一种快速鉴定和评价植物内参基因适用性的方法

    公开(公告)号:CN103882142A

    公开(公告)日:2014-06-25

    申请号:CN201410138424.4

    申请日:2014-04-08

    CPC classification number: C12Q1/6851 C12Q2531/113 C12Q2545/101 C12Q2563/107

    Abstract: 本发明公开了一种快速鉴定和评价植物内参基因适用性的方法,包括如下步骤:(1)确定目标植物种类和目标基因,提取目标植物的总RNA,反转录为cDNA作为PCR的为模板,选择多个内参基因,设计特异性引物进行实时荧光定量PCR反应得到CT值;(2)将所述CT值数据通过geNorm、NormFinder、BestKeeper三种软件分析其适用性,用R软件的RankAggreg程序包,将每个处理里得到的四组适用性排序数据进行加权平均聚合,得到所述多个基因的最终适用性排序。本发明所述方法对于推动揭示植物生长发育、抗逆机理等基础性研究和培育速生、抗逆、丰产的植物新品种等应用型研究具有十分重要的意义。

    一种快速鉴定和评价植物内参基因适用性的方法

    公开(公告)号:CN103882142B

    公开(公告)日:2016-04-20

    申请号:CN201410138424.4

    申请日:2014-04-08

    Abstract: 本发明公开了一种快速鉴定和评价植物内参基因适用性的方法,包括如下步骤:(1)确定目标植物种类和目标基因,提取目标植物的总RNA,反转录为cDNA作为PCR的为模板,选择多个内参基因,设计特异性引物进行实时荧光定量PCR反应得到CT值;(2)将所述CT值数据通过geNorm、NormFinder、BestKeeper三种软件分析其适用性,用R软件的RankAggreg程序包,将每个处理里得到的四组适用性排序数据进行加权平均聚合,得到所述多个基因的最终适用性排序。本发明所述方法对于推动揭示植物生长发育、抗逆机理等基础性研究和培育速生、抗逆、丰产的植物新品种等应用型研究具有十分重要的意义。

    一种使用多内参基因组合研究胡杨基因的方法

    公开(公告)号:CN103898223A

    公开(公告)日:2014-07-02

    申请号:CN201410138911.0

    申请日:2014-04-08

    CPC classification number: C12Q1/686 C12Q2545/101 C12Q2563/107

    Abstract: 本发明公开了一种使用多内参基因组合研究胡杨基因的方法,包括如下步骤:(1)提取胡杨的总RNA,反转录为cDNA,作为PCR的模板;(2)使用大于等于9个内参基因,设计特异性引物在实时荧光定量PCR仪上选择SYBR?Green法进行反应,得到CT值;(3)通过公式和geNorm软件的PV值计算功能,以0.15为阈值确定内参基因的数目;(4)根据所需数目选择内参基因,和目的基因一起进行qRT-PCR反应,将得到的CT值通过geNorm软件,计算得到目的基因在每个处理下用多内参基因组合得到相对表达量的变化数据。本发明所述方法与传统的单一内参基因方法相比,能够得到更为可靠的结论。

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