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公开(公告)号:CN103500293A
公开(公告)日:2014-01-08
申请号:CN201310400300.4
申请日:2013-09-05
Applicant: 北京工业大学
IPC: G06F19/22
Abstract: 一种非核糖体蛋白质-RNA复合物近天然结构的筛选方法,属于蛋白质-RNA分子对接复合物结构预测领域。首先,通过构象搜索获得蛋白质-RNA各种可能的结合模式;然后,对其合理性进行评价,其间综合考虑了蛋白质-RNA分子间的静电和范德华相互作用能,以及复合物界面上氨基酸-核苷酸成对偏好势。各项的权重是通过采用线性回归的方法,来对对接结构的配体均方根偏差和其能量项的加权组合值进行拟合得到的;最后,根据分值从小到大进行排序,从而判断近天然结构。该方法在非核糖体蛋白质-RNA分子对接近天然结构的筛选中有很好的效果,成功率较高,可用于该类蛋白质-RNA复合物结构预测领域,为分子改造和设计提供重要的依据。
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公开(公告)号:CN101984041B
公开(公告)日:2013-05-22
申请号:CN201010532101.5
申请日:2010-10-29
Applicant: 北京工业大学
IPC: C12M1/26
CPC classification number: C12M33/04
Abstract: 本发明公开了一种喷雾式微生物液体样品分布装置,包括气囊(1)、吸管(3)和喷雾管(5),这三者依次紧密相连并可拆卸,吸管上设有刻度(4),喷雾管(5)末端的喷雾头(6)设有数个均匀分布的液体分配孔,吸管(3)的近气囊端填有棉花塞(2),喷雾管(5)末端与近吸管端呈90°角。本发明以喷雾方式将含有微生物的液体样品均匀分布于固体培养平板表面,避免了用涂布棒于固体培养平板表面涂布微生物样品过程中出现的涂布棒冷却不充分导致微生物被烫死、涂布效果差等问题,结构简单、成本低、操作简便,耗时短。
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公开(公告)号:CN103091384A
公开(公告)日:2013-05-08
申请号:CN201210581393.0
申请日:2012-12-27
Applicant: 北京工业大学
IPC: G01N27/447
Abstract: 预装式琼脂糖凝胶电泳上样缓冲液及使用方法,属于琼脂糖凝胶电泳技术领域。该缓冲液包括数滴滴状浓缩上样缓冲液、塑封、封舌,塑封由低密度聚乙烯塑料对折紧密粘合而成,每滴滴状浓缩上样缓冲液均匀注入密封在塑封折缝处,数滴滴状浓缩上样缓冲液均匀分散地密封在塑封折缝处,在塑封边缘设有封舌。使用时根据计算将核酸样品吸入移液器,调节移液器使其吸入量增大一滴缓冲液的体积,然后吸入一滴缓冲液,达到混合均匀的目的并上样。本发明进行上样,无需反复量取浓缩上样缓冲液,操作简单易学,省时省力。
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公开(公告)号:CN102851378A
公开(公告)日:2013-01-02
申请号:CN201210345219.6
申请日:2012-09-17
Applicant: 北京工业大学
Abstract: 本发明涉及一种HIV-1整合酶链转移反应抑制剂体外筛选方法,属于生物技术领域。该方法是用异硫氰酸荧光素(FITC)基团标记靶DNA,通过检测FITC基团的荧光信号来对整合酶的链转移反应活性或待测样品的抑制活性进行评价。现有的HIV-1整合酶链转移反应抑制剂体外筛选方法整个过程至少需要约4h,而本发明方法可将整个筛选过程缩短至2h以内,同时大大降低了筛选成本。
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公开(公告)号:CN101665473A
公开(公告)日:2010-03-10
申请号:CN200910093639.8
申请日:2009-09-25
Applicant: 北京工业大学
IPC: C07D295/182 , A61K31/445 , A61P31/18
Abstract: 本发明涉及通式(I)表示的(E)-N-3-(4-取代苯丙烯基哌嗪-1-基)烷基苯甲酰胺化合物或其盐,其中,R 1 、R 2 、R 3 表示-H、-OH、-ONa、-OK或-ONH 4 ,R 4 、R 5 表示-H、卤素、C 1-3 直链或支链烷基、-OH、-ONa、-OK、-ONH 4 、-NO 2 或-CN,n为1-3的整数。本发明还涉及该化合物的制备方法,该方法是以多取代苯甲酰氯与氯代烷基氨的盐酸盐为原料合成多烷氧基苯甲酰氯代烷基胺,该化合物与哌嗪反应制取中间体N-哌嗪基烷基多取代苯甲酰胺,再同取代苯丙烯酰氯反应制取(E)-N-(3-(4-取代苯丙烯酰基哌嗪-1-基)烷基苯甲酰胺,接着与BBr 3 或BF 3 乙醚溶液的作用后进一步水解,生成相应的(E)-N-(4-取代苯丙烯酰基哌嗪-1-基)烷基多羟基苯甲酰胺化合物,再同碱反应生成相应的盐。本发明化合物对HIV-1整合酶具有抑制作用。
