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公开(公告)号：CN113512556A
公开(公告)日：2021-10-19
申请号：CN202110652691.3
申请日：2021-06-11
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种与β‑紫罗兰酮合成相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶基因及其编码蛋白和应用，该基因的核苷酸序列如序列表Seq ID No:1所示，该编码蛋白的氨基酸序列如序列表Seq ID No:2所示，本发明的与β‑紫罗兰酮合成相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶基因通过基因工程技术裂解β‑胡萝卜素形成β‑紫罗兰酮，提高辣椒β‑紫罗兰酮的含量进而改善辣椒的风味，提高辣椒的经济价值。
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公开(公告)号：CN110423766B
公开(公告)日：2021-06-29
申请号：CN201910808553.2
申请日：2019-08-29
Applicant: 南京大学
Abstract: 一种番茄红素β‑环化酶基因及其编码蛋白和应用，它涉及一种PyLCYB蛋白及其编码基因在紫菜类胡萝卜素代谢中的应用。本发明的基因的核苷酸序列如序列表Seq ID No：1所示或与序列表SEQ ID NO:1核苷酸序列具有80％以上同源性且编码相同功能蛋白质的多核苷酸序列。它的氨基酸序列如序列表Seq ID No：2所示或由序列表Seq ID No：2所述的氨基酸序列经过一个或者几个氨基酸残基的取代、缺失或者添加且具有与序列表Seq ID No：2所述的氨基酸残基序列相同活性的氨基酸序列。它用于紫菜类胡萝卜素代谢基因工程中。
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公开(公告)号：CN110484550A
公开(公告)日：2019-11-22
申请号：CN201910789701.0
申请日：2019-08-26
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种类胡萝卜素代谢基因功能鉴定方法，包括以下步骤：S1：克隆筛选标记元件：从pGBK-T7载体中克隆了由Ampr启动子驱动的卡那霉素抗性基因Kanr，以此元件(pAmpr::Kanr)作为后续的筛选标记；S2：克隆启动子：克隆了蓝细菌集胞藻Synechocystis sp.PCC6803中的RuBisCO大亚基基因(rbcL)的启动子序列，该启动子用于驱动待检测的酶基因；S3：酶基因的克隆：来自不同生物的待鉴定类胡萝卜素代谢相关酶基因X克隆于rbcL启动子的下游(rbcL::X)，由该启动子驱动；S4:表达盒的构建：一个完整的基因表达盒包括依次排列的一个pAmpr::Kanr筛选标记元件以及一个用于表达酶蛋白的rbcL::X元件。与传统鉴定方法相比，本方法具有更加简便、直接的优势，可以明确而有针对性地对基因功能进行鉴定。
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公开(公告)号：CN110423766A
公开(公告)日：2019-11-08
申请号：CN201910808553.2
申请日：2019-08-29
Applicant: 南京大学
Abstract: 一种番茄红素β-环化酶基因及其编码蛋白和应用，它涉及一种PyLCYB蛋白及其编码基因在紫菜类胡萝卜素代谢中的应用。本发明的基因的核苷酸序列如序列表Seq ID No：1所示或与序列表SEQ ID NO:1核苷酸序列具有80％以上同源性且编码相同功能蛋白质的多核苷酸序列。它的氨基酸序列如序列表Seq ID No：2所示或由序列表Seq ID No：2所述的氨基酸序列经过一个或者几个氨基酸残基的取代、缺失或者添加且具有与序列表Seq ID No：2所述的氨基酸残基序列相同活性的氨基酸序列。它用于紫菜类胡萝卜素代谢基因工程中。
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公开(公告)号：CN101921774B
公开(公告)日：2012-05-02
申请号：CN201010180453.9
申请日：2010-05-24
Applicant: 南京大学
IPC: C12N15/29 , C12N15/113 , C07K14/415 , A01H5/00
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域，具体涉及一种拟南芥DnaJ-like蛋白及其编码基因在植物抵抗干旱、低温以及外源脱落酸等非生物胁迫过程中的应用。拟南芥DnaJ-like蛋白基因是下列核苷酸序列之一：1)序列表中SEQ ID №：1的DNA序列；2)编码序列表中SEQ ID №：2蛋白质的多核苷酸；3)与序列表中SEQ ID№：1限定的DNA序列具有80％以上同源性，且编码相同功能蛋白质的DNA序列。本发明所述拟南芥DnaJ-like蛋白是具有序列表中SEQ ID №：2氨基酸残基序列的蛋白质，或者是将SEQ ID №：2的氨基酸经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与SEQ ID №：2的氨基酸序列相同活性的由SEQ ID №：2衍生的蛋白质。本发明所述基因对植物的耐旱、耐脱落酸等耐逆性及相关性状的改良有重要的意义。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117143881A
