公开(公告)号：CN107463793A

公开(公告)日：2017-12-12

申请号：CN201710475559.3

申请日：2017-06-21

Applicant: 南京迈格罗医药科技有限公司

Inventor： 杨家安

IPC: G06F19/18

CPC classification number: G16B20/00

Abstract: 本发明涉及抗体互补决定区构象指纹数据库，属于生物信息学领域。对于每个抗体蛋白，包括名称，氨基酸序列，互补决定区片段范围，全信息构象指纹共四组数据，所述的氨基酸序列和互补决定区片段范围，从蛋白知识数据库获得，所述的全信息构象指纹，分两种情况处理：对于已知三维结构的抗体蛋白，从蛋白数据库里获得全部结构数据，并用蛋白折叠形状码表示；对于未知结构的抗体蛋白，对抗体互补决定区的三维空间构象进行预测得到构象谱带。本发明不仅包含了抗体蛋白序列的一级结构和有规则的二级结构，而且扩展涵盖了无规则的三级结构。可以采用构象指纹的相似性分数标记抗体互补决定区构象特征，为抗体互补决定区的分类提供新的参数。

公开(公告)号：CN107451421A

公开(公告)日：2017-12-08

申请号：CN201710475245.3

申请日：2017-06-21

Applicant: 南京迈格罗医药科技有限公司

Inventor： 杨家安

IPC: G06F19/16 ,  G06F19/28

CPC classification number: G06F19/16 ,  G06F19/28

Abstract: 本发明涉及一种抗原表位构象指纹数据库，属于生物信息学领域。每一条抗原表位的数据包括名称，氨基酸序列，全信息构象指纹，所述的氨基酸序列从抗原表位数据库中获取，所述的全信息构象指纹是对抗原表位的氨基酸序列的三维空间构象进行预测得到的构象谱带。该数据库包含超过25万抗原表位的构象指纹。不仅包含了抗原表位序列的一级结构和有规则的二级结构，而且涵盖了无规则的三级结构。由于采用指纹代码，可以采用相似性分数来评估抗原的表位特征，为定量地分析和比对抗原表位提供了工具。