木瓜功能着丝粒抗原多肽及其应用

    公开(公告)号:CN105399805B

    公开(公告)日:2019-04-02

    申请号:CN201510950638.6

    申请日:2015-12-19

    Abstract: 本发明提供了木瓜功能着丝粒抗原多肽及其应用,木瓜功能着丝粒组蛋白CENH3,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,根据该序列编码的氨基酸序列的N端的一段特异序列合成了一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体,进行了该抗体的免疫荧光实验。本发明的木瓜CENH3蛋白的抗体可用于木瓜功能着丝粒位置的细胞学定位,也能应用在与木瓜的染色质免疫沉淀技术相结合的测序(ChIP‑seq)上面,能够确定木瓜染色体上功能着丝粒的位置和大小以及序列信息,使得其物理图谱信息更加全面,并且能在木瓜基因组的组装方面提供着丝粒方面的信息。

    割手密反转录转座子序列及其鉴定方法

    公开(公告)号:CN110184267B

    公开(公告)日:2022-06-21

    申请号:CN201910479046.9

    申请日:2019-06-04

    Abstract: 本发明公开了割手密反转录转座子序列及其鉴定方法,利用割手密和热带种基因组数据聚类分析,筛选出4条割手密反转录转座子序列,根据该序列分别设计引物扩增获得其全长序列,然后制备成探针,在割手密和热带种的中期染色体上进行荧光原位杂交(FISH)鉴定,结果显示,这4条反转录转座子序列均仅在割手密染色体上产生清晰明亮的信号,本发明的反转录转座子序列可直接用于特异识别割手密染色体,为甘蔗栽培品种中割手密血缘鉴定提供更加准确的信息,也将为甘蔗染色体工程育种奠定基础。

    甘蔗属割手密特异序列及其鉴定方法

    公开(公告)号:CN110205329B

    公开(公告)日:2021-04-06

    申请号:CN201910533250.4

    申请日:2019-06-19

    Inventor: 王凯 刀乙航

    Abstract: 本发明提供了甘蔗割手密特异序列及其分子标记,利用软件blast将甘蔗热带种LA Purple与割手密AP85‑441的DNA序列进行对比,得到6条割手密特异DNA序列,根据这6条序列分别设计引物,并用CTAB法提取2个热带种和15个割手密的基因组DNA,并用6对引物分别对基因组DNA进行PCR扩增,结果显示,这6对引物能够区分出热带种与割手密,且条带清晰明亮,本发明有利于甘蔗杂交品种鉴定研究。

    一种多引物oligo探针的制备方法

    公开(公告)号:CN110205357A

    公开(公告)日:2019-09-06

    申请号:CN201910545475.1

    申请日:2019-06-22

    Inventor: 王凯 孟状

    Abstract: 本发明公开了一种多引物oligo探针的制备方法,利用生物信息学途径设计oligo序列,根据其在基因组的位置划分为独立探针,在所有探针的oligo序列的5’端加上相同引物序列F1,不同探针的oligo序列的3’端加上不同的引物序列(R1-R8)用以探针的扩增和区分,通过人工合成可一次制备8个不同的单链oligo探针。该方法可将一个oligo探针序列库拆分为8个探针,消除了oligo探针库无法拆分的弊端,本发明的多引物oligo探针制备方法提高了FISH技术在更为精细的植物分子细胞遗传学研究中的应用能力,有助于FISH技术的进一步发展。

    菠萝功能着丝粒抗原多肽及其应用

    公开(公告)号:CN105418740B

    公开(公告)日:2019-03-12

    申请号:CN201510950637.1

    申请日:2015-12-19

    Abstract: 本发明提供了菠萝功能着丝粒抗原多肽及其应用,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,根据该氨基酸序列的N端的一段特异序列合成一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体,进行该抗体的免疫荧光实验,本发明的菠萝CENH3蛋白的抗体可用于菠萝功能着丝粒位置的细胞学定位,也能应用在与菠萝的染色质免疫沉淀技术相结合的测序(ChIP‑seq)上面,确定菠萝染色体上功能着丝粒的位置和大小以及序列信息,开展着丝粒基因组遗传图谱与物理图谱的定位,为着丝粒形成与功能行使机制的研究及其人工染色体的构建提供重要的工具和信息。

    二穗短柄草功能着丝粒抗原多肽及应用

    公开(公告)号:CN105461789A

    公开(公告)日:2016-04-06

    申请号:CN201510950636.7

    申请日:2015-12-19

    CPC classification number: C07K14/415 C07K16/06 C07K16/16

    Abstract: 本发明提供一种二穗短柄草功能着丝粒组蛋白CENH3及应用。首先利用生物信息学序列比对的方法预测得到二穗短柄草CENH3蛋白基因的核苷酸序列,根据该序列编码的氨基酸序列N端的一段特异序列合成一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体。该CENH3抗体可用于免疫染色实验,进行着丝粒的物理定位,亦可用于染色质免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)实验,获得二穗短柄草功能着丝粒功能DNA序列,开展着丝粒基因组遗传图谱与物理图谱的定位,为着丝粒形成与功能行使机制的研究及其人工染色体的构建提供重要的工具和信息。

    菠萝功能着丝粒抗原多肽及其应用

    公开(公告)号:CN105418740A

    公开(公告)日:2016-03-23

    申请号:CN201510950637.1

    申请日:2015-12-19

    CPC classification number: C07K14/415 C07K16/06 C07K16/16

    Abstract: 本发明提供了菠萝功能着丝粒抗原多肽及其应用,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,根据该氨基酸序列的N端的一段特异序列合成一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体,进行该抗体的免疫荧光实验,本发明的菠萝CENH3蛋白的抗体可用于菠萝功能着丝粒位置的细胞学定位,也能应用在与菠萝的染色质免疫沉淀技术相结合的测序(ChIP-seq)上面,确定菠萝染色体上功能着丝粒的位置和大小以及序列信息,开展着丝粒基因组遗传图谱与物理图谱的定位,为着丝粒形成与功能行使机制的研究及其人工染色体的构建提供重要的工具和信息。

    木瓜功能着丝粒抗原多肽及其应用

    公开(公告)号:CN105399805A

    公开(公告)日:2016-03-16

    申请号:CN201510950638.6

    申请日:2015-12-19

    CPC classification number: C07K14/415 C07K16/06 C07K16/16

    Abstract: 本发明提供了木瓜功能着丝粒抗原多肽及其应用,木瓜功能着丝粒组蛋白CENH3,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,根据该序列编码的氨基酸序列的N端的一段特异序列合成了一条多肽,用该多肽常规免疫新西兰大白兔,制备抗血清,经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白的抗体,进行了该抗体的免疫荧光实验。本发明的木瓜CENH3蛋白的抗体可用于木瓜功能着丝粒位置的细胞学定位,也能应用在与木瓜的染色质免疫沉淀技术相结合的测序(ChIP-seq)上面,能够确定木瓜染色体上功能着丝粒的位置和大小以及序列信息,使得其物理图谱信息更加全面,并且能在木瓜基因组的组装方面提供着丝粒方面的信息。

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