一种精确测量稻属植物种子落粒性的方法

    公开(公告)号:CN106872274B

    公开(公告)日:2020-07-28

    申请号:CN201710179408.3

    申请日:2017-03-23

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于环境生物安全检测技术领域,具体为一种精确测量稻属植物种子落粒性的方法。本发明方法,建立了精确测量稻属植物种子落粒所需承受平均拉力的方法和将测量的拉力值转换成种子落粒性指数的数学模型;即:通过使用数字显示拉力计对稻属植物单粒种子脱落所需承受拉力进行精确测量,并计算出所有测量的种子落粒所需承受的拉力平均值,根据数学模型将平均值转换为种子落粒性指数(SHI),SHI值越大表明该植物种子落粒性越强,反之,SHI值越小则表明该植物种子落粒性越弱。本发明能够准确、客观地测量不同稻属植物的种子落粒程度,为科研和育种中准确筛选不同落粒性的水稻品种提供技术支撑,同时也为转基因漂移到稻属野生近缘种通过种子介导的转基因扩散分析提供有效检测方法。

    利用SH4基因沉默降低栽培稻与杂草稻杂交后代种子落粒性的方法

    公开(公告)号:CN107090469A

    公开(公告)日:2017-08-25

    申请号:CN201710179407.9

    申请日:2017-03-23

    Applicant: 复旦大学

    CPC classification number: C07K14/415 C12N15/8218 C12N15/8261

    Abstract: 本发明属于生物环境安全检测技术领域,具体为一种利用SH4基因沉默降低栽培稻与杂草稻杂交后代种子落粒性的方法。本发明通过基因沉默技术使栽培稻的落粒基因(SH4)功能丧失,含SH4基因沉默元件的栽培稻转基因一旦通过基因漂移转移到杂草稻群体,由于种子落粒性下降,将降低转基因扩散的风险;同时,包含该SH4基因沉默元件的杂草稻群体的种子落粒性和扩散能力将大大下降,从而可以通过栽培稻向杂草稻的基因漂移,将该落粒性降低的性状转移到杂草稻群体,达到控制杂草稻群体扩散,降低杂草稻危害的目的。本发明能够极大降低转基因逃逸到杂草稻之后可能导致的环境安全风险,降低杂草稻扩散和危害,避免经济损失,具有广阔应用前景。

    一种精确测量稻属植物种子落粒性的方法

    公开(公告)号:CN106872274A

    公开(公告)日:2017-06-20

    申请号:CN201710179408.3

    申请日:2017-03-23

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于环境生物安全检测技术领域,具体为一种精确测量稻属植物种子落粒性的方法。本发明方法,建立了精确测量稻属植物种子落粒所需承受平均拉力的方法和将测量的拉力值转换成种子落粒性指数的数学模型;即:通过使用数字显示拉力计对稻属植物单粒种子脱落所需承受拉力进行精确测量,并计算出所有测量的种子落粒所需承受的拉力平均值,根据数学模型将平均值转换为种子落粒性指数(SHI),SHI值越大表明该植物种子落粒性越强,反之,SHI值越小则表明该植物种子落粒性越弱。本发明能够准确、客观地测量不同稻属植物的种子落粒程度,为科研和育种中准确筛选不同落粒性的水稻品种提供技术支撑,同时也为转基因漂移到稻属野生近缘种通过种子介导的转基因扩散分析提供有效检测方法。

    一种基因逃逸的检测方法
    14.
    发明公开

    公开(公告)号:CN103858684A

    公开(公告)日:2014-06-18

    申请号:CN201210535890.7

    申请日:2012-12-12

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属环境生物安全检测技术领域,涉及一种基因逃逸的检测方法,本发明以栽培稻、杂草稻和野生稻群体为分析材料,利用罩笼条件,分别在无靶标害虫虫压和高虫压环境中进行种植,并对各群体的适合度性状进行测量,分别计算各群体的平均复合适合度值,通过比较分析杂草稻或野生稻群体与栽培稻平均复合适合度值的差异,预测转基因逃逸后带来的环境风险及其程度。本发明不使用转基因植株检测和分析转基因带来的适合度差异及其潜在环境风险,检测结果可靠,不存在因对转基因的管理不善导致的环境风险,有利于转基因栽培稻商品化生产的环境安全评价。

    一种利用InDel分子标记预测籼-粳稻杂种F1结实率的方法

    公开(公告)号:CN103798127A

    公开(公告)日:2014-05-21

    申请号:CN201410034373.0

    申请日:2014-01-24

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于分子标记辅助育种技术领域,具体为一种利用InDel分子标记检测籼-粳稻杂交亲本遗传分化水平并以其预测杂种F1结实率的方法。通过检测籼-粳杂交亲本的遗传分化水平,就可以有目的的选择杂交亲本并配制具有较高结实率的F1杂种。本发明利用40个InDel分子标记和建立的计算方法,确定了籼-粳杂交双亲的籼-粳遗传分化系数(GDI),同时分析杂交双亲GDI和实测杂种F1结实率(PF)平均值之间的相关性,形成了一种通过分子标记分析双亲GDI来预测籼-粳稻杂种F1结实率的方法。本发明在实施杂交之前就可对亲本进行籼-粳遗传分化系数检测,进而预测杂种F1的结实率,从而有效的选择籼-粳稻杂交双亲。

