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公开(公告)号：CN116973599A
公开(公告)日：2023-10-31
申请号：CN202310870148.X
申请日：2023-07-14
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明提供一种面向序列切片电镜图像的超薄切片厚度估计方法及装置，涉及计算机视觉技术领域，该方法包括：获取序列切片的电镜图像；针对任意两个相邻切片的电镜图像，对任意两个相邻切片的电镜图像进行全局对齐；将全局对齐后的任意两个相邻切片的电镜图像输入第一神经网络模型，得到任意两个相邻切片的电镜图像之间的形变场；提取形变场的形变数据特征；将形变数据特征输入第二神经网络模型，得到任意两个相邻切片所对应的厚度估计结果；其中，第一神经网络模型是基于样本相邻切片的电镜图像，以及用于对图像施加形变场的空间变换网络训练得到的；第二神经网络模型是基于带有厚度标签的样本形变数据特征训练得到的。
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公开(公告)号：CN112381817B
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN202011374986.0
申请日：2020-11-30
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于电镜显微成像和图像处理领域，具体涉及一种扫描电镜透射模式与透射电镜联用的病毒快速检测系统、方法、装置，旨在解决现有基于透射电镜的病毒检测操作复杂、成像效率以及检测准确率低的问题。本系统包括样品获取模块，配置为获取待检测的病毒标本，并将其滴在带有支持膜的铜网上；扫描电镜成像模块，配置为得到扫描电镜透射图像；像素位置获取模块，配置为获取各病毒颗粒以及其对应的铜网方格的顶点在图像中的像素位置；变换矩阵计算模块，配置为计算从图像像素位置映射到透射电镜物理坐标的透射变换矩阵；形态结构检测模块，配置为得到每个病毒颗粒的形态结构。本发明简化了检测操作，并提高了成像效率以及检测的准确率。
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公开(公告)号：CN109283679B
公开(公告)日：2020-05-19
申请号：CN201811213274.3
申请日：2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种大视场光学显微图像成像装置及方法，两个光学显微成像通路分别用于获取成像物体和参照标板的光学显微图像，利用第二成像通路获取的参照标板的光学显微图像计算对应位置的第一成像通路获取成像物体的光学显微图像的像素坐标，合成所述成像物体的大视场显微图像；能够形成鲁棒的大视场光学显微图像的快速成像能力，其成像结果的正确性和实时性不受成像物体表面形貌特征和所选择的成像模态影响，满足生命科学等领域对不同模态下物体的大视场快速光学显微成像需求。
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公开(公告)号：CN110887685A
公开(公告)日：2020-03-17
申请号：CN201811053101.X
申请日：2018-09-10
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于实验器械领域，具体提供一种超薄切片机及其刀台。本发明旨在解决现有的超薄切片机切出的切片行程较短，无法满足科研需求的问题。为此，本发明的刀台包括与超薄切片机的底座固定连接的刀台底座、与所述刀台底座滑动连接的刀台本体、设置在所述刀台本体上的压电陶瓷片和与所述刀台本体相连接的刀架。其中，压电陶瓷片通电时能够产生1mm的形变量，并且压电陶瓷片通电时能够驱动刀架及安装在刀架上的刀具向样品臂移动，并切割样品臂上的样品。本发明具有上述刀台的超薄切片机切割出的切片能够达到1mm，满足科研人员的需求。
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公开(公告)号：CN106373116B
公开(公告)日：2019-04-12
申请号：CN201610716189.3
申请日：2016-08-24
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于双光子图像的突触检测方法，其涉及模式识别和神经学技术领域。其中，该方法包括获取所述双光子图像；将所述双光子图像分为轴突图像和树突图像；在所述轴突图像中进行轴突小结的2D检测；在所述树突图像中进行树突棘的2D检测；用检测到的轴突小结和树突棘进行2D突触检测；基于2D突触检测结果，进行3D突触检测。通过本发明，提高了检测突触的效率和精度，还具有普适性，且对图像类型不敏感。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109283679A
