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公开(公告)号:CN117782739A
公开(公告)日:2024-03-29
申请号:CN202410002129.X
申请日:2024-01-02
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种用于子宫内膜癌鉴别诊断的生物标志物组合及其获取方法,包括谷氨酰胺、葡萄糖和胆固醇亚油酸酯及其与CA‑125的组合,上述生物标志物组合的获得方法,包括如下步骤:使用纳米颗粒增强激光解吸电离飞行时间质谱技术,进行血清代谢组数据采集;进行血清中代谢生物标志物鉴定和筛选,确定用于子宫内膜癌鉴别诊断的生物标志物组合。本发明提供了一种简单、创伤小并能够更精准地实现子宫内膜癌断的生物标志物组合及其获得方法。
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公开(公告)号:CN111896609B
公开(公告)日:2023-08-08
申请号:CN202010707525.4
申请日:2020-07-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/64
Abstract: 一种基于人工智能分析质谱数据的方法,方法包括:采用激光辅助解吸/电离质谱仪对每个所述样本进行代谢物小分子指纹谱图进行收集;将所述指纹图谱进行绝对强度的提取处理;将处理后的数据输入所述多层神经网络,进行样本分组处理。一种样本区分贡献重要性的计算方法,将指纹图谱数据转化为二维图像;使用显著性特征分析方法对所述代谢物筛选图片库内的数据进行计算,并对所有特征进行排序,筛选出对样本区分贡献最大的物质。本发明的有益效果是:对质谱数据实现样本快速分组,并大大提升了分类模型的可解释能力。
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公开(公告)号:CN116429871A
公开(公告)日:2023-07-14
申请号:CN202310342259.3
申请日:2023-03-31
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于增强多重碱金属离子加成技术的小分子代谢物的检测技术,涉及代谢组学领域,所述小分子代谢物的检测方法,包括向待测小分子代谢物中加入碱金属阳离子盐溶液,再使用质谱对样品进行检测。本发明所述的检测方法可1)实现小分子代谢物多重碱金属阳离子加成显著增强,显著提升激光解吸电离质谱中小分子代谢物检测定量性能,提升小分子代谢物检测能力;2)实现生物体液中小分子代谢物高通量和高可重复性检测;3)并且通过简单比对多重碱金属阳离子加成,实现直接在一级质谱中进行同分异构体区分。
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公开(公告)号:CN115482937A
公开(公告)日:2022-12-16
申请号:CN202211234438.7
申请日:2022-10-10
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于动态代谢指纹图谱的量化分析系统及方法和应用,涉及医学人工智能领域。其中,系统包括动态代谢指纹图谱提取模块及深度学习量化模块;所述动态代谢指纹图谱提取模块将采集到的癌症病人的体液样本的代谢指纹图谱按采样时间集成为动态代谢指纹图谱n为癌症病人总数,t为采样时间点总数,m为代谢标志物总数;所述深度学习量化模块连接动态代谢指纹图谱提取模块,并对动态代谢指纹图谱进行深度学习,建立深度学习模型,判别癌症相关的代谢标志物。本发明集成多个静态序列快照,建立深度学习模型,学习肿瘤细胞生长的时序性,可以快速识别癌症预后,判别癌症相关的代谢标志物,为癌症预后、标志物筛选提供更好的解决方案。
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公开(公告)号:CN113447560B
公开(公告)日:2022-12-09
申请号:CN202110565417.2
申请日:2021-05-24
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/64
Abstract: 本发明公开了一种基于金属离子加成的小分子代谢物碎裂控制方法,将小分子代谢物溶液与金属离子溶液混合,通过激光解吸电离实现混合溶液中小分子代谢物的金属离子加成,然后对不同金属离子加成的小分子代谢物进行串级质谱检测,从而得到不同金属离子加成的小分子代谢物碎片种类和数目。通过改变小分子代谢物加合的金属离子(Li+/Ag+/Na+/K+/Rb+/Cs+)种类,可以控制小分子代谢物碎裂的方式和程度,特别对于Li+和Ag+两种金属离子加成来说,小分子代谢物的碎片信息得到了显著提升。本发明还公开了一种金属离子加成的小分子代谢物碎裂控制方法在鉴定小分子代谢物中的应用,实现了在复杂生物体液中对常见小分子代谢物的精准鉴定。
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公开(公告)号:CN115372454A