    利用SH4基因沉默降低栽培稻与杂草稻杂交后代种子落粒性的方法

    公开(公告)号:CN107090469B

    公开(公告)日:2021-06-22

    申请号:CN201710179407.9

    申请日:2017-03-23

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于生物环境安全检测技术领域,具体为一种利用SH4基因沉默降低栽培稻与杂草稻杂交后代种子落粒性的方法。本发明通过基因沉默技术使栽培稻的落粒基因(SH4)功能丧失,含SH4基因沉默元件的栽培稻转基因一旦通过基因漂移转移到杂草稻群体,由于种子落粒性下降,将降低转基因扩散的风险;同时,包含该SH4基因沉默元件的杂草稻群体的种子落粒性和扩散能力将大大下降,从而可以通过栽培稻向杂草稻的基因漂移,将该落粒性降低的性状转移到杂草稻群体,达到控制杂草稻群体扩散,降低杂草稻危害的目的。本发明能够极大降低转基因逃逸到杂草稻之后可能导致的环境安全风险,降低杂草稻扩散和危害,避免经济损失,具有广阔应用前景。

    一种建立转基因漂移环境安全检测的比较杂种群体取样方法

    公开(公告)号:CN108796034B

    公开(公告)日:2021-04-30

    申请号:CN201810658289.4

    申请日:2018-06-25

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于转基因生物环境风险评估技术领域。具体为一种建立转基因漂移环境安全检测的比较杂种群体取样方法。本发明方法利用来自作物中的转基因和一个来自该作物相同染色体但距离该转基因很近而且没有物理连锁的中性分子标记进行取样,分别构建包含转基因或不包含该转基因的杂种后代分离实验群体,使这两个群体的遗传背景无限接近,再通过对这两个群体在同质园的环境条件下进行适合度相关性状分析比较,从而准确预测和评价通过天然杂交进入作物野生近缘种的转基因是否会导致环境风险。本发明方法大大降低了由于取样而导致的比较群体(P+和P‑)之间等位基因偏分离的差异以及遗传背景不一致现象,使转基因生物安全评价的结果更接近真实情况。

    一种设置选择压模拟抗虫转基因漂移环境风险的检测方法

    公开(公告)号:CN106093367A

    公开(公告)日:2016-11-09

    申请号:CN201610425285.2

    申请日:2016-06-15

    Applicant: 复旦大学

    CPC classification number: G01N33/5097 A01C1/025 G01N33/5008 G01N33/5082

    Abstract: 本发明属于环境生物安全检测技术领域,具体为一种设置选择压模拟抗虫转基因漂移环境风险的检测方法。本发明通过人工设置选择压,检测、计算和分析在不同靶标害虫危害水平的环境下,栽培稻群体与野生近缘种群体平均复合适合度变化的差值比,计算出环境风险指数,以此来模拟检测栽培稻抗虫转基因漂移带来的环境风险及风险程度。本发明在整个受控田间实验过程中,不向环境释放任何抗虫转基因栽培稻,不会出现导致环境风险的情况。通过罩笼受控实验,获得栽培稻和野生近缘种群体在不同靶标害虫选择压环境条件下的适合度数据,分析和模拟抗虫转基因漂移后带来的生态风险及其程度。本发明为抗虫栽培稻转基因漂移导致的环境安全评价提供了重要科学依据和更为安全的评价方法。

    一种水稻抗除草剂转基因逃逸导致环境风险的检测评价方法

    公开(公告)号:CN103563739B

    公开(公告)日:2015-12-09

    申请号:CN201310590335.9

    申请日:2013-11-22

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于转基因环境生物安全检测分析技术领域,具体为一种水稻抗除草剂转基因逃逸导致环境风险的检测评价方法。本发明利用人工修饰EPSP合成酶抗除草剂转基因水稻和非转基因水稻及其野生稻近缘种群体为分析材料,进行人工杂交,建立含有epsps转基因和不含该转基因的杂种F1群体以及含该转基因和不含该转基因的F2分离代实验群体;将这些实验群体分别在有草甘膦和无草甘膦的环境下进行不同方式种植,并对5个适合度相关性状进行测量。通过计算转基因对群体带来的复合适合度指数,检测抗除草剂转基因逃逸对野生近缘种带来的环境风险。本发明检测结果准确,效率高,对于抗除草剂转基因水稻生产的环境安全保证具有良好的应用前景。

    用一粒稻谷鉴定籼稻和粳稻的分子标记方法

    公开(公告)号:CN102031253B

    公开(公告)日:2013-06-12

    申请号:CN201010591787.5

    申请日:2010-12-16

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于生物类型鉴别技术领域,具体为一种利用一粒稻谷(或稻米)和插入或缺失(InDel)分子标记来鉴定籼稻和粳稻的方法。本发明从一粒稻谷中提取DNA,利用籼稻93-11和粳稻日本晴的全基因组DNA序列对比而获得的40对特异InDel引物,对水稻种子中提取的DNA进行片段扩增、电泳分离以及电泳图谱的分析来鉴定该水稻样本的籼、粳稻特性。具体而言,以一粒稻谷中提取的DNA为模板,利用40对InDel引物组合,基于聚合酶链式反应和琼脂糖电泳获得的分子指纹图谱进行分析和统计,根据样本40个InDel位点上的93-11基因型和日本晴基因型分子指纹计算出的基因频率(Fi或Fj),确定被测水稻种子(样品)的籼稻或粳稻特性。本发明仅需检测一粒种子的样品便可获得结果,方法简便快捷,鉴定准确,具有良好的推广应用前景。

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