一种基因序列比对方法及系统
    22.
    发明公开

    公开(公告)号:CN112735528A

    公开(公告)日:2021-04-30

    申请号:CN202110024450.4

    申请日:2021-01-08

    Abstract: 本发明公开一种基因序列比对方法及系统,该方法包括:将参考基因组序列和查询基因组序列存储于分布式存储系统;在Spark异构分布式计算平台框架下:按行偏移量分割参考基因组序列,并进行预处理,得到多个预处理参考数据集;采用后缀数组算法为每一预处理参考数据集建立索引,并合并所有建立索引后的预处理参考数据集,得到参考序列索引文件;采用种子扩展算法将查询基因组序列中的各个片段与参考序列索引文件进行CUDA细粒度序列比对,确定每个片段在参考序列索引文件中的位置信息;合并所有片段在参考序列索引文件中的位置信息得到基因序列比对结果。本发明提高了大规模序列比对算法计算的速度和精度。

    一种基于物料投入的食品溯源方法

    公开(公告)号:CN107944888A

    公开(公告)日:2018-04-20

    申请号:CN201711401520.3

    申请日:2017-12-21

    CPC classification number: G06Q30/018 G06K19/06037

    Abstract: 本发明涉及食品溯源技术领域,具体涉及一种基于物料投入的食品溯源方法,包括产业主链,产业支链、信息储存模块、信息查询模块、云平台、数据处理模块;产业主链根据食品生产流程分为多个生产模块i,与各个生产模块i相对应的将投入物i的信息录入信息储存模块i;投入物i所在的从源头到投入物i的产业支链根据生产流程分为多个生产模块j,与各生产模块j先对应的投入物ij的相关信息储存至信息储存模块ij;投入物ij所在的从源头到投入物ij的产业支链根据生产流程分为多个生产模块ijm,投入物ijm的相关信息存储至信息存储模块ijm。该方法工作量小、溯源效率高,多级嵌套,溯源范围广,模块分级,责任明确。

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