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公开(公告)号：CN110964838B
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN202010006026.2
申请日：2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种快速检测绵羊LRRFIP1基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以绵羊血样全基因组DNA为模板，利用一对特异引物扩增绵羊LRRFIP1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性引物扩增绵羊ANKRD1基因部分片段作为对照，然后利用2*2‑ΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型，基于绵羊LRRFIP1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立茶卡羊等地方绵羊品种的遗传资源优势种群，有利于加快茶卡羊等的分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN112831576A
公开(公告)日：2021-05-25
申请号：CN202110343708.7
申请日：2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 刘贤 , 柴亚楠 , 李克丽 , 牛梦晓 , 乔小玉 , 郑中华 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛DYNC1I2基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及专用试剂盒，以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛DYNC1I2基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体DYNC1I2基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据DYNC1I2基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。
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公开(公告)号：CN111172295A
公开(公告)日：2020-05-19
申请号：CN202010117701.9
申请日：2020-02-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法及专用试剂盒：以黄牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增黄牛VAMP7基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段，根据2*2-ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定黄牛VAMP7基因的拷贝数变异类型。与云岭牛、夏南牛、皮南牛和郏县红牛生产数据的关联分析显示，正常型个体的十字部高显著高于插入型和正常型个体。本发明通过在DNA水平上检测与云岭牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN112831576B
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202110343708.7
申请日：2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 刘贤 , 柴亚楠 , 李克丽 , 牛梦晓 , 乔小玉 , 郑中华 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛DYNC1I2基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及专用试剂盒，以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛DYNC1I2基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体DYNC1I2基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据DYNC1I2基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。
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公开(公告)号：CN110964839B
公开(公告)日：2022-11-08
申请号：CN202010006820.7
申请日：2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种SERPINA3‑1基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其应用。该方法基于实时荧光定量PCR，以黄牛基因组DNA为模板，扩增黄牛SERPINA3‑1基因的拷贝数变异区域及内参基因BTF3基因的部分片段，运用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。基于黄牛SERPINA3‑1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立种质资源优良的黄牛种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111394474B
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN202010213959.9
申请日：2020-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛GAL3ST1基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以黄牛(例如，秦川牛)基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增黄牛GAL3ST1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性PCR引物扩增黄牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，最后利用2*2‑ΔΔCt的方法对定量结果进行计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在秦川牛GAL3ST1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN113151501A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110513334.9
申请日：2021-05-11
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 张家强 , 刘贤 , 张子敬 , 柴亚楠 , 李欣淼 , 杜蕾 , 李利娟 , 杨国杰 , 李志明 , 吕世杰 , 陈付英 , 施巧婷 , 王二耀 , 胡沈荣 , 茹宝瑞 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛WBP1L基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增WBP1L基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参，最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于WBP1L基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN111647649A
公开(公告)日：2020-09-11
申请号：CN202010612786.8
申请日：2020-06-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种基于CCDC39基因CNV检测辅助选择黄牛生长性状的方法：以黄牛基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR，利用一对特异性引物扩增CCDC39基因的拷贝数变异区域的部分片段，同时利用另外一对特异性引物扩增BTF3基因部分片段作为参考，根据2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。与黄牛生长数据的关联分析显示，所检测的CCDC39基因拷贝数变异对黄牛的体重有显著影响，其中缺失型个体的体重显著高于正常型和多拷贝型个体。本发明提供的方法有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作的进行。
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公开(公告)号：CN111394474A
公开(公告)日：2020-07-10
申请号：CN202010213959.9
申请日：2020-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛GAL3ST1基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以黄牛(例如，秦川牛)基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增黄牛GAL3ST1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性PCR引物扩增黄牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，最后利用2*2-ΔΔCt的方法对定量结果进行计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在秦川牛GAL3ST1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN111088327A
公开(公告)日：2020-05-01
申请号：CN202010006023.9
申请日：2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用：以黄牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增SIKE1基因CNV区域和内参基因BTF3的部分片段，根据定量结果并通过计算log22-ΔΔCt鉴定个体SIKE1基因的拷贝数变异类型。基于SIKE1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，本发明提供的方法可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快云岭牛等的分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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