公开(公告)号：CN116884473A

公开(公告)日：2023-10-13

申请号：CN202310581243.8

申请日：2023-05-22

Applicant: 哈尔滨工业大学(深圳)(哈尔滨工业大学深圳科技创新研究院)

Inventor： 李君一 ,  焦沛舜 ,  王贝贝 ,  王轩 ,  刘博 ,  王亚东

IPC: G16B15/20 ,  G16B40/00 ,  G06F18/214 ,  G06F18/241

Abstract: 本发明公开了一种蛋白质功能预测模型生成方法及装置，包括获取训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标，并根据其进行图论方法生成蛋白质二维接触图；对训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标进行算法处理获取第一特征矩阵，对蛋白质二维接触图进行算法处理获取第二特征矩阵，第一特征矩阵与训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标中序列作用位点对应，第二特征矩阵与训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标中结构作用折叠结构对应；根据第一特征矩阵和第二特征矩阵分别对应的数据标签训练预先构建的蛋白质功能分类器，得到蛋白质功能预测模型。通过将训练蛋白质的氨基酸结构和序列作为信息源提取特征，提高了预测模型对蛋白质功能的预测精度。

公开(公告)号：CN116246699A

公开(公告)日：2023-06-09

申请号：CN202211105940.8

申请日：2022-09-07

Applicant: 哈尔滨工业大学(深圳)(哈尔滨工业大学深圳科技创新研究院)

Inventor： 李君一 ,  朱焱 ,  周雨桓 ,  王轩 ,  刘洋 ,  漆舒汉 ,  吴宇琳 ,  姚霖 ,  刘博 ,  王亚东

IPC: G16B20/00 ,  G16B40/00 ,  G06F16/36 ,  G06N3/0464

Abstract: 本发明公开了一种基于知识图谱的合成致死预测方法、设备及存储介质，该方法包括：基于知识图谱卷积网络获得第一基因特征；根据合成致死相互作用网络获得第二基因特征；计算所述第一基因特征和所述第二基因特征的向量内积，预测基因对的合成致死概率。由此解决了当前需要人工设计基因特征，以及无法通过建模合成致死相互作用背后机制的问题，在提升基因对的合成致死预测性能的同时，还提高了模型的可解释性。