公开(公告)日:2022-11-22
申请号:CN202210874046.0
申请日:2022-07-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/64
Abstract: 本发明公开了一种多级结构的氧化铈微纳颗粒的制备方法,包括如下步骤:步骤1、模板3‑氨基苯酚‑甲醛球的制备;扩展的方法适用于制备粒径均匀的球形APF树脂;步骤2、氧化铈在APF上生长得到APF‑CeO2;步骤3、去除APF模板获得多级结构的氧化铈微纳颗粒。本发明还提供上述氧化铈微纳颗粒在小分子代谢物检测与鉴定中的应用。本发明的检测方法无创、检测通量高、灵敏度高、成本低,满足了临床上对代谢指纹图谱的获取需求,实现诊断、预后、生物标志物筛选等临床应用,并且在对生物体生长发育以及致病机理等过程进行代谢组学水平的深入解读方面具有重大应用潜力。
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公开(公告)号:CN115308295A
公开(公告)日:2022-11-08
申请号:CN202211005914.8
申请日:2022-08-22
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种双组学血浆指纹模型构建方法及使用该方法构建的双组学血浆指纹模型的感染诊断装置,涉及感染疾病诊断技术领域,构建方法包括预处理血浆样本、基质材料的准备、质谱靶板上的样品和基质点样、纳米颗粒增强激光解吸电离质谱中血浆代谢指纹采集以及无机基质材料辅助激光解吸电离质谱中血浆蛋白指纹采集,感染诊断装置对双组学血浆指纹图谱进行数据分析,获得诊断结果,具有检测重现性高、分析速度快和样本消耗少等优势,实现了对不同感染类型的高效诊断性能。
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公开(公告)号:CN114414656A
公开(公告)日:2022-04-29
申请号:CN202210093030.6
申请日:2022-01-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了基于血清代谢指纹自体免疫疾病模型的构建方法,涉及基质辅助激光解吸电离质谱技术、生物样本代谢分子分析以及机器学习技术领域,步骤为:使用纳米辅助的激光解析电离质谱技术,对自体免疫疾病的血清代谢指纹进行检测和提取;基于血清代谢指纹图谱,采用机器学习算法构建针对自体免疫疾病的模型;筛选得到代谢生物标志物。本发明采用机器学习方法基于血清代谢指纹成功构建了自体免疫疾病模型。通过一种纳米辅助的激光解析电离质谱(nano‑assisted LDI MS)有效克服了核磁共振技术和传统质谱技术(GC/LC‑MS)等的缺陷,有效实现自体免疫疾病血清低分子量段代谢指纹快速、高通量、高灵敏度检测。
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公开(公告)号:CN113533491A
公开(公告)日:2021-10-22
申请号:CN202110780476.1
申请日:2021-07-09
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/64
Abstract: 本发明提供了一种多角星形状Au@ZnO纳米复合材料及其制备方法和应用,该多角星形状Au@ZnO纳米复合材料作为基质材料在MALDI MS检测中的应用,还可以作为基质材料在小分子代谢物和血清代谢物检测中应用,本发明的Au@ZnO纳米复合材料结合贵金属和半导体材料两者的优势,提高检测效率并降低成本;本发明特殊多角星形状的复合纳米颗粒,与传统核壳纳米材料或者球状纳米材料相比,在尖端和凹陷处增强了电磁场,有助于增强表面等离子共振,提高了激光解吸电离效应,同时有助于提高比表面积增强小分子代谢物的吸附性,故多角星形的Au@ZnO复合纳米材料用于LDI MS中的小分子代谢物和血清代谢物的检测。
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公开(公告)号:CN106807942A
公开(公告)日:2017-06-09
申请号:CN201510866014.6
申请日:2015-11-30
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种核壳结构纳米基质,该核壳结构纳米基质为SiO2@Pt核壳结构,该核壳结构纳米基质为纳米球形颗粒,纳米球形颗粒的直径小于1μm,颗粒粒度均一,该纳米球形颗粒具有粗糙表面。本发明还公开了该核壳结构纳米基质的制备方法以及其在质谱分析尤其是在生物样品的质谱分析中的应用。该核壳结构纳米基质能有效排除传统有机基质的背景噪声干扰,大大提升小分子物质的解析离子化效果。使用该基质进行质谱分析,可以实现特异性检测指定类别分子,排除其他分子干扰并具有一定的耐盐性,适用于生物体液体系的检测。本发明作为一种快速高效的检测手段,其所带来的极少的样品消耗,有利于生物样品库的微型化,值得推广和应用。
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