公开(公告)日：2019-01-29
申请号：CN201811213274.3
申请日：2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种大视场光学显微图像成像装置及方法，两个光学显微成像通路分别用于获取成像物体和参照标板的光学显微图像，利用第二成像通路获取的参照标板的光学显微图像计算对应位置的第一成像通路获取成像物体的光学显微图像的像素坐标，合成所述成像物体的大视场显微图像；能够形成鲁棒的大视场光学显微图像的快速成像能力，其成像结果的正确性和实时性不受成像物体表面形貌特征和所选择的成像模态影响，满足生命科学等领域对不同模态下物体的大视场快速光学显微成像需求。
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公开(公告)号：CN118408794A
公开(公告)日：2024-07-30
申请号：CN202410235012.6
申请日：2024-03-01
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明提供了一种生物组织切片图像获取方法、系统、设备和存储介质，其中方法包括：获取生物组织样品的切片序列，将切片序列中的多个生物组织切片作为各初始生物组织切片，执行真空环境下的图像获取流程；在图像获取流程中，采集各初始生物组织切片的表面图像，对各初始生物组织切片进行减薄处理，并测量减薄处理后的各生物组织切片的切片厚度；将减薄处理后的各生物组织切片作为各初始生物组织切片执行图像获取流程，直至减薄处理后的生物组织切片的切片厚度小于等于第一厚度阈值，得到各次减薄处理后的各生物组织切片的表面图像；克服了目前图像采集效率低下，样品易被污染的缺陷，提高了图像获取效率，降低了样品被污染的风险。
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公开(公告)号：CN112381718B
公开(公告)日：2021-07-30
申请号：CN202011328722.1
申请日：2020-11-24
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于计算机视觉和图像处理技术领域，具体涉及了一种基于仿射变换的显微序列图像自动拼接方法、系统及装置，旨在解决现有技术无法有效解决显微图像拍摄过程中的图像变形对拼接的影响，拼接误差会出现累积和传播，因而拼接效果达不到预期的问题。本发明包括：提取显微序列图像重叠区域的特征并进行特征匹配；根据特征在图像上的位置信息，赋予每对特征点不同的权重；通过仿射变换模型拟合相邻图像间的变化，并设定全局优化的能量函数；最小化能量函数，获得各相邻图像的仿射变换关系；根据仿射变换关系进行拼接获得显微拼接图像。本发明通过全局拼接的方法，避免拼接过程中误差累积和图像边缘畸变对结果的影响，能够获得较高拼接精度的图像。
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公开(公告)号：CN109584368B
公开(公告)日：2021-05-28
申请号：CN201811213305.5
申请日：2018-10-18
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明涉及一种生物样品三维结构的构建方法及装置，所述方法包括，获取至少两个生物样品薄片的三维图像；修正所述薄片的三维图像表面生成三维图像块；将所述三维图像块拆分为二维序列图像，并根据所述至少两个生物样品薄片的位置排列所述二维序列图像；计算所述二维序列图像的图像变形位置坐标，确定所述生物样品的三维结构。本发明能够有效处理序列薄片的不规则形变和表面不平整，并将序列薄片的三维图像在三维空间中联接起来，实现对大体量生物样品的高分辨率整体三维结构构建。
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公开(公告)号：CN112381718A
公开(公告)日：2021-02-19
申请号：CN202011328722.1
申请日：2020-11-24
Applicant: 中国科学院自动化研究所
Abstract: 本发明属于计算机视觉和图像处理技术领域，具体涉及了一种基于仿射变换的显微序列图像自动拼接方法、系统及装置，旨在解决现有技术无法有效解决显微图像拍摄过程中的图像变形对拼接的影响，拼接误差会出现累积和传播，因而拼接效果达不到预期的问题。本发明包括：提取显微序列图像重叠区域的特征并进行特征匹配；根据特征在图像上的位置信息，赋予每对特征点不同的权重；通过仿射变换模型拟合相邻图像间的变化，并设定全局优化的能量函数；最小化能量函数，获得各相邻图像的仿射变换关系；根据仿射变换关系进行拼接获得显微拼接图像。本发明通过全局拼接的方法，避免拼接过程中误差累积和图像边缘畸变对结果的影响，能够获得较高拼接精度的图像。
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