公开(公告)日：2023-12-01
申请号：CN202210571648.9
申请日：2022-05-24
Applicant: 南京大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明发现了一个调节植物对干旱胁迫耐受性的新蛋白，具体涉及水稻基因DSF1(Os03g17140)及其编码蛋白质在培育水稻耐旱新品种方面的应用。该基因对水稻干旱胁迫处理存在明显响应，可调控水稻对干旱胁迫的耐受性。本发明通过对DSF1基因启动子序列分析发现，该基因启动子序列含有三个植物激素脱落酸(abscisic acid，ABA)响应元件ABRE，说明该基因可能参与ABA信号通路从而调控水稻对非生物胁迫的响应，在水稻抗逆方面具有很大的潜在应用价值。发明人通过CRISPR/Cas9技术对水稻基因DSF1功能进行沉默，发现突变体提高了水稻对干旱胁迫的耐受性。通过将水稻中DSF1基因功能沉默，可以获得水稻耐旱转基因新品种，本发明为培育抗旱转基因作物新品种提供了理论基础。
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公开(公告)号：CN104109656A
公开(公告)日：2014-10-22
申请号：CN201410330875.8
申请日：2014-07-11
Applicant: 南京大学
CPC classification number: C12N9/0073 , C12N15/70 , C12Y114/1309
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域，具体涉及一种依赖大肠杆菌发酵生产堇菜黄素的方法。本发明通过原核表达系统表达可溶重组拟南芥玉米黄素环氧化酶的方法，克服了直接从植物组织中分离纯化该蛋白的困难，降低了应用成本。本发明利用遗传背景清晰、安全无毒的分子克隆常用菌种作为发酵菌种，通过基因工程转化重组载体、诱导蛋白可溶表达直至发酵生产堇菜黄素，成本低廉，易于实行，发酵直接获得的堇菜黄素就具有较高的纯度，可应用于食品工业、保健品行业，以及作为高纯度的化合物标准品等科研领域。
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公开(公告)号：CN112786109B
公开(公告)日：2024-04-16
申请号：CN202110069693.X
申请日：2021-01-19
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种基因组完成图的基因组组装方法，首先使用高保真测序数据(HiFi)进行基因组组装，生成重叠群、重叠群路径、边信息和重叠信息；将重叠群锚定在参考基因组的染色体上，得到锚定结果；将重叠群路径按照的锚定结果连接成染色体路径；对于每条染色体，按照重叠群在染色体路径的位置在字符串图上遍历每个重叠群，并为每一对重叠群之间的缺口寻找最短路径并填补缺口。本发明实现了高保真测序(HiFi)的无缺口动植物基因组组装完成图，并且完成图准确性高、质量好。
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公开(公告)号：CN113215181A
公开(公告)日：2021-08-06
申请号：CN202110653530.6
申请日：2021-06-11
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种与α‑紫罗兰酮合成相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶基因及其编码蛋白和应用，该基因的核苷酸序列如序列表Seq ID No:1所示。该基因的氨基酸序列如序列表SeqID No:2所示。本发明的与α‑紫罗兰酮合成相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶基因通过基因工程技术裂解ε‑胡萝卜素形成α‑紫罗兰酮，提高辣椒α‑紫罗兰酮的含量进而改善辣椒的风味，提高辣椒的经济价值。
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公开(公告)号：CN112786109A
公开(公告)日：2021-05-11
申请号：CN202110069693.X
申请日：2021-01-19
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种基因组完成图的基因组组装方法，首先使用高保真测序数据(HiFi)进行基因组组装，生成重叠群、重叠群路径、边信息和重叠信息；将重叠群锚定在参考基因组的染色体上，得到锚定结果；将重叠群路径按照的锚定结果连接成染色体路径；对于每条染色体，按照重叠群在染色体路径的位置在字符串图上遍历每个重叠群，并为每一对重叠群之间的缺口寻找最短路径并填补缺口。本发明实现了高保真测序(HiFi)的无缺口动植物基因组组装完成图，并且完成图准确性高、质量好。
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