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公开(公告)号:CN103966234B
公开(公告)日:2015-12-02
申请号:CN201410197759.3
申请日:2014-05-13
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , A01H5/00
Abstract: 本发明提供的是一种甘蔗花青素调节基因ScRS及其应用,属于生物技术领域,调节基因ScRS序列如SEQ ID NO.1所示,根据玉米花青素转录因子RS基因序列设计引物,利用同源克隆技术,从甘蔗上得到花青素转录因子基因ScRS的全长序列。甘蔗ScRS基因开放读码框长度为1722bp,编码573个氨基酸。与众多玉米花青素相关基因的BLAST同源搜索中,E值等于零,说明了所克隆的基因确实为花青素有关的基因。在ScRS序列两端分别添加KpnⅠ、SalⅠ酶切位点,构建植物表达载体pCAMBIA1301-35SN-ScRS,再通过基因枪轰击转化甘蔗愈伤组织,转化的愈伤组织颜色转变为亮紫红色,进一步证实所克隆的基因具有使甘蔗愈伤组织显色的功能。
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公开(公告)号:CN103966234A
公开(公告)日:2014-08-06
申请号:CN201410197759.3
申请日:2014-05-13
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , A01H5/00
Abstract: 本发明提供的是一种甘蔗花青素调节基因ScRS及其应用,属于生物技术领域,调节基因ScRS序列如SEQ ID NO.1所示,根据玉米花青素转录因子RS基因序列设计引物,利用同源克隆技术,从甘蔗上得到花青素转录因子基因ScRS的全长序列。甘蔗ScRS基因开放读码框长度为1722bp,编码573个氨基酸。与众多玉米花青素相关基因的BLAST同源搜索中,E值等于零,说明了所克隆的基因确实为花青素有关的基因。在ScRS序列两端分别添加KpnⅠ、SalⅠ酶切位点,构建植物表达载体pCAMBIA1301-35SN-ScRS,再通过基因枪轰击转化甘蔗愈伤组织,转化的愈伤组织颜色转变为亮紫红色,进一步证实所克隆的基因具有使甘蔗愈伤组织显色的功能。
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公开(公告)号:CN103966233A
公开(公告)日:2014-08-06
申请号:CN201410197758.9
申请日:2014-05-13
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , A01H5/00
Abstract: 本发明提供了一种甘蔗愈伤组织显色控制基因ScSN及其应用,根据玉米花青素转录因子基因SN(GenBank:X60706.1)的上游、下游序列设计引物,利用同源克隆技术,从甘蔗上得到花青素转录因子基因ScSN的全长序列。甘蔗ScSN基因开放读码框长度为1722bp,编码573个氨基酸。将甘蔗ScSN基因的编码区序列在NCBI中进行BLAST分析,与众多玉米花青素相关基因的BLAST同源搜索中,E值等于零,说明了所克隆的基因确实为甘蔗花青素合成相关基因。在ScSN序列两端分别添加KpnⅠ、SalⅠ酶切位点,构建植物表达载体pCAMBIA1301-35SN-ScSN,再通过基因枪轰击转化甘蔗愈伤组织,转化的愈伤组织颜色转变为暗红色,进一步证实所克隆的基因具有使甘蔗愈伤组织显色的功能。
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公开(公告)号:CN103555844A
公开(公告)日:2014-02-05
申请号:CN201310548336.7
申请日:2013-11-07
Applicant: 福建农林大学
CPC classification number: C12Q1/04 , C12Q1/686 , C12Q2545/114 , C12Q2531/113 , C12Q2561/101
Abstract: 本发明涉及一种检测甘蔗赤条病菌的荧光定量PCR试剂盒,包括:(1)阳性标准品;(2)阴性对照;(3)PCR反应液;(4)ExTaq酶液;(5)探针溶液;(6)无菌水。本试剂盒对甘蔗赤条病菌的检测有高度的特异性,与其他植物病菌无交叉反应;检测的灵敏度达100拷贝,可直接用于甘蔗植株、脱毒种苗等样本的定量检测甘蔗赤条病菌;利用本发明试剂盒检测快速简单,准确性好,灵敏度高,检测结果可靠稳定。
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公开(公告)号:CN103409412A
公开(公告)日:2013-11-27
申请号:CN201310292810.4
申请日:2013-07-12
Applicant: 福建农林大学
Abstract: 本发明公开了甘蔗基因组内标基因异戊二烯基二磷酸δ-异构酶基因PCR引物序列及扩增方法。引物序列是由ScIDI2-F和ScIDI2-R组成,PCR扩增方法包括反应体系和扩增条件。本发明是为转基因甘蔗PCR检测和物种特异性鉴定提供基因组内标基因,同时为转基因甘蔗检测精度和结果的准确性提供了保证。
