公开(公告)号：CN106636433A

公开(公告)日：2017-05-10

申请号：CN201710064068.X

申请日：2017-01-24

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 刘吉平 ,  刘希 ,  陈杰湖 ,  刘伟强 ,  黄志君

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  C40B50/06 ,  G06F19/22 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明公开了一种桑葚病原菌高通量鉴定及种属分类的方法。本发明通过收集桑葚病果；提取桑葚病果的总DNA；Illumina DNA文库构建；Illumina高通量测序；去除测序数据中桑树基因组序列；组装微生物基因组序列；组装完整核糖体DNA序列；筛选标记微生物核糖体DNA序列；对比分析核糖体DNA序列进行种属分类，实现对桑树病原菌的鉴定及种属分类。结果显示，运用本发明方法对桑葚菌核病病原菌进行鉴定及种属分类，共鉴定出3种真菌，其中相对丰度最高的为Ciboria属病原菌，据此确定桑肥大性菌核病病原菌为Ciboria，并根据比对结果，确定其为Ciboria carunculoides；该属大多数为植物病原菌，可导致植物的果实、种子出现僵化、膨大等症状，与研究的桑葚菌核病的病征相符合。

公开(公告)号：CN107794262B

公开(公告)日：2021-02-19

申请号：CN201710064069.4

申请日：2017-01-24

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 刘吉平 ,  刘希

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/06 ,  C40B50/06 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明首次公开了一种桑树黑斑病病原菌Pseudocercospora mori的核糖体RNA的全长cDNA序列及其应用。Pseudocercospora mori的核糖体RNA的全长cDNA序列如SEQ.ID.NO1所示，其分段cDNA序列如SEQ.ID.NO2所示，其序列上包含的2对引物序列如SEQ.ID.NO3所示。本发明将Pseudocercospora mori的核糖体RNA的cDNA序列应用于检测Pseudocercospora mori菌中，可同时得到定性及定量的结果。结果显示，在对桑树黑斑病病叶上真菌的研究中，相对丰度最高真菌的为Pseudocercospora属病原菌。此外，Pseudocercospora mori的核糖体RNA的cDNA序列可应用于真菌种属分类方面的研究中。

公开(公告)号：CN106636433B

公开(公告)日：2020-04-14

申请号：CN201710064068.X

申请日：2017-01-24

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 刘吉平 ,  刘希 ,  陈杰湖 ,  刘伟强 ,  黄志君

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/04 ,  C40B50/06 ,  G16B30/10 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明公开了一种桑葚病原菌高通量鉴定及种属分类的方法。本发明通过收集桑葚病果；提取桑葚病果的总DNA；Illumina DNA文库构建；Illumina高通量测序；去除测序数据中桑树基因组序列；组装微生物基因组序列；组装完整核糖体DNA序列；筛选标记微生物核糖体DNA序列；对比分析核糖体DNA序列进行种属分类，实现对桑树病原菌的鉴定及种属分类。结果显示，运用本发明方法对桑葚菌核病病原菌进行鉴定及种属分类，共鉴定出3种真菌，其中相对丰度最高的为Ciboria属病原菌，据此确定桑肥大性菌核病病原菌为Ciboria，并根据比对结果，确定其为Ciboria carunculoides；该属大多数为植物病原菌，可导致植物的果实、种子出现僵化、膨大等症状，与研究的桑葚菌核病的病征相符合。

公开(公告)号：CN107164471A

公开(公告)日：2017-09-15

申请号：CN201710354083.8

申请日：2017-05-18

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 刘吉平 ,  刘健霞 ,  陈杰湖 ,  李香霖 ,  何青 ,  李峙贤 ,  刘希 ,  吕思行 ,  米红霞

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明公开了一组快速鉴别中药材僵蚕中白僵菌真伪的引物组以及分子鉴定方法。所述引物组序列分别如SEQ ID NO.1～2所示。本发明在完成对广东株白僵菌线粒体全基因组序列的高通量测序和多个虫草科物种的线粒体全基因组生物信息学比较分析的基础上，比较白僵菌线粒体基因序列在地理种属上的差异，发现白僵菌的核糖体蛋白基因rps3变异明显；并基于此设计筛选得到了1对能特异检测白僵菌的引物，建立了高效、快速鉴别中药材僵蚕中白僵菌真伪的分子鉴定方法，方法简便快速、特异性好，灵敏度高，且适用性广，可实现对不同产地僵蚕中白僵菌真伪的鉴别；为中药材僵蚕的质量标准化和规范化以及临床用药安全提供了技术支持。

公开(公告)号：CN107034284A

公开(公告)日：2017-08-11

申请号：CN201710340558.8

申请日：2017-05-15

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 刘吉平 ,  刘希 ,  严宋洋

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6895

Abstract: 本发明公开了桑生球针壳ITS序列及其在桑生球针壳分子检测中的应用。并设计了三对特异性的快速检测桑生球针壳的引物组。所述引物组为1B1877F/1B2291R，2B1802F/2B2303R，3B1808F/3B2347R，核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2～7所示，可特异地检测桑生球针壳菌，尤其是引物组2B1802F/2B2303R，检测结果可靠、易于操作、特异性强、灵敏度高，尤其是对于处于侵染早期（潜育期）的病叶的检测，而且可以桑叶、枝条、土壤等多种样本为检测对象，具有重要的实际应用意义。