一种基于全基因组SNP信息划分种猪血统的方法

    公开(公告)号:CN110176274A

    公开(公告)日:2019-08-27

    申请号:CN201910386174.9

    申请日:2019-05-09

    Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组SNP信息对种猪进行血统划分的方法。先对划分对象采集身体组织,提取DNA,通过某种基因分型技术对每个体的基因组SNP进行分型,通过质控,筛选出合格的SNP位点。通过基因组SNP基因型计算个体间的加性遗传相关值,然后用1减去该值作为两两个体之间的“距离”,接下来对两两组合通过R语言“hclust”函数进行聚类分析,取0.9844作为划分血统的阈值。本发明相对传统血统划分方法,得到的结果清晰简洁,并且充分吸收了来自父母双方传递的等位基因信息,对血统的划分具有更高的可靠性。

    位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记及应用

    公开(公告)号:CN110144408A

    公开(公告)日:2019-08-20

    申请号:CN201910407561.6

    申请日:2019-05-15

    Abstract: 本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域,具体涉及一种位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记及应用。所述的位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记的SNP位点对应于国际猪基因组11.1版本参考序列7号染色体上第97568284位G>A突变;本发明还提供了一种用于上述位于猪7号染色体上与总乳头数相关的SNP分子标记的引物对。本发明通过优选该SNP的优势等位基因,能够逐代增加优势等位基因频率,提高猪的繁殖性能,加快猪遗传改良进展从而有效提高经济效益。

    一种影响猪有效总乳头数性状的分子标记及应用

    公开(公告)号:CN107365853B

    公开(公告)日:2019-04-19

    申请号:CN201710696954.4

    申请日:2017-08-15

    Abstract: 本发明属于分子标记辅助选择及动物遗传育种技术领域,具体涉及一种影响猪有效总乳头数性状的分子标记及应用。所述的影响猪有效总乳头数性状的分子标记是通过全基因组关联分析得到,其SNP位点对应于国际猪基因组10.2版本参考序列10号染色体上第39602384个核苷酸位点T>C突变。本发明还提供了一直用于鉴定上述影响猪有效总乳头数性状的分子标记的引物对,通过上述分子标记和引物对,可建立高效准确的分子标记辅助育种技术,将其应用于种猪有效总乳头数性状遗传改良中,从而提高后代猪的有效总乳头数,进而提高仔猪的成活率,提高企业利润,增加核心竞争力。

    一种影响猪有效总乳头数性状的分子标记及应用

    公开(公告)号:CN107365853A

    公开(公告)日:2017-11-21

    申请号:CN201710696954.4

    申请日:2017-08-15

    CPC classification number: C12Q1/6888 C12Q2600/124 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明属于分子标记辅助选择及动物遗传育种技术领域,具体涉及一种影响猪有效总乳头数性状的分子标记及应用。所述的影响猪有效总乳头数性状的分子标记是通过全基因组关联分析得到,其SNP位点对应于国际猪基因组10.2版本参考序列10号染色体上第39602384个核苷酸位点T>C突变。本发明还提供了一直用于鉴定上述影响猪有效总乳头数性状的分子标记的引物对,通过上述分子标记和引物对,可建立高效准确的分子标记辅助育种技术,将其应用于种猪有效总乳头数性状遗传改良中,从而提高后代猪的有效总乳头数,进而提高仔猪的成活率,提高企业利润,增加核心竞争力。

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