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公开(公告)号:CN103500293B
公开(公告)日:2017-07-14
申请号:CN201310400300.4
申请日:2013-09-05
Applicant: 北京工业大学
IPC: G06F19/22
Abstract: 一种非核糖体蛋白质‑RNA复合物近天然结构的筛选方法,属于蛋白质‑RNA分子对接复合物结构预测领域。首先,通过构象搜索获得蛋白质‑RNA各种可能的结合模式;然后,对其合理性进行评价,其间综合考虑了蛋白质‑RNA分子间的静电和范德华相互作用能,以及复合物界面上氨基酸‑核苷酸成对偏好势。各项的权重是通过采用线性回归的方法,来对对接结构的配体均方根偏差和其能量项的加权组合值进行拟合得到的;最后,根据分值从小到大进行排序,从而判断近天然结构。该方法在非核糖体蛋白质‑RNA分子对接近天然结构的筛选中有很好的效果,成功率较高,可用于该类蛋白质‑RNA复合物结构预测领域,为分子改造和设计提供重要的依据。
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公开(公告)号:CN103275945B
公开(公告)日:2015-03-04
申请号:CN201310188288.5
申请日:2013-05-20
Applicant: 北京工业大学
Abstract: 可溶性HIV-1整合酶重组蛋白的制备方法,属于生物技术领域。制备方法包括诱导表达、菌体破碎、纯化等步骤,所用表达培养基含有15-35g/L胰蛋白胨,10-20g/L酵母提取物,2-3g/L氯化钠,1g/L葡萄糖,10-15g/L甘油,2.05g/L磷酸氢二钠,1.27g/L磷酸二氢钠,50mg/L硫酸镁,60mg/L卡那霉素,所用裂解缓冲液含有20mM 4-羟乙基哌嗪乙磺酸,1M氯化钠,2mM β-巯基乙醇,0.3mg/ml溶菌酶,5mM咪唑,pH 值为9.0。表达培养基可保证宿主菌的正常生长和目的蛋白的高效表达,裂解缓冲液可加强菌体的破碎效果,增加目的蛋白的可溶性,最终提高目的蛋白的产率。
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公开(公告)号:CN102839113B
公开(公告)日:2014-01-01
申请号:CN201210337444.5
申请日:2012-09-12
Applicant: 北京工业大学
IPC: C12M1/00
Abstract: 一种可调宽度式快速切胶装置,属于生命科学实验器材领域。其包括外刃、内刃、外刃手柄、内刃手柄、固定箍、调节旋钮、齿轮、齿轮槽组成。使用时,根据待回收DNA条带的宽度,用调节旋钮调整外刃与内刃之间的距离,使之与待回收DNA条带的宽度相匹配;然后将外刃与内刃对准待回收DNA条带,手持手柄垂直切入琼脂糖凝胶中,即可一次性切下含有待回收DNA条带的凝胶。使用本发明的装置进行切胶,操作简单,整个过程仅需数秒钟,可缩短待回收DNA暴露于紫外线中的时间,降低待回收DNA的变异机率。
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公开(公告)号:CN103245659A
公开(公告)日:2013-08-14
申请号:CN201310148798.X
申请日:2013-04-25
Applicant: 北京工业大学
IPC: G01N21/78
Abstract: 一种吸管式蛋白质快速检测器及使用方法,属于生命科学实验技术领域。由依次连接的橡胶吸球、管体、储液池、反应池、吸头、橡胶封组成;其中,橡胶吸球紧密套在管体上,考马斯亮蓝G-250染液注满于储液池中,橡胶封紧密封住吸头的顶端。使用时,拔掉橡胶封,挤压橡胶吸球,将考马斯亮蓝G-250染液挤出储液池直至考马斯亮蓝G-250染液被挤至吸头顶端,将吸头移入待测样品溶液中并缓慢放松橡胶吸球以吸入待测样品溶液;待考马斯亮蓝G-250染液与待测样品溶液充满反应池时,根据混合液的颜色变化对待测样品溶液中是否含有蛋白质进行初步判断,如果混合液的颜色由灰棕色变为蓝色,则待测样品溶液中含有蛋白质,否则不含有蛋白质。
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公开(公告)号:CN102154262B
公开(公告)日:2013-02-13
申请号:CN201010607470.6
申请日:2010-12-27
Applicant: 北京工业大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种DNA胶回收电泳加样方法,涉及DNA胶回收应用领域。该方法是将待回收的DNA样品加样于长2.5毫米,宽0.75毫米的小孔琼脂糖凝胶的若干相邻加样孔中,而不是加样于长14.5毫米,宽2毫米的大孔琼脂糖凝胶的加样孔中。使用本发明方法,电泳后的目的条带的分布面积比加样于大孔琼脂糖凝胶电泳后的目的条带的分布面积更小,仅为后者的25%-55%,有利于后续的切胶和回收操作。
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