜品种进行总DNA提取、PCR扩增、引物筛选和ISSR‑SCAR检测,最终确定了吴江香青菜的ISSR‑SCAR分子标记及其分子鉴别方法。使用本发明公开序列如SEQ ID NO:1所示的引物扩增得到序列如SEQ ID NO:2所示的特异性片段。根据该序列,设计序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的一对引物。本发明操作简便、稳定可靠,是第一个应用于吴江香青菜品种的分子鉴定标记,可用于该品种快速鉴定,同时对保护地理标志产品的种质资源具有重要的意义。

    一种鉴定玉祁红芹的ISSR-SCAR标记及其鉴定方法

    公开(公告)号:CN110396556B

    公开(公告)日:2023-08-01

    申请号:CN201910763819.6

    申请日:2019-08-19

    Abstract: 本发明公开了一种鉴定玉祁红芹的ISSR‑SCAR标记及其鉴定方法,通过对玉祁红芹和其它水芹品种进行总DNA提取、PCR扩增、引物筛选和ISSR‑SCAR检测,筛选到鉴定玉祁红芹的ISSR‑SCAR分子标记,并建立分子鉴别方法。SEQ ID NO:1所示引物可以在玉祁红芹样品中扩增得到SEQ ID NO:2所示片段,根据此片段设计SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的引物,成功进行玉祁红芹的品种鉴别。本发明操作简便、稳定可靠,首次应用于玉祁红芹品种的分子鉴定,可用于该品种的选种、育种、种植、采收和品种贸易等各环节的快速鉴定,同时对保护地理标志产品的种质资源具有重要的意义。

    能够鉴定吴江香青菜的ISSR-SCAR标记及其鉴定方法

    公开(公告)号:CN104894124A

    公开(公告)日:2015-09-09

    申请号:CN201510344812.2

    申请日:2015-06-19

    Abstract: 本发明公开了一种能够鉴定吴江香青菜的ISSR-SCAR标记及其鉴定方法。本方法是通过对吴江香青菜和其它10种青菜品种进行总DNA提取、PCR扩增、引物筛选和ISSR-SCAR检测,最终确定了吴江香青菜的ISSR-SCAR分子标记及其分子鉴别方法。使用本发明公开序列如SEQ?ID?NO:?1所示的引物扩增得到序列如SEQ?ID?NO:?2所示的特异性片段。根据该序列,设计序列如SEQ?ID?NO:?3和SEQ?ID?NO:?4所示的一对引物。本发明操作简便、稳定可靠,是第一个应用于吴江香青菜品种的分子鉴定标记,可用于该品种快速鉴定,同时对保护地理标志产品的种质资源具有重要的意义。

    一种鉴定玉祁红芹的ISSR-SCAR标记及其鉴定方法

    公开(公告)号:CN110396556A

    公开(公告)日:2019-11-01

    申请号:CN201910763819.6

    申请日:2019-08-19

    Abstract: 本发明公开了一种鉴定玉祁红芹的ISSR-SCAR标记及其鉴定方法,通过对玉祁红芹和其它水芹品种进行总DNA提取、PCR扩增、引物筛选和ISSR-SCAR检测,筛选到鉴定玉祁红芹的ISSR-SCAR分子标记,并建立分子鉴别方法。SEQ ID NO:1所示引物可以在玉祁红芹样品中扩增得到SEQ ID NO:2所示片段,根据此片段设计SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的引物,成功进行玉祁红芹的品种鉴别。本发明操作简便、稳定可靠,首次应用于玉祁红芹品种的分子鉴定,可用于该品种的选种、育种、种植、采收和品种贸易等各环节的快速鉴定,同时对保护地理标志产品的种质资源具有重要的意义。

    一种鉴别太仓新毛芋艿的特异性分子标记及其筛选方法

    公开(公告)号:CN105368827A

    公开(公告)日:2016-03-02

    申请号:CN201510700775.4

    申请日:2015-10-26

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别太仓新毛芋艿的特异性分子标记及其筛选方法,所述的能够在太仓新毛芋艿中扩增得到的特异性片段,该片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:16所述。所述的筛选方法首先筛选出能够在多子芋和魁芋中扩增出差异性序列的叶绿体片段引物,并针对差异的序列设计位点特异性引物,从而将多子芋和魁芋区分开来。然后在多子芋品种中筛选能够在太仓新毛芋艿中扩增出特异性条带的SSR引物,并针对特异性条带设计序列特异性引物,最终将太仓新毛芋艿和其它芋品种区分开来,最终实现对太仓新毛芋艿的特异性鉴定,为芋的品种鉴别和种质资源保护提供有力的技术支持。

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