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公开(公告)号:CN103305635A
公开(公告)日:2013-09-18
申请号:CN201310239863.X
申请日:2013-06-18
Applicant: 福建农林大学
Abstract: 本发明涉及一种分子检测侵染甘蔗的高粱花叶病毒(SrMV)的方法。通过提取甘蔗植株叶片总RNA、进行反转录反应(RT)获得模板、利用高粱花叶病毒不同株系外壳蛋白基因保守序列简并引物进行聚合酶链式反应(PCR)、利用限制性内切酶NsiI和BsmI对PCR产物进行双酶切反应,用4%的低熔点琼脂糖凝胶电泳检测限制性内切酶条带长度多态性(RFLP)来鉴定是否感染SrMV及其株系类型。该方法将快速与简便的检测甘蔗高粱花叶病毒分离物不同株系。本发明的分子检测侵染甘蔗的高粱花叶病毒的方法,克服了生物学鉴定和常规RT-PCR等方法的缺点,提供了一种快速、特异、准确的SrMV不同病毒株系的检测方法。
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公开(公告)号:CN103060457A
公开(公告)日:2013-04-24
申请号:CN201310015760.5
申请日:2013-01-16
Applicant: 福建农林大学
Abstract: 本发明涉及一种检测甘蔗褐锈病菌的实时荧光定量PCR方法,包括基因组DNA的提取、实时荧光定量PCR检测体系建立、实验有效性判定,以及实时荧光定量PCR检测。本发明的一种检测甘蔗褐锈病菌的实时荧光定量PCR方法,具有灵敏度高,特异性好,所需要的DNA用量少的特点;与常规的根据病菌培养后的孢子形态特征鉴定、根据田间种植后病害表型症状鉴定,以及常规PCR检测技术相比,具有灵敏度高,特异性好,样品消耗少,还能实时直观地监测PCR扩增过程等优点。为甘蔗褐锈病菌的鉴定,提供了高灵敏度、特异性强的快速检测体系,可用于田间甘蔗褐锈病菌的早期诊断及检测,对抗褐锈病甘蔗育种和抗褐锈病甘蔗种质资源的保护具有重要的意义。
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公开(公告)号:CN103014172A
公开(公告)日:2013-04-03
申请号:CN201310015708.X
申请日:2013-01-16
Applicant: 福建农林大学
Abstract: 本发明涉及一种检测甘蔗黄锈病菌的实时荧光定量PCR方法,包括基因组DNA提取、实时荧光定量PCR检测体系建立、实验有效性判定以及实时荧光定量PCR检测。本发明的一种检测甘蔗黄锈病菌的实时荧光定量PCR方法,具有灵敏度高,特异性好,所需要的DNA用量少的特点;与常规的根据病菌培养后的孢子形态特征鉴定、根据田间种植后病害表型症状鉴定以及常规PCR检测技术相比,具有灵敏度高,特异性好,样品消耗少,还能实时直观地监测PCR扩增过程等优点。为甘蔗黄锈病菌的鉴定,提供了高灵敏度、特异性强的快速检测体系,可用于田间甘蔗黄锈病菌的早期诊断及检测,对抗黄锈病甘蔗育种和抗黄锈病甘蔗种质资源的保护具有重要的意义。
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公开(公告)号:CN102311954B
公开(公告)日:2013-02-27
申请号:CN201110316550.0
申请日:2011-10-18
Applicant: 福建农林大学
Abstract: 本发明提供了一种转基因番木瓜55-1转化事件特异性PCR检测方法,首先涉及一种转基因番木瓜55-1转化事件外源插入载体旁侧DNA片段,其碱基序列如SEQ.NO.1所示,由来源于番木瓜基因组序列的第1至1432碱基和来源于外源载体序列的第1433至3780个碱基共同组成。根据SEQNO.1所示的序列设计特异性引物,对待测样品DNA进行扩增,若扩增获得目的片段,则待测样品含有转基因番木瓜55-1转化事件来源的成分。本发明能够利用普通的PCR仪器、试剂快速准确鉴别出转基因番木瓜55-1,适用于对转基因番木瓜55-1(包括杂种F1代和后代)及其衍生产品进行检测、监测和标识制度管理。
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公开(公告)号:CN102312016B
公开(公告)日:2013-01-02
申请号:CN201110316557.2
申请日:2011-10-18
Applicant: 福建农林大学
Abstract: 本发明首先提供了一种利用实时荧光定量PCR方法检测甘蔗宿根矮化病菌的引物及探针,所述的引物为以下序列的引物对:正向引物序列5’-GGTTCCATTGCTTACCGATT-3’,反向引物序列5’-CAAGTTTCGACAGGAACAGC-3’,探针序列是FAM-5-CCACGGCTACGTCAATTCGGG-3-TAMRA。以上面提供的引物对与探针在实时荧光定量PCR仪中检测甘蔗中感染的宿根矮化病菌Pat1基因。通过PCR扩增过程生成的Ct值,利用已经建好的标准曲线将Ct值转换成起始反应的核酸分子拷贝数,从而达到定量检测甘蔗中感染宿根矮化病菌的数量。该方法可应用于甘蔗健康种苗检测、甘蔗抗性鉴定方面。
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